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Gromacs
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jerkwin
2015-06-09
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by
绿茶QJM
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Gromacs
]
[已完结]
分析蛋白质的表面电荷分布问题
(1/2133)
YAYA_Z
2014-11-02
2020-10-13 14:11:47
by
灯芯流桨
[
Gromacs
]
[已完结]
运行mmpbsa时显示复合物prmtop文件出错
(9/3054)
syd89522
2016-11-01
2020-10-03 16:57:08
by
syd89522
[
Gromacs
]
[已完结]
NAMD 如何加载余弦电场在conf文件中?
(3/1194)
一山
2018-06-12
2020-09-29 10:22:31
by
枝昂昂昂
[
Gromacs
]
分子模拟介绍及其在高分子材料中的应用实例讲解
(0/1406)
xie122303
2020-09-28
2020-09-28 15:09:20
by
xie122303
[
Gromacs
]
gromacs计算速度
20
(6/2280)
Yolanda9288
2020-09-23
2020-09-24 13:31:35
by
Yolanda9288
[
Gromacs
]
【求助】那位知道哪款分子动力学软件支持GPU计算FEP(自由能微扰)?
(评阅+1)
(2/2227)
coolrainbow
2010-12-21
2020-09-24 08:27:00
by
密集雨
[
Gromacs
]
VMD读取PDB文件报错,failed to set coordinate for atom
5
(0/1162)
红豆,大红豆
2020-09-22
2020-09-22 20:55:36
by
红豆,大红豆
[
Gromacs
]
Ms导出pdb文档后如何转化为Gromacs需用的gro文件
5
(1/1665)
七七V
2020-09-20
2020-09-20 10:36:07
by
112233ssg
[
Gromacs
]
[已完结]
GROMCS出现错误
(1/2197)
来围观啊
2018-08-18
2020-09-17 04:07:57
by
hainu_carl
[
Gromacs
]
【求助】NVT平衡时出现LINCS warning
(2/2389)
sophia_999
2010-07-15
2020-09-17 04:03:00
by
hainu_carl
[
Gromacs
]
[已完结]
各位大神好,我想用命令pdb2gmx转化成gromacs文件,但操作显示没有发现命令?
(8/1833)
五绝神鹰
2017-02-26
2020-09-10 17:04:29
by
bjdxyxy
[
Gromacs
]
【分享】VMD教程中文版
(
1
2
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4
5
)
(245/2106)
smg_syliu
2011-02-25
2020-09-10 13:19:57
by
时光1913
[
Gromacs
]
求助:pdb2gmx程序文件产生拓扑文件,没法生成itp文件
5
(0/634)
jrcs
2020-09-08
2020-09-08 13:49:41
by
jrcs
[
Gromacs
]
如何用gromacs来构建一个纯LJ体系?
500
(2/1073)
11B329
2020-09-05
2020-09-08 09:45:01
by
jluchemlib
[
Gromacs
]
packmol建模后优化结构原子坐标为0
50
(0/759)
L4Bo2
2020-09-07
2020-09-07 16:10:02
by
L4Bo2
[
Gromacs
]
在哪能下载oligourea 结构的gro文件
(13/619)
大笨笨熊
2020-09-04
2020-09-05 13:27:45
by
工299
[
Gromacs
]
请问Gromacs添加两亲性肽的力场时pdb2gmx命令不识别肽链上连的小分子怎么处理?
10
(0/666)
欧阳思芊
2020-09-04
2020-09-04 01:25:44
by
欧阳思芊
[
Gromacs
]
求助Gromacs中文版使用手册
50
(1/670)
yhj
2020-08-08
2020-09-01 20:38:17
by
olgc
[
Gromacs
]
Gromacs模拟构象分析求助
10
(1/794)
laoxiaozi
2020-08-28
2020-08-28 16:25:03
by
小木翔AI
[
Gromacs
]
请问gromacs怎么使用drude力场?
45
(1/769)
luqing6879
2020-08-25
2020-08-25 14:24:10
by
xiaowu759
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs做mdrun中出现Segmentation fault
(3/2348)
chinayhb
2011-08-12
2020-08-19 19:22:18
by
小五bbboy
[
Gromacs
]
[已完结]
在执行mdrun时出现问题,求助?
