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[热点] 退学或坚持读 难忘2018 2026-02-04 刚刚
[Gromacs ] [已完结]求助：关于焓变的计算，大家能提供点思路吗? (1/617) zhongyunxia 2012-02-20 2014-09-21 08:33:52 by 蠢蠢欲动
[Gromacs ] [已完结][关贴]请教！关于Gromacs计算分子内两个官能团之间距离的问题 (0/908) wungung 2014-09-19 2014-09-19 14:17:49 by wungung
[Gromacs ] [已完结]amber12跑动力学文件中断ptraj提取crd文件求助！！！ (1/311) ssn319227 2014-09-04 2014-09-18 19:16:38 by ssn319227
[Gromacs ] [已完结]gromacs 极化力场 (0/1196) 七喜小志 2014-09-18 2014-09-18 11:18:55 by 七喜小志
[Gromacs ] [已完结]awk脚本怎么调用啊 (2/354) yylcx 2014-09-09 2014-09-17 16:48:23 by yylcx
[Gromacs ] [已完结]我想用一个软件实现肽链和一个烷基侧链的链接    ( 1 2 3 ) (24/1252) xxj9618 2014-09-09 2014-09-17 16:40:36 by fanc232
[Gromacs ] [已完结]g romacs 计算氢键求助 (0/593) xxj9618 2014-09-17 2014-09-17 16:25:29 by xxj9618
[Gromacs ] [已完结]pdb2gmx出错 (0/991) xxj9618 2014-09-17 2014-09-17 13:56:33 by xxj9618
[Gromacs ] 55555 这个是怎么了 (2/381) 郭嘉945 2014-09-14 2014-09-16 12:06:59 by 郭嘉945
[Gromacs ] [已完结]PRODRG转化生成小分子itp文件    ( 1 2 ) (评阅+1) (11/2180) _蝶飞 2014-01-13 2014-09-16 06:18:29 by _蝶飞
[Gromacs ] [已完结]make_ndx命令的使用 (0/3028) _蝶飞 2014-09-15 2014-09-15 16:54:26 by _蝶飞
[Gromacs ] [已完结]怎么计算电偶极矩与外电场之间的夹角？ (0/1583) 花无刺 2014-09-14 2014-09-14 21:27:19 by 花无刺
[Gromacs ] 【讨论】在创建钾离子通道蛋白四聚体时出现问题 (评阅+1) (5/1467) nufang19a 2010-11-10 2014-09-11 08:01:16 by shenchun11
[Gromacs ] [已完结]pdb库中的rmsf实验数值在哪儿 (3/586) keke_1210 2014-09-04 2014-09-10 16:52:56 by fanc232
[Gromacs ] [已完结]高分急求！用gromacs进行动力学模拟，从结果文件中可以提取到哪些热力学数据呢？ (评阅+1) (3/843) 蠢蠢欲动 2014-08-18 2014-09-09 19:59:13 by 蠢蠢欲动
[Gromacs ] [已完结]NAMD分子模拟 (0/394) xslhd0808 2014-09-09 2014-09-09 13:06:00 by xslhd0808
[Gromacs ] [已完结]用antechamber建小分子力场时出问题 (0/303) dxl20132009 2014-09-09 2014-09-09 11:27:36 by dxl20132009
[Gromacs ] [已完结]如何得到氧化镍(NiO)的itp文件？ (0/255) pei小f 2014-09-09 2014-09-09 10:02:45 by pei小f
[Gromacs ] gromacs中epsilon的单位 (1/1537) yechao258 2014-09-04 2014-09-09 08:55:45 by whl2dxl
[Gromacs ] [已完结]Windows版charmm软件 (0/1237) 568286346 2014-09-08 2014-09-08 22:31:56 by 568286346
[Gromacs ] RMSD收敛判断 (评阅+1) (4/1329) ArthurFSun 2014-07-25 2014-09-05 11:21:03 by ssn319227
[Gromacs ] [已完结]关于amber中PBSA能量分解的一个小问题 (0/513) szhshuan 2014-09-04 2014-09-04 15:08:39 by szhshuan
[Gromacs ] [已完结]求助：如何NAMD的psf 文件转化成Gromacs的top文件 (1/1069) yechao258 2014-09-03 2014-09-04 10:38:28 by rocksliu
[Gromacs ] [已完结]Gromacs如何根据已有力场进行修改创建新力场？ (0/1125) fish637 2014-08-27 2014-08-27 11:19:00 by fish637
