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2025-06-03
2025-06-03 14:18:47
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春和~
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Gromacs
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有偿找专业人士计算分子动力学模拟
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mayiyi1234
2024-12-23
2025-05-29 14:17:42
by
压力脸大君
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Gromacs
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寻一名生信大神,教蛋白质模拟
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超级大苗圃
2025-03-19
2025-03-20 18:38:34
by
hiyesterday
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Gromacs
]
蛋白-小分子动力学模拟
15
(0/3541)
彼岸莫离
2025-03-07
2025-03-07 22:46:57
by
彼岸莫离
[
Gromacs
]
[已完结]
结构因子的计算问题
(5/4989)
congmingbing
2012-07-24
2025-01-09 13:48:12
by
鱼落晚歌1
[
Gromacs
]
[已完结]
amber 二硫键问题
(3/1952)
sunmuer
2012-03-05
2025-01-09 10:35:30
by
lpxmclt
[
Gromacs
]
请问跑1微秒的分子动力学模拟是自己按照GROMACS教程学还是用Colab上的程序?
(0/2591)
Felixzhuzhu
2024-12-21
2024-12-21 07:55:31
by
Felixzhuzhu
[
Gromacs
]
求助GROMACS,做蛋白小分子的动力学分析,看了官方教程,还是不会
(4/3578)
Felixzhuzhu
2024-12-15
2024-12-18 14:05:24
by
15923438923
[
Gromacs
]
gromacs中文教程
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tyhjqxbz
2011-08-23
2024-12-17 17:47:09
by
dl900204
[
Gromacs
]
采用Gromacs进行动力学模拟时,蛋白为两段的(且两段为必须的),模拟结果很奇怪
20
(0/2308)
luwangba
2024-12-06
2024-12-06 21:29:51
by
luwangba
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Gromacs
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Amber运行不了
(2/3493)
顺顺顺利毕业
2024-12-02
2024-12-03 15:25:49
by
顺顺顺利毕业
[
Gromacs
]
分子模拟教学一对一
(0/2527)
年少是青苔
2024-11-23
2024-11-23 12:44:59
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年少是青苔
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Gromacs
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gromacs中文版手册加标签
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2017-04-09
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我是不死小强
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Gromacs
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提问MD模拟中的LJ Energy和Coul Energy的区别
10
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Jerry__Yuan
2024-10-10
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Gromacs
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Amber、Gromacs学习心得
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pang04
2022-02-22
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summer君君
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Gromacs
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分子动力学(MD)模拟,模拟体系构建经验总结
(3/3046)
可爱草莓
2021-07-15
2024-09-17 17:49:51
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ljq775
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Gromacs
]
gromacs分子动力学模拟如何控制添加溶剂的比例
(10/905)
备安网公
2024-09-14
2024-09-14 21:40:20
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xxy928215
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Gromacs
]
直链淀粉分子模型如何构建
(0/876)
备安网公
2024-09-10
2024-09-10 19:28:04
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备安网公
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Gromacs
]
聚合物粗粒化建模,除了MS以外,还有哪些可用于粗粒化建模的软件或程序?
10
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whale13579
2024-04-30
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luyaobao
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组氨酸侧链异构
300
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我是莎莎啊
2024-08-19
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我是莎莎啊
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Gromacs
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gmx current导出的dsp求电导率的问题
20
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jlyjlysjd
2024-07-25
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jlyjlysjd
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Gromacs
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gromacs 按照教程进行MD模拟报错
(12/2309)
一只狗在
2022-04-08
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杨承璐
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Gromacs
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做MMPBSA出现NAN,该如何解决呢
20
(0/618)
luwangba
2024-06-19
2024-06-19 20:12:53
by
luwangba
[
Gromacs
]
求助gaussian输入文件如何设置单原子电荷
10
(2/949)
我想上岸gog
2024-05-13
2024-06-04 23:19:27
by
魏总1999
[
Gromacs
]
小分子与生长素受体蛋白分子对接
(33/974)
al代代
2024-05-08
2024-05-30 23:27:28
by
lsx19921130
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Gromacs
]
分子动力学中如何确定分子个数?
