24小时热门版块排行榜    

查看: 2639  |  回复: 6
【悬赏金币】回答本帖问题,作者Yolanda9288将赠送您 20 个金币

Yolanda9288

新虫 (小有名气)

[求助] gromacs计算速度

实验室有两台工作站,cpu相同,均没有gpu,只有内存差别,一个256g,一个384g,但是我在两台机器上计算一样的模型速度差别很大,内存高的快很多,但我看计算时,内存占用率并不高,cpu占用率都是一样的,是什么原因呢?慢的那台是不是安装gromacs的时候哪里设置不对,还是计算速度与内存关系很大?望高手指点

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aa小小佑

银虫 (职业作家)

可能是gromacs单双精度问题,?不确定双精度是否会慢

发自小木虫IOS客户端
2楼2020-09-23 22:57:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤帅帅

新虫 (小有名气)

跟内存条数量可能有关系。

发自小木虫Android客户端
3楼2020-09-23 23:00:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木翔AI

新虫 (著名写手)

4楼2020-09-23 23:09:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤帅帅

新虫 (小有名气)

跟内存条数量可能有关系。不知道你的cpu型号,我们最近配置了一台96线程的工作站,我这个cpu貌似是16通道的,所以在传输数据的时候,如果16个内存条都插满,就可以一起传输。但是如果没有插满,比如只有10个,那其他6个传输的时候,就要先等那10传输完,再传输。所以10跟16g的内存虽然一共有160g的内存,但是传输速率还不如16个4g的,虽然后者只有前者不到一半的内存。就好比,你拿10量卡车把16本书运送到16个地方,就不如我用16个小火车运送16本书。反正总量始终是超过的,那个数就很重要了。

发自小木虫Android客户端
5楼2020-09-23 23:10:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤帅帅

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 独孤帅帅 at 2020-09-23 23:10:14
跟内存条数量可能有关系。不知道你的cpu型号,我们最近配置了一台96线程的工作站,我这个cpu貌似是16通道的,所以在传输数据的时候,如果16个内存条都插满,就可以一起传输。但是如果没有插满,比如只有10个,那其他 ...

小货车。。。
说的不太严禁,大概是这个意思。
所以你看下你们的内存条是不是插满了,没有的话插满,可能会好一点。

发自小木虫Android客户端
6楼2020-09-23 23:12:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Yolanda9288

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 独孤帅帅 at 2020-09-23 23:10:14
跟内存条数量可能有关系。不知道你的cpu型号,我们最近配置了一台96线程的工作站,我这个cpu貌似是16通道的,所以在传输数据的时候,如果16个内存条都插满,就可以一起传输。但是如果没有插满,比如只有10个,那其他 ...

非常感谢您的回复,我今天看了下我们的工作站,其中一台16个插槽,插了12个32g的内存条,总共384g,另一台也是16个插槽,插了16个16g的内存条,总共256g但是有四个插槽识别不了,可能是坏了,可用只有192g,也就是12个16g,跟那台电脑插的内存条数量应该是一样的,只有单个内存条大小不一样,但是运行速度确实慢很多倍,我们的cpu都是一样的,型号是Intel Xeon E5-2630 v3 2.4GHz *2 16核 32线程,还是不知道什么原因慢5倍左右
7楼2020-09-24 13:31:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Yolanda9288 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +4 炎黄贵胄 2026-08-22 5/250 2026-08-24 02:09 by 流流伤
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +16 羊腰板 2026-08-21 17/850 2026-08-23 23:02 by tianxiaochun
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见