[Gromacs ] [已完结]环己烷在gromacs中的gromos45a3力场中的itp文件怎么写？    ( 1 2 ) (评阅+1) (12/2553) xwwjd 2014-05-06 2014-08-27 08:36:40 by fish637
[Gromacs ] [已完结]跪求 Cu5 Cu13团簇的 坐标信息 用于做pdb文件 (1/547) 依然在锅里 2014-08-26 2014-08-26 22:44:21 by 戴世杰
[Gromacs ] gromacs 膜动力学 (2/458) zhuimeng08 2014-08-22 2014-08-26 14:05:09 by zhuimeng08
[Gromacs ] [已完结]Gaussian与Gromacs联用 (0/896) stevenkkk 2014-08-23 2014-08-23 15:26:40 by stevenkkk
[Gromacs ] [已完结]求教，如何进行多聚体的同源建模？？？ (评阅+1) (2/1806) zhangmao511 2014-08-22 2014-08-22 11:37:05 by zhangmao511
[Gromacs ] [已完结]利用Gromacs在做纯溶剂的md.mdp时，有一个关于温度耦合的设定没有明白，求指点！ (1/1356) wuyoung 2014-08-21 2014-08-22 10:14:11 by fangsteel
[Gromacs ] [已完结]多个.pmf文件怎么整合 (评阅+1) (2/624) 小兵ai石头 2014-06-06 2014-08-21 18:04:27 by ruthxu
[Gromacs ] [已完结]我已经装了gromacs,但为什么这个grompp运行不了 (评阅+1) (4/966) dkgmx 2013-12-04 2014-08-21 12:41:56 by tone鹅
[Gromacs ] [已完结]Gromacs里关于设定水盒子形状的问题？？ (评阅+1) (7/2797) zhangmao511 2014-06-09 2014-08-21 12:33:05 by tone鹅
[Gromacs ] [已完结]利用NAMD做分子模拟 (1/582) soso----瘦瘦 2014-08-15 2014-08-21 11:13:21 by 塞外寒梅
[Gromacs ] [已完结]求教：gromacs配体+水的MD (0/370) wei12267 2014-08-20 2014-08-20 20:09:13 by wei12267
[Gromacs ] [已完结][关贴]急求！gromacs做sampling时出现的错误！ (2/629) 上官若轩 2014-08-20 2014-08-20 11:12:10 by 上官若轩
[Gromacs ] [已完结]g_lie 能量计算讨论 (0/364) wei12267 2014-08-19 2014-08-19 16:17:51 by wei12267
[Gromacs ] [已完结]amber 终端输入 xleap 遇到问题 (评阅+2) (2/2137) lifeisall 2014-01-17 2014-08-19 01:33:33 by 凛冬将至
[Gromacs ] [已完结]ABF计算出错 (1/959) 77585218358 2011-06-20 2014-08-15 12:30:08 by 塞外寒梅
[Gromacs ] [已完结]用PRODRG转化小分子问题 (2/473) _蝶飞 2014-08-12 2014-08-15 10:56:27 by _蝶飞
[Gromacs ] [已完结]关于使用gromacs计算蛋白质中每个氨基酸的RMSD值随时间的变化 (评阅+1) (5/1840) 转基因猴子 2014-08-10 2014-08-12 09:18:36 by 转基因猴子
[Gromacs ] 【求助】namd 出错Periodic cell has become too small for original patch grid!    ( 1 2 ) (10/3028) 574384607 2010-08-10 2014-08-05 07:55:03 by ruthxu
[Gromacs ] [已完结][关贴]NAMD跨膜环肽管求助，Periodic cell has become too small for original patch grid! (评阅+5) (7/1515) yylcx 2013-11-09 2014-08-05 07:54:18 by ruthxu
[Gromacs ] 【求助】用NAMD 做NPT模拟遇到下面的问题 (评阅+1) (10/2293) kevin8871 2010-11-28 2014-08-05 07:53:53 by ruthxu
[Gromacs ] [已完结]新老版本gcc共存，如何设置让GROMACS调用新版gcc？ (评阅+1) (7/1622) xiaowandouer 2014-07-29 2014-08-03 15:11:51 by abdoman
[Gromacs ] 【求助】Linux 下NAMD的单机版怎么安装？ (6/1463) 我为量化狂 2010-08-09 2014-08-02 15:23:51 by JimKarrey
[Gromacs ] [已完结]进行动力学模拟之后氨基酸残疾发生了改变 (5/1178) wangyan10 2012-01-06 2014-07-28 12:35:00 by therotyonth
[Gromacs ] [已完结]分子动力学开始瞬间，整个体系突然缩小 (评阅+1) (5/831) 我爱问路 2014-07-27 2014-07-27 20:48:49 by 我爱问路
