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请问跑1微秒的分子动力学模拟是自己按照GROMACS教程学还是用Colab上的程序?
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求助GROMACS,做蛋白小分子的动力学分析,看了官方教程,还是不会
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Felixzhuzhu
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采用Gromacs进行动力学模拟时,蛋白为两段的(且两段为必须的),模拟结果很奇怪
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Amber运行不了
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顺顺顺利毕业
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分子模拟教学一对一
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提问MD模拟中的LJ Energy和Coul Energy的区别
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分子动力学(MD)模拟,模拟体系构建经验总结
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聚合物粗粒化建模,除了MS以外,还有哪些可用于粗粒化建模的软件或程序?
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gmx current导出的dsp求电导率的问题
20
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gromacs 按照教程进行MD模拟报错
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做MMPBSA出现NAN,该如何解决呢
20
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luwangba
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求助gaussian输入文件如何设置单原子电荷
10
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小分子与生长素受体蛋白分子对接
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2024-05-08
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Gromacs
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分子动力学中如何确定分子个数?
10
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jlyjlysjd
2024-04-25
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jlyjlysjd
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Gromacs
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求vmd vamd
5
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2021-06-04
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scxryu
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Gromacs
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VMD生成的石墨烯pbd文件如何正确转化为psf
10
(5/1619)
ccc阿鑫
2024-03-08
2024-04-17 16:12:28
by
jiaoyixiong
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Gromacs
]
分子动力学服务器怎么选?
(0/812)
专注做科研的
2024-03-28
2024-03-28 10:16:27
by
专注做科研的
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Gromacs
]
cellulose builder 运行没反应。
5
(1/1503)
siliushui
2024-01-30
2024-03-26 10:10:49
by
hhcll
[
Gromacs
]
gromacs nsteps步数设置问他
10
(1/965)
luqing6879
2024-01-18
2024-01-27 20:29:54
by
stargood
[
Gromacs
]
分子模拟建模代做
(0/828)
年少是青苔
2024-01-20
2024-01-20 02:09:28
by
年少是青苔
[
Gromacs
]
gromas tip4p 水模型计算报错
10
(3/1042)
luqing6879
2024-01-16
2024-01-18 09:04:58
by
luqing6879
[
Gromacs
]
计算氢键百分比
20
(0/732)
万事顺意北
2024-01-09
2024-01-09 21:05:02
by
万事顺意北
[
Gromacs
]
分子动力学模拟教学求助?
20
(5/1904)
咖喱儿1
2023-09-27
2023-12-25 16:57:10
by
GYHandJXY
[
Gromacs
]
lammps混合MD/MC退火
2
(4/945)
m小咸鱼
2023-12-04
2023-12-09 21:47:04
by
miaojiabing
[
Gromacs
]
山东省生物物理重点实验室/德州学院 招聘蛋白/多肽分子动力学模拟方向研究人员/教师。
(2/1617)
zxcao
2022-07-15
2023-12-07 13:18:35
by
zxcao
[
Gromacs
]
多聚体蛋白质gromacs分子动力学模拟
5
(0/629)
LinL3
2023-11-26
2023-11-26 22:40:58
by
LinL3
[
Gromacs
]
分子动力学模拟(MD)GROMACS
(3/1366)
mudaidai
2023-03-22
2023-11-13 14:03:51
by
魔AA
[
Gromacs
]
请问有哪些参数可以表征分子链间产生滑移的难易程度
100
(0/536)
phaha
2023-11-06
2023-11-06 21:08:39
by
phaha
[
Gromacs
]
g_mmpbsa计算非极性物质的问题
20
(1/1060)
danghe24
2020-07-14
2023-08-26 09:04:11
by
我是莎莎啊
[
Gromacs
]
金属蛋白力场参数文件(NAMD)
5
(0/688)
王饭饭_
2023-07-14
2023-07-14 19:47:11