(5/2191)
wuyoung
2014-08-21
2020-08-19 18:34:40
by
小五bbboy
[
Gromacs
]
南科大生物系MD simulation博士后职位空缺
(3/951)
shunsunsun
2020-08-19
2020-08-19 15:00:33
by
shunsunsun
[
Gromacs
]
xmgrace学习
(评阅+10)
(24/15194)
好好学习444
2015-05-09
2020-08-18 12:52:31
by
1420378874
[
Gromacs
]
蛋白水解时配体脱离
10
(1/579)
napatn
2020-07-27
2020-08-05 09:57:29
by
napatn
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs示例求助
(
1
2
)
(12/4342)
Mr_ANZ
2019-12-20
2020-08-04 13:14:28
by
牧生
[
Gromacs
]
amber教程
(12/539)
tcvlog
2020-08-03
2020-08-03 17:16:39
by
domer
[
Gromacs
]
【求助】想做一个金表面DNA吸附模拟
(1/625)
_cheyenne_
2020-08-02
2020-08-03 11:07:50
by
_cheyenne_
[
Gromacs
]
急求坐标转换方法
5
(4/1449)
傅晓童
2020-07-31
2020-07-31 18:20:07
by
傅晓童
[
Gromacs
]
[已完结]
Gromacs4.5.5版本中安装GLYCAM糖链模拟力场问题请教??
(4/1443)
陈应广
2012-05-07
2020-07-29 14:04:20
by
学材料学生
[
Gromacs
]
steric energy
(1/546)
shunsunsun
2020-07-18
2020-07-18 09:30:43
by
shunsunsun
[
Gromacs
]
有偿帮助做一个化合物对靶蛋白的对接和动力学模拟
5
(0/534)
waynezhan1981
2020-07-16
2020-07-16 17:20:44
by
waynezhan1981
[
Gromacs
]
小学弟求师兄师姐指导Gromacs下载安装
10
(1/660)
桐彤铜Boom
2020-06-14
2020-07-14 16:28:44
by
nssbyssc
[
Gromacs
]
[已完结]
如何用gromacs力场的基础上模拟出pi-pi stacking的作用呢?
(1/764)
JASE20
2016-10-15
2020-07-13 13:44:24
by
jianjunjiang
[
Gromacs
]
ions.mdp报错
(39/1050)
小木翔AI
2020-03-06
2020-07-11 22:32:30
by
huazhongnong
[
Gromacs
]
amber加热报错
15
(0/1434)
liang0908
2020-07-05
2020-07-05 15:27:37
by
liang0908
[
Gromacs
]
Gromacs中添加CHARMM力场
(41/5071)
jiazhuamh
2013-08-20
2020-07-02 08:19:42
by
iconvin
[
Gromacs
]
[已完结]
对蛋白质晶体结构进行gromacs水环境下对分子动力学模拟,出现错误
(评阅+3)
(2/613)
fullhouses
2014-07-04
2020-06-23 11:39:07
by
小许高年级
[
Gromacs
]
分子动力学reference structure
20
(1/552)
小红dd
2020-06-10
2020-06-20 09:33:08
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
求助:关于gromacs中itp文件的修改问题
(0/735)
Rene113
2020-06-16
2020-06-16 14:41:49
by
Rene113
[
Gromacs
]
如何在VMD中装入、修改或删除一个分子
10
(2/878)
youxx189
2020-06-15
2020-06-15 14:13:48
by
13972033882
[
Gromacs
]
[已完结]
AMBER14 cpu并行速度的困惑
(2/674)
syd89522
2020-05-25
2020-05-26 08:36:09
by
syd89522
[
Gromacs
]
gromscs计算两组的质心距离
(8/2673)
大笨笨熊
2019-06-16
2020-05-20 16:14:45
by
向海725
[
Gromacs
]
[已完结]
Gromacs如何使用单核运行?
(1/619)
ra2ghgzh
2020-03-24
2020-05-19 08:38:38
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
[已完结]
求助GROMACS软件安装包
(4/805)
103007054025
2020-05-13
2020-05-19 08:16:18
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
[已完结]
在gromacs中如何处理二硫键
(1/686)
那又如何..