[Gromacs ] [已完结][关贴]求助Amber14软件！！！ (评阅+1) (1/646) 左转单车 2014-07-24 2014-07-27 18:16:08 by 克罗米虎
[Gromacs ] [已完结]Amber中 五配位的Zn(2+)和六配位的Mg(2+)的参数 (5/931) 月亮弯弯0219 2012-04-19 2014-07-27 16:24:37 by therotyonth
[Gromacs ] [已完结]请教如何进行三聚体的蛋白分子对接？ (评阅+1) (2/682) zhangmao511 2014-07-16 2014-07-26 23:31:32 by zhangmao511
[Gromacs ] [已完结][关贴]gromacs软件中grompp命令运行出现警告 (1/3277) 十年磨练 2014-07-25 2014-07-25 11:12:30 by fangsteel
[Gromacs ] RMSD，RMSF和RMSDF是如何理解的 (评阅+1) (3/3210) 夏天的鱼 2014-07-24 2014-07-24 12:49:37 by smutao
[Gromacs ] [已完结]如何使用gromacs进行多分子模拟？ (7/2553) yumipxd 2012-06-13 2014-07-24 12:41:07 by fish637
[Gromacs ] [已完结]amber原子类型不识别的问题，求教！~~ (评阅+1) (0/865) moye1991 2014-07-23 2014-07-23 14:16:21 by moye1991
[Gromacs ] 如何用pdb的格式的文件生成psf的格式的文件 (评阅+1) (7/2339) zhuimeng08 2014-07-03 2014-07-22 12:46:43 by zhuimeng08
[Gromacs ] [已完结]Gromacs g_energy参数详解 (评阅+1) (1/2497) jianchen7882 2014-07-01 2014-07-22 11:35:52 by explorer2250
[Gromacs ] [已完结]gromacs如何添加compass力场 (评阅+1) (1/1683) 是_非 2014-07-03 2014-07-22 11:32:54 by explorer2250
[Gromacs ] [已完结]大家交流一下水盒子大小 (评阅+1) (1/2797) yulilan 2014-07-21 2014-07-22 11:25:15 by explorer2250
[Gromacs ] [已完结]动力学模拟水分子跑散了怎么办？水盒子严重变形，出现空洞。 (8/4061) haoguoyu 2013-06-06 2014-07-21 12:15:28 by CQU_wjq
[Gromacs ] [已完结][关贴][提问] 用GPU跑动力学出错 (评阅+1) (9/2094) 小卷xujunli 2013-11-09 2014-07-17 08:36:54 by ssn319227
[Gromacs ] [已完结]Cmake安装完发现没有lib文件夹，这可咋整？ (评阅+1) (0/939) xiaowandouer 2014-07-16 2014-07-16 12:09:44 by xiaowandouer
[Gromacs ] 选择学习charmm还是amber呢？ (评阅+1) (10/2321) shadow004 2013-09-08 2014-07-12 22:50:09 by lrf1980
[Gromacs ] [已完结]Gromacs粗粒化模拟晶体生长应该如何建模和模拟？ (评阅+1) (1/1301) fish637 2014-07-10 2014-07-12 20:55:01 by fish637
[Gromacs ] [已完结]用GROMACS 做protein-protein complex的一些问题 (评阅+1) (4/865) 793003946 2014-01-28 2014-07-11 10:48:17 by yearzitian
[Gromacs ] [已完结]amber11安装出现问题 (评阅+1) (0/336) dxl20132009 2014-07-10 2014-07-10 12:44:43 by dxl20132009
[Gromacs ] [已完结]请问amber哪个tutorial里是讲ptraj的应用的？ (评阅+1) (1/603) lifeisall 2014-07-07 2014-07-10 08:41:24 by 紫漠残星
[Gromacs ] [已完结]amber12的安装问题 (评阅+1) (0/326) dxl20132009 2014-07-09 2014-07-09 20:53:37 by dxl20132009
[Gromacs ] 【求助】水盒子问题    ( 1 2 ) (17/2758) 574384607 2010-05-16 2014-07-09 20:36:03 by CQU_wjq
[Gromacs ] [已完结][关贴]amber11+openmpi多节点并行计算速度变慢 (1/1839) viger87 2012-05-12 2014-07-08 07:54:59 by viger87
[Gromacs ] [已完结]投稿期刊咨询 (评阅+1) (0/405) qiqiaofang 2014-07-07 2014-07-07 09:42:57 by qiqiaofang