by
王饭饭_
[
Gromacs
]
电解液溶剂化结构模拟
(21/1046)
wubaolin1995
2023-04-02
2023-06-16 17:53:40
by
吴臻Wvz
[
Gromacs
]
氢键寿命的影响
20
(2/780)
珠江Pearl
2023-06-12
2023-06-12 20:39:38
by
珠江Pearl
[
Gromacs
]
VMD拉伸时蛋白质被拉出水盒
5
(2/753)
N_06yi
2023-04-28
2023-05-31 12:19:50
by
小城夜很美
[
Gromacs
]
2023年南京大学理论与计算化学暑期学校
(0/850)
guoxuehui
2023-05-23
2023-05-23 09:41:24
by
guoxuehui
[
Gromacs
]
gromacs复合物中生成拓扑错误
10
(1/644)
bracelon
2023-04-18
2023-04-20 13:51:30
by
中科小科虫
[
Gromacs
]
GROMACS
(2/860)
peng16llyy
2023-03-25
2023-03-27 17:36:42
by
jluchemlib
[
Gromacs
]
关于martini粗粒化粒子的尺寸大小
20
(0/620)
Yolanda9288
2023-03-16
2023-03-16 18:08:09
by
Yolanda9288
[
Gromacs
]
namd上生成psf文件时候拓扑文件操作失误,请前辈指点
5
(0/456)
王饭饭_
2023-02-06
2023-02-06 16:30:50
by
王饭饭_
[
Gromacs
]
金属离子
5
(0/506)
Hygeia云
2022-12-08
2022-12-08 12:50:41
by
Hygeia云
[
Gromacs
]
研究分子间作用力软件比较
5
(1/624)
zygxyfzxy
2022-12-04
2022-12-06 08:36:49
by
jiaoyixiong
[
Gromacs
]
获取pbd大分子蛋白质中的一部分
10
(0/476)
是郭奉孝呀
2022-11-21
2022-11-21 20:24:32
by
是郭奉孝呀
[
Gromacs
]
sander读取NetCDF格式rst文件失败
20
(2/1109)
fengrui826
2020-07-13
2022-11-18 17:41:59
by
Congcongi
[
Gromacs
]
关于分子模拟的各类计算需求,寻求有时间兼职的博士及高校老师
50
(6/300)
言榭竹昔
2021-01-18
2022-11-17 21:12:00
by
我是大个123
[
Gromacs
]
(CADD+AIDD+AMBER+GROMACS)学习
(0/786)
A小科研
2022-11-14
2022-11-14 16:21:02
by
A小科研
[
Gromacs
]
gromacs
(36/725)
??中路
2022-09-23
2022-11-14 16:18:09
by
A小科研
[
Gromacs
]
瑞典 林雪平大学 有机电子实验室招收2022/2023年全奖分子动力学模拟方向博士
85
(16/1166)
牧北
2022-10-22
2022-10-26 21:29:59
by
sct73
[
Gromacs
]
如何使用GROMACS调用GPU计算分子动力学
30
(2/1297)
851086861
2022-08-19
2022-08-30 16:36:53
by
851086861
[
Gromacs
]
求助使用CGenFF生成JZ4拓扑时出现报错
5
(0/629)
成liang
2022-08-30
2022-08-30 15:33:03
by
成liang
[
Gromacs
]
高熵氧化物如何建模呢
5
(2/750)
1嫩嫩嫩1
2022-04-15
2022-08-18 06:47:23
by
lastnumber
[
Gromacs
]
含B元素化合物的MD模拟求助
66
(1/534)
ymwaizc
2022-07-26
2022-07-27 12:15:08
by
yongleli
[
Gromacs
]
gromacs
20
(0/486)
嘻哈小疯子
2022-07-23
2022-07-23 21:22:27
by
嘻哈小疯子
[
Gromacs
]
请问gromacs的msd命令是什么,怎么求扩散系数呀
5
(1/1090)
可可的奶茶
2022-07-18
2022-07-18 20:24:07
by
天天进步啊
[
Gromacs
]
运行amber或namd所需电脑的最低配置
10
(0/556)
huangts123
2022-07-11
2022-07-11 16:54:00
by
huangts123
[
Gromacs
]
求助Gromacs计算服务器配置问题
20
(3/997)
scx235
2022-03-03
2022-07-11 14:05:04
by
huangts123
[
Gromacs
]
gromacs学不会怎么办
(3/1060)
一只狗在
2022-03-28
2022-07-11 07:29:11
by
blue_cat
[
Gromacs
]
请教PCA分析
(2/816)
gougou720
2022-06-25
2022-06-26 07:01:50
by
gougou720
[
Gromacs
]
gromacs中的pdb2gmx
(8/579)
无需问详
2022-06-13
2022-06-13 17:30:24
by
莫落
[
Gromacs
]
结果分析中氢键如何选择
30
(0/558)
gougou720
2022-06-07
2022-06-07 18:30:59
by
gougou720
[
Gromacs
]
基于GAFF力场的原子类型指认
5
(1/1461)
bluejh
2020-12-01
2022-06-02 16:02:48
by
suncaiyun328
[
Gromacs
]
有大佬可以指导一下吗
(1/645)
是欠欠啊
2022-04-21
2022-05-08 20:34:48
by
wgl0724
[
Gromacs
]
干马提尼
(20/631)
一只狗在
2022-05-05
2022-05-06 08:41:38
by
Edward-Lee
[
Gromacs
]
复合膜的平衡模拟
(11/768)
一只狗在
2022-04-17
2022-04-17 18:38:02
by
cecust
[
Gromacs
]
求助
4
(11/658)
jayliu7
2022-03-20
2022-04-17 15:50:24
by
Haorancczu
[
Gromacs
]
电极表面分子的密度分布-动力学模拟
10
(0/608)
summer如歌
2022-04-08
2022-04-08 20:43:33
by
summer如歌
[
Gromacs
]
求助,gromacs的md的最后一步,总是有结构但是没有计算能量,不明白为啥,求高人指点
20
(0/635)
xzz1007
2022-03-29
2022-03-29 02:04:05
by
xzz1007
[
Gromacs
]
Gromacs(GPU加速,2020版),报错
5
(0/765)
ECUST-Wei
2022-02-28
2022-02-28 21:17:05
by
ECUST-Wei
[
Gromacs
]
NAMD实现局部调温功能
10
(1/809)
Cooperbe
2022-01-21
2022-02-28 16:42:17
by
kt_flash
[
Gromacs
]
求助!求一份Amber20的安装包!
