24小时热门版块排行榜    

查看: 2367  |  回复: 6
【悬赏金币】回答本帖问题,作者Yolanda9288将赠送您 20 个金币

Yolanda9288

新虫 (小有名气)

[求助] gromacs计算速度

实验室有两台工作站,cpu相同,均没有gpu,只有内存差别,一个256g,一个384g,但是我在两台机器上计算一样的模型速度差别很大,内存高的快很多,但我看计算时,内存占用率并不高,cpu占用率都是一样的,是什么原因呢?慢的那台是不是安装gromacs的时候哪里设置不对,还是计算速度与内存关系很大?望高手指点

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aa小小佑

银虫 (职业作家)

可能是gromacs单双精度问题,?不确定双精度是否会慢

发自小木虫IOS客户端
2楼2020-09-23 22:57:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤帅帅

新虫 (小有名气)

跟内存条数量可能有关系。

发自小木虫Android客户端
3楼2020-09-23 23:00:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木翔AI

新虫 (著名写手)

4楼2020-09-23 23:09:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤帅帅

新虫 (小有名气)

跟内存条数量可能有关系。不知道你的cpu型号,我们最近配置了一台96线程的工作站,我这个cpu貌似是16通道的,所以在传输数据的时候,如果16个内存条都插满,就可以一起传输。但是如果没有插满,比如只有10个,那其他6个传输的时候,就要先等那10传输完,再传输。所以10跟16g的内存虽然一共有160g的内存,但是传输速率还不如16个4g的,虽然后者只有前者不到一半的内存。就好比,你拿10量卡车把16本书运送到16个地方,就不如我用16个小火车运送16本书。反正总量始终是超过的,那个数就很重要了。

发自小木虫Android客户端
5楼2020-09-23 23:10:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤帅帅

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 独孤帅帅 at 2020-09-23 23:10:14
跟内存条数量可能有关系。不知道你的cpu型号,我们最近配置了一台96线程的工作站,我这个cpu貌似是16通道的,所以在传输数据的时候,如果16个内存条都插满,就可以一起传输。但是如果没有插满,比如只有10个,那其他 ...

小货车。。。
说的不太严禁,大概是这个意思。
所以你看下你们的内存条是不是插满了,没有的话插满,可能会好一点。

发自小木虫Android客户端
6楼2020-09-23 23:12:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Yolanda9288

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 独孤帅帅 at 2020-09-23 23:10:14
跟内存条数量可能有关系。不知道你的cpu型号,我们最近配置了一台96线程的工作站,我这个cpu貌似是16通道的,所以在传输数据的时候,如果16个内存条都插满,就可以一起传输。但是如果没有插满,比如只有10个,那其他 ...

非常感谢您的回复,我今天看了下我们的工作站,其中一台16个插槽,插了12个32g的内存条,总共384g,另一台也是16个插槽,插了16个16g的内存条,总共256g但是有四个插槽识别不了,可能是坏了,可用只有192g,也就是12个16g,跟那台电脑插的内存条数量应该是一样的,只有单个内存条大小不一样,但是运行速度确实慢很多倍,我们的cpu都是一样的,型号是Intel Xeon E5-2630 v3 2.4GHz *2 16核 32线程,还是不知道什么原因慢5倍左右
7楼2020-09-24 13:31:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Yolanda9288 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 伙伴们,祝我生日快乐吧 +3 myrtle 2026-03-10 3/150 2026-03-11 12:57 by zyqchem
[硕博家园] 深圳大学硕士招生(2026秋,传感器方向,仅录取第一志愿) +4 xujiaoszu 2026-03-11 6/300 2026-03-11 12:30 by xujiaoszu
[考研] 材料工程330分求调剂,一志愿985 +4 小材化本科 2026-03-07 4/200 2026-03-11 10:48 by @飒飒飒飒
[考研] 求调剂 +4 鹤遨予卿 2026-03-09 4/200 2026-03-11 10:47 by @飒飒飒飒
[考研] 材料工程307,求调剂 +7 我要燃烧你的梦 2026-03-08 7/350 2026-03-11 09:09 by 剑诗杜康
[考研] 一志愿天津大学材料与化工275求调剂 10+5 穿只靴子 2026-03-07 19/950 2026-03-10 19:35 by zeng1010
[考研] 0860求调剂(272分) +3 lllllcsjsj 2026-03-05 4/200 2026-03-10 15:29 by circleffyy
[考研] 304求调剂(085602一志愿985) +8 化工人999 2026-03-09 8/400 2026-03-10 15:21 by houyaoxu
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +4 ZyZy…… 2026-03-10 4/200 2026-03-10 15:20 by houyaoxu
[考研] 0817化学工程319求调剂 +7 lv945 2026-03-08 9/450 2026-03-10 11:44 by peike
[考研] 一志愿南大化学339分求调剂,四六级已过,有比赛,有文章 +7 Gallantzhou 2026-03-07 7/350 2026-03-09 18:38 by 30660438
[考研] 考研调剂,一志愿山东大学材料与化工,328分,政治51 +5 关你西红柿929 2026-03-08 6/300 2026-03-09 13:50 by 新篇章DFSS
[考研] 337求调剂 +3 睡醒,。 2026-03-09 3/150 2026-03-09 10:02 by 求调剂zz
[考研] 083000环境科学与工程调剂 +5 加油呀fxy 2026-03-07 6/300 2026-03-08 21:07 by sdgdsdgd
[考研] 288求调剂(0703)一志愿东北大学 +5 好好- 2026-03-07 5/250 2026-03-08 18:22 by zzpnuli111
[考研] 第一志愿上海大学,专业化学工程与技术,总分288,求调剂 +3 1829197082 2026-03-07 3/150 2026-03-07 19:14 by houyaoxu
[考研] 2026调剂】考试A区0703化学类323分 诚求接收 +3 卷柏卷柏 2026-03-05 4/200 2026-03-07 17:00 by yuandd_2001
[考研] 一志愿哈尔滨工业大学0856材料与化工,前三科206,总分283,求调剂 +7 26考研求调剂 2026-03-06 7/350 2026-03-07 14:49 by Miko19
[考研] 材料与化工354调剂 +4 Lucy-xiao 2026-03-06 7/350 2026-03-06 09:57 by hxuq8429
[考研] 纺织、生物、化学、材料等专业 +3 Eember. 2026-03-05 7/350 2026-03-05 16:35 by Eember.
信息提示
请填处理意见