10
(2/1164)
jlyjlysjd
2024-04-25
2024-04-27 14:11:41
by
jlyjlysjd
[
Gromacs
]
求vmd vamd
5
(1/1111)
gejsngsj
2021-06-04
2024-04-18 08:06:32
by
scxryu
[
Gromacs
]
VMD生成的石墨烯pbd文件如何正确转化为psf
10
(5/1678)
ccc阿鑫
2024-03-08
2024-04-17 16:12:28
by
jiaoyixiong
[
Gromacs
]
分子动力学服务器怎么选?
(0/838)
专注做科研的
2024-03-28
2024-03-28 10:16:27
by
专注做科研的
[
Gromacs
]
cellulose builder 运行没反应。
5
(1/1554)
siliushui
2024-01-30
2024-03-26 10:10:49
by
hhcll
[
Gromacs
]
gromacs nsteps步数设置问他
10
(1/996)
luqing6879
2024-01-18
2024-01-27 20:29:54
by
stargood
[
Gromacs
]
分子模拟建模代做
(0/846)
年少是青苔
2024-01-20
2024-01-20 02:09:28
by
年少是青苔
[
Gromacs
]
gromas tip4p 水模型计算报错
10
(3/1073)
luqing6879
2024-01-16
2024-01-18 09:04:58
by
luqing6879
[
Gromacs
]
计算氢键百分比
20
(0/761)
万事顺意北
2024-01-09
2024-01-09 21:05:02
by
万事顺意北
[
Gromacs
]
分子动力学模拟教学求助?
20
(5/1941)
咖喱儿1
2023-09-27
2023-12-25 16:57:10
by
GYHandJXY
[
Gromacs
]
lammps混合MD/MC退火
2
(4/964)
m小咸鱼
2023-12-04
2023-12-09 21:47:04
by
miaojiabing
[
Gromacs
]
山东省生物物理重点实验室/德州学院 招聘蛋白/多肽分子动力学模拟方向研究人员/教师。
(2/1666)
zxcao
2022-07-15
2023-12-07 13:18:35
by
zxcao
[
Gromacs
]
多聚体蛋白质gromacs分子动力学模拟
5
(0/647)
LinL3
2023-11-26
2023-11-26 22:40:58
by
LinL3
[
Gromacs
]
分子动力学模拟(MD)GROMACS
(3/1409)
mudaidai
2023-03-22
2023-11-13 14:03:51
by
魔AA
[
Gromacs
]
请问有哪些参数可以表征分子链间产生滑移的难易程度
100
(0/552)
phaha
2023-11-06
2023-11-06 21:08:39
by
phaha
[
Gromacs
]
g_mmpbsa计算非极性物质的问题
20
(1/1081)
danghe24
2020-07-14
2023-08-26 09:04:11
by
我是莎莎啊
[
Gromacs
]
金属蛋白力场参数文件(NAMD)
5
(0/701)
王饭饭_
2023-07-14
2023-07-14 19:47:11
by
王饭饭_
[
Gromacs
]
电解液溶剂化结构模拟
(21/1070)
wubaolin1995
2023-04-02
2023-06-16 17:53:40
by
吴臻Wvz
[
Gromacs
]
氢键寿命的影响
20
(2/808)
珠江Pearl
2023-06-12
2023-06-12 20:39:38
by
珠江Pearl
[
Gromacs
]
VMD拉伸时蛋白质被拉出水盒
5
(2/778)
N_06yi
2023-04-28
2023-05-31 12:19:50
by
小城夜很美
[
Gromacs
]
2023年南京大学理论与计算化学暑期学校
(0/874)
guoxuehui
2023-05-23
2023-05-23 09:41:24
by
guoxuehui
[
Gromacs
]
gromacs复合物中生成拓扑错误
10
(1/666)
bracelon
2023-04-18
2023-04-20 13:51:30
by
中科小科虫
[
Gromacs
]
NAMD入门教程——win教程
(
1
2
3
4
5
6
..