51
(4/2240)
492362591
2020-11-27
2022-02-28 13:32:53
by
王家小姐
[
Gromacs
]
按照教程做好ubq.pgn文件后无法使用,求指教!
20
(0/598)
湛西
2022-02-12
2022-02-12 21:12:27
by
湛西
[
Gromacs
]
有谁知道,超分子组装,计算两个分子间结合能,下面这个公式对不对
(11/710)
Reek buddy
2022-01-19
2022-01-19 15:40:12
by
CCAUKEYAN
[
Gromacs
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xpm个dat格式文件
(0/826)
兔斯基xcl
2022-01-04
2022-01-04 16:52:46
by
兔斯基xcl
[
Gromacs
]
yasara软件教程
(1/1206)
boychuan
2021-11-23
2022-01-04 11:37:58
by
Phama man
[
Gromacs
]
gromacs 求助
10
(0/505)
吧吧啦啦
2021-12-11
2021-12-11 10:19:38
by
吧吧啦啦
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Gromacs
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【分子动力学模拟】gromacs进行六个不同多肽自组装
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图图tutu20
2021-12-10
2021-12-10 14:20:52
by
图图tutu20
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Gromacs
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gromacs的运行
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yhj
2021-11-17
2021-12-04 21:10:46
by
vyry2136
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Gromacs
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[已完结]
蛋白对接结果怎么能够快速的仿真看其是否稳定
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recome
2019-06-11
2021-12-03 08:33:47
by
一代米哟
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Gromacs
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Amber动力学模拟,含有配体-蛋白复合物作为受体的动力学载入及识别问题。
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好好学习HQ
2020-07-07
2021-11-26 15:27:52
by
cngdkpmg
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Gromacs
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求助GAFF力场参数文件
(26/2020)
小小雨a
2019-10-07
2021-11-18 12:14:06
by
cngdkpmg
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Gromacs
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请教GPU型号的选择
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syd89522
2021-06-11
2021-11-03 06:21:21
by
北海的星
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Gromacs
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amber mmpbsa 长度与能量不匹配问题
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lily49
2021-03-30
2021-10-04 15:55:20
by
枫樰微飓
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Gromacs
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gromacs/lammps模拟
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hyfishere
2021-09-25
2021-09-26 01:06:15
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13972033882
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Gromacs
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请问Amber中cluster的用法
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欧宝宝的鱼
2021-09-06
2021-09-06 10:40:57
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欧宝宝的鱼
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Gromacs
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求问Gromacs如何计算RASA
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Diurnals
2021-08-09
2021-08-09 20:13:30
by
Diurnals
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Gromacs
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求助AMBER膜蛋白动力学模拟
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sun_5678
2020-12-29
2021-08-07 17:11:53
by
虫虫妃9527
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Gromacs
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分子动力学模拟gro格式转换为 car
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一品书屋
2021-08-07
2021-08-07 10:07:28
by
一品书屋
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Gromacs
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求教,gromacs分子模拟分析得到的拉氏图应该用什么绘制
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看看调剂
2021-04-20
2021-08-06 19:38:06
by
MD-禾黍
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Gromacs
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基于Gromacs的蛋白分子识别研究
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hazheng
2021-07-17
2021-07-17 12:36:46
by
hazheng
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Gromacs
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ovito 配位数分析 显示。 配位数不是整数
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jackwangee
2021-07-04
2021-07-05 09:22:28
by
G、sir
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Gromacs
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直链淀粉在amber升温阶段出现问题?
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木头平平
2021-06-21
2021-06-21 16:23:17
by
木头平平
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