2019-12-31
2020-05-19 05:55:35
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
[已完结]
恩,关于分子动力学模拟蛋白质侧链构象的问题,
(7/1157)
mircial
2012-03-09
2020-05-19 05:51:00
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
[已完结]
VMD
(
1
2
)
(12/1915)
zym765319199
2015-07-30
2020-05-19 05:50:08
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
求amber软件
(9/2763)
jundle
2018-08-09
2020-05-19 05:49:46
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
[已完结]
关于gromacs残基不识别的问题
(
1
2
)
(17/3065)
孜孜--
2014-09-02
2020-05-19 05:44:28
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
万元以内Gromacs用啥PC配置合适?
(3/3111)
leicahfs
2019-09-22
2020-05-19 05:43:36
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
[已完结]
求do_dssp的详细安装步骤?谢谢。
(评阅+1)
(7/3305)
1142634328
2015-03-17
2020-05-19 05:33:36
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
[已完结]
antechamber遇到问题
(2/1329)
hxhxjxj
2018-09-26
2020-05-19 05:30:15
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
[已完结]
.nc文件转为pdb文件
(1/1066)
ra2ghgzh
2020-05-06
2020-05-06 14:45:53
by
ra2ghgzh
[
Gromacs
]
看到有些同学需要gromacs的win版本的,我传一下吧,有需要的自己下。
(
1
2
3
)
(121/6654)
fangsteel
2014-11-10
2020-05-04 18:51:36
by
zzxyx99
[
Gromacs
]
CHARMM立场中对包含非标准残基HYP的蛋白质的模拟的拓扑文件和力场文件的修改方法
(9/3273)
cumt-ning
2015-03-17
2020-04-28 20:19:35
by
wjwang123
[
Gromacs
]
NAMD做RBCG粗粒化模拟
(0/539)
Yolanda9288
2020-04-27
2020-04-27 16:13:24
by
Yolanda9288
[
Gromacs
]
TINKER4.2 手册简译
(
1
2
)
(53/2979)
ChemiAndy
2011-07-23
2020-04-20 17:30:16
by
duotojh
[
Gromacs
]
[已完结]
VMD 计算密度分布的脚本
(1/2401)
xiaoyingw
2011-11-28
2020-04-13 17:36:28
by
daipacu2
[
Gromacs
]
VMD中脂质分子分子个数
(0/408)
Yolanda9288
2020-04-09
2020-04-09 16:24:00
by
Yolanda9288
[
Gromacs
]
[已完结]
在VMD中对NiO晶体结构实施粗粒化,粗粒化珠子个数或者半径该如何实现?
(评阅+1)
(1/1053)
pei小f
2015-04-14
2020-03-28 07:07:41
by
lisa25496
[
Gromacs
]
请问在NAMD中如何计算溶液的粘度?
(21/713)
southeastBIG
2020-03-10
2020-03-25 00:40:06
by
18018590138
[
Gromacs
]
gromacs 并行计算
(7/1707)
lulu19vega
2013-06-30
2020-03-05 21:47:59
by
wy11223
[
Gromacs
]
[已完结]
求阿霉素dox的粗粒化文件或教程。
(0/464)
小小学渣啊
2020-03-05
2020-03-05 02:25:49
by
小小学渣啊
[
Gromacs
]
[已完结]
vmd插件diffusion coefficient在windows下的安装
(3/2072)
haiyuntianya
2015-11-29
2020-03-03 13:07:41
by
lvweiqiang111
[
Gromacs
]
[已完结]
TIP3P水溶剂介电常数的问题
(0/628)
znw810320
2020-03-02
2020-03-02 10:14:48
by
znw810320
[
Gromacs
]
[已完结]
Atom P in residue DA 1 was not found in rtp entry DA5 with 30 atoms
(1/2952)
huilovezhe
2016-05-25
2020-03-01 18:03:45
by
冯思RAN
[
Gromacs
]
[已完结]
namd预编译文件怎么使用
(0/702)
19800617
2020-02-29
2020-02-29 17:38:34
by
19800617
[
Gromacs
]
[已完结]
安装cmake和 namd时遇到两个与 mv有关的语句 求教含义
(1/528)
19800617
2020-02-27
2020-02-27 20:40:02
by
小木翔AI
[
Gromacs
]
lammps gromacs
(0/511)
ms学习
2020-02-10
2020-02-10 11:52:10
by
ms学习
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs 中g_msd问题
(8/1721)
ruthxu
2012-02-22
2020-02-05 06:23:54
by
小瘦娃
[
Gromacs
]
[已完结]
含铂配合物分子动力学模拟力场选择
(7/1895)
xsw1EZUNT519
2019-05-09
2020-01-25 16:54:12
by
blacksep
[
Gromacs
]
[已完结]
Gromacs 氢键分析出现错误(gmx hbond -ac)
(1/2507)
来围观啊
2019-05-21
2020-01-13 23:43:12
by
ietey
[
Gromacs
]
[已完结]
计算最大团簇的sasa
(1/1504)
Oceansdeep
2016-12-15
2020-01-13 06:44:26
by
lao7
[
Gromacs
]
生物分子模拟发中文核心
(36/1412)
jfxjfx
2019-12-16
2020-01-09 16:13:04
by
pl971
[
Gromacs
]
【求助】求助Gromacs中关于g_hbond的out文件的问题
(
1
2
)
(10/2119)
tpp001
2010-08-13
2020-01-09 13:19:11
by
pl813
[
Gromacs