7
)
(343/17206)
tyhjqxbz
2011-08-23
2023-03-27 19:09:25
by
changwenju
[
Gromacs
]
GROMACS
(2/888)
peng16llyy
2023-03-25
2023-03-27 17:36:42
by
jluchemlib
[
Gromacs
]
[已完结]
求助关于solvate的一些疑惑
(
1
2
)
(10/2856)
zhongshun
2012-07-01
2023-03-23 12:04:06
by
Mars_kang
[
Gromacs
]
关于martini粗粒化粒子的尺寸大小
20
(0/650)
Yolanda9288
2023-03-16
2023-03-16 18:08:09
by
Yolanda9288
[
Gromacs
]
[已完结]
聚合物的pdb文件生成psf文件用于NAMD动力学计算
(6/2083)
Andsharia
2015-12-17
2023-02-06 17:27:49
by
王饭饭_
[
Gromacs
]
利用NAMD模拟金属配合物在有机溶液中的作用经验
(1/701)
jin9090900
2016-03-31
2023-02-06 17:22:00
by
王饭饭_
[
Gromacs
]
【求助】如何生成聚乙烯的psf文件
(
1
2
)
(评阅+1)
(11/2045)
77585218358
2010-06-24
2023-02-06 17:16:23
by
王饭饭_
[
Gromacs
]
namd上生成psf文件时候拓扑文件操作失误,请前辈指点
5
(0/472)
王饭饭_
2023-02-06
2023-02-06 16:30:50
by
王饭饭_
[
Gromacs
]
金属离子
5
(0/533)
Hygeia云
2022-12-08
2022-12-08 12:50:41
by
Hygeia云
[
Gromacs
]
研究分子间作用力软件比较
5
(1/653)
zygxyfzxy
2022-12-04
2022-12-06 08:36:49
by
jiaoyixiong
[
Gromacs
]
获取pbd大分子蛋白质中的一部分
10
(0/497)
是郭奉孝呀
2022-11-21
2022-11-21 20:24:32
by
是郭奉孝呀
[
Gromacs
]
sander读取NetCDF格式rst文件失败
20
(2/1129)
fengrui826
2020-07-13
2022-11-18 17:41:59
by
Congcongi
[
Gromacs
]
关于分子模拟的各类计算需求,寻求有时间兼职的博士及高校老师
50
(6/300)
言榭竹昔
2021-01-18
2022-11-17 21:12:00
by
我是大个123
[
Gromacs
]
(CADD+AIDD+AMBER+GROMACS)学习
(0/802)
A小科研
2022-11-14
2022-11-14 16:21:02
by
A小科研
[
Gromacs
]
gromacs
(36/738)
??中路
2022-09-23
2022-11-14 16:18:09
by
A小科研
[
Gromacs
]
瑞典 林雪平大学 有机电子实验室招收2022/2023年全奖分子动力学模拟方向博士
85
(16/1198)
牧北
2022-10-22
2022-10-26 21:29:59
by
sct73
[
Gromacs
]
【转帖】【ZZ】使用xdrfile读取gromacs的trr和xtc文件
(7/4330)
zhuhongaaa
2010-05-12
2022-10-24 22:26:52
by
zxc6571026
[
Gromacs
]
如何使用GROMACS调用GPU计算分子动力学
30
(2/1337)
851086861
2022-08-19
2022-08-30 16:36:53
by
851086861
[
Gromacs
]
求助使用CGenFF生成JZ4拓扑时出现报错
5
(0/648)
成liang
2022-08-30
2022-08-30 15:33:03
by
成liang
[
Gromacs
]
高熵氧化物如何建模呢
5
(2/774)
1嫩嫩嫩1
2022-04-15
2022-08-18 06:47:23
by
lastnumber
[
Gromacs
]
[已完结]
求一个dssp的安装包
(3/994)
wxsj110
2017-08-14
2022-07-27 18:50:22
by
liliwo
[
Gromacs
]
含B元素化合物的MD模拟求助
66
(1/550)
ymwaizc
2022-07-26
2022-07-27 12:15:08
by
yongleli
[
Gromacs
]
gromacs
20
(0/498)
嘻哈小疯子
2022-07-23
2022-07-23 21:22:27
by
嘻哈小疯子
[
Gromacs
]
请问gromacs的msd命令是什么,怎么求扩散系数呀
5
(1/1131)
可可的奶茶
2022-07-18
2022-07-18 20:24:07
by
天天进步啊
[
Gromacs
]
[已完结]
求助有没有namd计算结果分析的例子。
(2/1665)
devil_lei
2016-12-25
2022-07-15 18:11:34
by
beyouraa
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs中出现语法错误
(1/1410)
xinji
2011-11-12
2022-07-15 11:25:11