[Gromacs ] [已完结]蛋白质CTER中两个氧原子异常接近 (评阅+1) (3/636) 我爱问路 2014-07-06 2014-07-07 00:16:05 by qianxiong
[Gromacs ] [已完结]如何用amber自带程序处理轨迹中由于周期性边界条件，溶剂水分子错乱镜像成键的问题？ (评阅+1) (2/2729) lifeisall 2014-07-02 2014-07-06 18:16:12 by lifeisall
[Gromacs ] [已完结]如何用gromacs算蛋白质内部残基之间的疏水相互作用 (评阅+1) (0/1985) qiqiaofang 2014-07-05 2014-07-05 09:25:11 by qiqiaofang
[Gromacs ] [已完结]Amber续跑问题 (评阅+1) (2/3383) lmyiop 2014-06-15 2014-07-04 15:26:52 by winterose_
[Gromacs ] [已完结]amber里可以调PH值吗 (评阅+1) (0/1334) dxl20132009 2014-07-03 2014-07-03 15:56:53 by dxl20132009
[Gromacs ] [已完结]30金求GROMACS中的甲醇的ITP文件 (评阅+1) (3/782) buctwmppx 2014-07-01 2014-07-02 22:00:14 by buctwmppx
[Gromacs ] [已完结]GROMCS中的g_dielectric命令 (评阅+1) (0/397) _蝶飞 2014-07-02 2014-07-02 14:22:18 by _蝶飞
[Gromacs ] [已完结]Gromacs计算甲醇溶剂体系，求过程中需要的甲醇分子.gro和.itp文件 (评阅+1) (0/798) caohao1988 2014-07-02 2014-07-02 11:15:52 by caohao1988
[Gromacs ] [已完结]Gromacs 做完拉伸分子动力学之后。计算能量 (评阅+1) (0/1185) jianchen7882 2014-07-01 2014-07-01 10:06:15 by jianchen7882
[Gromacs ] [已完结]amber跑动力学，晶体结构中的水能不能用限制力固定住 (8/1111) pujianbin 2014-06-28 2014-06-28 18:37:47 by beeMD
[Gromacs ] [已完结]Gromacs模拟温度耦合和压力耦合选择算法的问题，感谢！！！ (评阅+1) (4/2227) zhangmao511 2014-06-23 2014-06-27 16:41:12 by beeMD
[Gromacs ] [已完结]gromacs蛋白计算结束后老是跑出盒子    ( 1 2 ) (评阅+1) (19/4465) 转基因猴子 2014-04-01 2014-06-27 12:51:42 by huyingdamon
[Gromacs ] [已完结]如何将膜蛋白的中心轴选转至Z轴方向 (评阅+1) (0/520) benniu2004 2014-06-27 2014-06-27 11:54:56 by benniu2004
[Gromacs ] [已完结]用amber做DNA分子模拟 (评阅+1) (0/2054) dxl20132009 2014-06-24 2014-06-24 17:47:06 by dxl20132009
[Gromacs ] [已完结]amber中NAB这个模块怎么使用 (评阅+1) (0/577) dxl20132009 2014-06-24 2014-06-24 09:39:49 by dxl20132009
[Gromacs ] [已完结]小分子pdb格式用prodrg转化为top和gro格式求助 (评阅+1) (4/2083) s6120610021 2014-01-04 2014-06-24 08:19:34 by 赵红霞
[Gromacs ] [已完结]amber怎么处理模拟前的DNA    ( 1 2 ) (评阅+1) (10/2436) dxl20132009 2014-06-18 2014-06-22 23:38:21 by dxl20132009
[Gromacs ] [已完结]Gromacs关于能量最小化的问题！！！！！！！！ (评阅+1) (2/1465) zhangmao511 2014-06-13 2014-06-22 23:04:07 by zhangmao511
[Gromacs ] [已完结]蛋白质中存在非标准残基的话如何在Gromacs中生成力场 (评阅+1) (2/1628) little_lion 2014-06-18 2014-06-21 19:36:01 by zhangmao511
[Gromacs ] 【求助】demo运行不了？    ( 1 2 ) (12/1694) ansrang 2010-05-03 2014-06-21 09:16:24 by 赵红霞
[Gromacs ] [已完结]请教关于gromacs计算单个氨基酸残基与配体相互作用能的问题 (评阅+1) (5/2236) 870277182 2014-05-23 2014-06-20 22:41:01 by zlf9452006
[Gromacs ] [已完结]请问我这个体系是否需要进行自由能的计算？？？ (评阅+1) (4/1232) zhangmao511 2014-06-16 2014-06-18 14:53:19 by zhangmao511
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