]
HOLE软件交流
(
1
2
)
(10/1921)
nufang19a
2011-04-19
2020-01-09 11:37:47
by
pl958
[
Gromacs
]
amber动力学模拟时,怎么让底物周围氨基酸的侧链位置更准确呢
(10/1184)
我是考研狗
2019-11-14
2020-01-09 11:09:38
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
[已完结]
Gromacs怎么分析氢键存活时间?
(
1
2
)
(评阅+1)
(13/3846)
gxsulong
2011-07-20
2020-01-08 13:59:25
by
pl992
[
Gromacs
]
[已完结]
执行水中的溶菌酶教程时生成不了tpr文件
(9/2774)
zhaimen
2015-09-26
2020-01-08 12:21:54
by
pl977
[
Gromacs
]
[已完结]
我需要构建DNA和小分子作用的pdb以及top文件,遇到困难,求助 万分感激!!!
(评阅+6)
(6/2189)
eva_dan
2014-04-15
2020-01-08 12:21:46
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pl976
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Gromacs
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prodrg网站生成的键长的单位是什么?
(5/1439)
memgr
2013-05-08
2020-01-08 07:48:52
by
pl960
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Gromacs
]
VMD怎样建立两个磷脂双分子层
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Yolanda9288
2019-11-28
2020-01-06 16:57:55
by
pl959
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Gromacs
]
Gromacs能否取出多少距离以内的构型
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zhangyujin
2019-12-04
2020-01-04 11:12:26
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pl995
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Gromacs
]
[已完结]
反粗粒化得到的蛋白质的二级结构发生改变,是否合理
(2/905)
小清新王虫虫
2017-11-14
2020-01-03 13:04:10
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路过的一之
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Gromacs
]
[已完结]
gromacs氢键分析工具,g_hbond输出结果解析?
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(评阅+1)
(11/4561)
jianchen7882
2014-06-10
2020-01-02 07:11:10
by
lao7
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Gromacs
]
[已完结]
VMD中如何将两个pdb文件合成一个新的pdb文件?
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)
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tanzouqing
2012-08-27
2019-12-03 04:19:14
by
Yolanda9288
[
Gromacs
]
国产分子动力学计算软件BeeMD正式上线,欢迎下载测试
(
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(评阅+1)
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beeMD
2014-06-09
2019-12-02 11:17:38
by
biogefart
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Gromacs
]
NAMD做磷脂膜电穿孔,加外电场
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Yolanda9288
2019-11-15
2019-11-15 11:36:15
by
13972033882
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Gromacs
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amber
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ssxxmc
2017-04-07
2019-11-06 17:59:53
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sunrider
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Gromacs
]
[已完结]
请问各位大佬 分子模拟方向硕士工作
(3/771)
闪点战队
2019-09-20
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112233ssg
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油水界面模拟
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暮色恋伊人
2019-10-30
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暮色恋伊人
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Gromacs
]
[已完结]
vmd中namdenergy插件的问题
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jyl1996
2019-10-29
2019-10-29 14:16:55
by
jyl1996
[
Gromacs
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[已完结]
Amber中如何建立辅酶分子NADPH的Top文件和inpcrd文件
(2/912)
大姚
2018-07-06
2019-10-25 08:42:04
by
江南的酱
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