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Yolanda9288新虫 (小有名气)
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gromacs计算速度
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实验室有两台工作站,cpu相同,均没有gpu,只有内存差别,一个256g,一个384g,但是我在两台机器上计算一样的模型速度差别很大,内存高的快很多,但我看计算时,内存占用率并不高,cpu占用率都是一样的,是什么原因呢?慢的那台是不是安装gromacs的时候哪里设置不对,还是计算速度与内存关系很大?望高手指点 发自小木虫Android客户端 |
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4楼2020-09-23 23:09:10
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跟内存条数量可能有关系。不知道你的cpu型号,我们最近配置了一台96线程的工作站,我这个cpu貌似是16通道的,所以在传输数据的时候,如果16个内存条都插满,就可以一起传输。但是如果没有插满,比如只有10个,那其他6个传输的时候,就要先等那10传输完,再传输。所以10跟16g的内存虽然一共有160g的内存,但是传输速率还不如16个4g的,虽然后者只有前者不到一半的内存。就好比,你拿10量卡车把16本书运送到16个地方,就不如我用16个小火车运送16本书。反正总量始终是超过的,那个数就很重要了。 发自小木虫Android客户端 |
5楼2020-09-23 23:10:14
6楼2020-09-23 23:12:01
Yolanda9288
新虫 (小有名气)
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7楼2020-09-24 13:31:35












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