by
kiki小吴
[
Gromacs
]
[已完结]
由于停电服务器中断后续跑出问题
(1/2147)
小清新王虫虫
2017-04-14
2022-07-14 21:30:49
by
liliwo
[
Gromacs
]
运行amber或namd所需电脑的最低配置
10
(0/573)
huangts123
2022-07-11
2022-07-11 16:54:00
by
huangts123
[
Gromacs
]
求助Gromacs计算服务器配置问题
20
(3/1022)
scx235
2022-03-03
2022-07-11 14:05:04
by
huangts123
[
Gromacs
]
gromacs学不会怎么办
(3/1088)
一只狗在
2022-03-28
2022-07-11 07:29:11
by
blue_cat
[
Gromacs
]
请教PCA分析
(2/851)
gougou720
2022-06-25
2022-06-26 07:01:50
by
gougou720
[
Gromacs
]
gromacs中的pdb2gmx
(8/591)
无需问详
2022-06-13
2022-06-13 17:30:24
by
莫落
[
Gromacs
]
结果分析中氢键如何选择
30
(0/582)
gougou720
2022-06-07
2022-06-07 18:30:59
by
gougou720
[
Gromacs
]
基于GAFF力场的原子类型指认
5
(1/1497)
bluejh
2020-12-01
2022-06-02 16:02:48
by
suncaiyun328
[
Gromacs
]
[已完结]
如何构建一个纯水盒子或者水球
(5/2780)
yoghurt117
2016-01-12
2022-05-14 13:14:34
by
是阿堇啊
[
Gromacs
]
GROMACS manual-4.5.4
(4/974)
792569257
2017-04-01
2022-05-12 16:50:17
by
一只狗在
[
Gromacs
]
有大佬可以指导一下吗
(1/665)
是欠欠啊
2022-04-21
2022-05-08 20:34:48
by
wgl0724
[
Gromacs
]
干马提尼
(20/647)
一只狗在
2022-05-05
2022-05-06 08:41:38
by
Edward-Lee
[
Gromacs
]
[已完结]
n2t文件
(2/933)
lclrabbit
2016-10-13
2022-04-22 15:08:31
by
是欠欠啊
[
Gromacs
]
复合膜的平衡模拟
(11/786)
一只狗在
2022-04-17
2022-04-17 18:38:02
by
cecust
[
Gromacs
]
求助
4
(11/677)
jayliu7
2022-03-20
2022-04-17 15:50:24
by
Haorancczu
[
Gromacs
]
电极表面分子的密度分布-动力学模拟
10
(0/623)
summer如歌
2022-04-08
2022-04-08 20:43:33
by
summer如歌
[
Gromacs
]
求助,gromacs的md的最后一步,总是有结构但是没有计算能量,不明白为啥,求高人指点
20
(0/659)
xzz1007
2022-03-29
2022-03-29 02:04:05
by
xzz1007
[
Gromacs
]
Gromacs(GPU加速,2020版),报错
5
(0/785)
ECUST-Wei
2022-02-28
2022-02-28 21:17:05
by
ECUST-Wei
[
Gromacs
]
NAMD实现局部调温功能
10
(1/821)
Cooperbe
2022-01-21
2022-02-28 16:42:17
by
kt_flash
[
Gromacs
]
[已完结]
请问如何利用VMD选择氧原子
(
1
2
)
(19/3104)
njut
2012-11-09
2022-02-28 13:49:22
by
kt_flash
[
Gromacs
]
NAMD做复合物分子动力学模拟的前处理
(2/1670)
lyyo
2018-05-29
2022-02-28 13:44:11
by
kt_flash
[
Gromacs
]
求助!求一份Amber20的安装包!
51
(4/2293)
492362591
2020-11-27
2022-02-28 13:32:53
by
王家小姐
[
Gromacs
]
为什么分子模拟里面很少有提到关于多糖的?
(
1
2
)
(评阅+1)
(12/2131)
Gina2013
2014-10-28
2022-02-18 18:23:37
by
幸运值爆棚
[
Gromacs
]
NAMD自学笔记:psf文件的生成以及conf文件的参数设定
(
1
2
)
(评阅+1)
(15/5526)
supertype
2014-05-06
2022-02-15 13:56:47
by
湛西
[
Gromacs
]
按照教程做好ubq.pgn文件后无法使用,求指教!
20
(0/620)
湛西
2022-02-12
2022-02-12 21:12:27
by
湛西
[
Gromacs
]
有谁知道,超分子组装,计算两个分子间结合能,下面这个公式对不对
(11/742)
Reek buddy
2022-01-19
2022-01-19 15:40:12
by
CCAUKEYAN
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