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【悬赏金币】回答本帖问题，作者Yolanda9288将赠送您 20 个金币

Yolanda9288

新虫 (小有名气)

[求助] gromacs计算速度

实验室有两台工作站，cpu相同，均没有gpu，只有内存差别，一个256g，一个384g，但是我在两台机器上计算一样的模型速度差别很大，内存高的快很多，但我看计算时，内存占用率并不高，cpu占用率都是一样的，是什么原因呢？慢的那台是不是安装gromacs的时候哪里设置不对，还是计算速度与内存关系很大？望高手指点

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1楼 2020-09-23 22:53:49
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aa小小佑

银虫 (职业作家)
可能是gromacs单双精度问题，?不确定双精度是否会慢

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2楼2020-09-23 22:57:57
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独孤帅帅

新虫 (小有名气)
跟内存条数量可能有关系。

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3楼2020-09-23 23:00:49
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小木翔AI

新虫 (著名写手)
没有GPU，你还想要多快

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4楼2020-09-23 23:09:10
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独孤帅帅

新虫 (小有名气)
跟内存条数量可能有关系。不知道你的cpu型号，我们最近配置了一台96线程的工作站，我这个cpu貌似是16通道的，所以在传输数据的时候，如果16个内存条都插满，就可以一起传输。但是如果没有插满，比如只有10个，那其他6个传输的时候，就要先等那10传输完，再传输。所以10跟16g的内存虽然一共有160g的内存，但是传输速率还不如16个4g的，虽然后者只有前者不到一半的内存。就好比，你拿10量卡车把16本书运送到16个地方，就不如我用16个小火车运送16本书。反正总量始终是超过的，那个数就很重要了。

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5楼2020-09-23 23:10:14
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独孤帅帅

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 独孤帅帅 at 2020-09-23 23:10:14
跟内存条数量可能有关系。不知道你的cpu型号，我们最近配置了一台96线程的工作站，我这个cpu貌似是16通道的，所以在传输数据的时候，如果16个内存条都插满，就可以一起传输。但是如果没有插满，比如只有10个，那其他 ...

小货车。。。
说的不太严禁，大概是这个意思。
所以你看下你们的内存条是不是插满了，没有的话插满，可能会好一点。

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6楼2020-09-23 23:12:01
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Yolanda9288

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 独孤帅帅 at 2020-09-23 23:10:14
跟内存条数量可能有关系。不知道你的cpu型号，我们最近配置了一台96线程的工作站，我这个cpu貌似是16通道的，所以在传输数据的时候，如果16个内存条都插满，就可以一起传输。但是如果没有插满，比如只有10个，那其他 ...

非常感谢您的回复，我今天看了下我们的工作站，其中一台16个插槽，插了12个32g的内存条，总共384g，另一台也是16个插槽，插了16个16g的内存条，总共256g但是有四个插槽识别不了，可能是坏了，可用只有192g，也就是12个16g，跟那台电脑插的内存条数量应该是一样的，只有单个内存条大小不一样，但是运行速度确实慢很多倍，我们的cpu都是一样的，型号是Intel Xeon E5-2630 v3 2.4GHz *2 16核 32线程，还是不知道什么原因慢5倍左右
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7楼2020-09-24 13:31:35
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