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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 国产分子动力学计算软件BeeMD正式上线，欢迎下载测试
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beeMD

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
29楼: Originally posted by hongyexi at 2014-08-09 09:49:58
网站改版了，但速度慢了好多，不知道是不是我的网速的原因

网站空间目前在国外，访问速度时好时差，请多包函
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31楼2014-08-20 10:23:47
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pzj1979

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个能模拟陶瓷的烧结么？谢谢
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32楼2014-08-20 22:43:30
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beeMD

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
32楼: Originally posted by pzj1979 at 2014-08-20 22:43:30
这个能模拟陶瓷的烧结么？谢谢

做不了，目前，没有这方面力场相关开发
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33楼2014-08-21 18:44:48
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beeMD

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
30楼: Originally posted by wgpig at 2014-08-19 10:43:47
不开发源码。无爱。

这个项目是开源的，但目前只对开发者开源，如果感兴趣可加入开发团（自由开发，我们不付任何报酬），即可下载到源码和开发工具，或者再耐心等待几个月，等我们完善开发和完成相关开发文档写作后，即对外完全开源，敬请谅解。
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34楼2014-09-01 18:47:22
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wgpig

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
34楼: Originally posted by beeMD at 2014-09-01 18:47:22
这个项目是开源的，但目前只对开发者开源，如果感兴趣可加入开发团（自由开发，我们不付任何报酬），即可下载到源码和开发工具，或者再耐心等待几个月，等我们完善开发和完成相关开发文档写作后，即对外完全开源， ...

可否先提供预览版，或者先单独PM我。
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35楼2014-09-02 10:42:52
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beeMD

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
35楼: Originally posted by wgpig at 2014-09-02 10:42:52
可否先提供预览版，或者先单独PM我。...

编译好的可执行包请到http://beemd.org/default/?q=Downloads下载
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36楼2014-09-10 12:10:35
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fanc232

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我看了课程内容。里面有计算药物与蛋白质分子结合自由能的部分。想问问gromacs培训里面有没有这个部分？我做计算机辅助药物设计，很重视对结合自由能的计算。如果这个部分的培训比较多，或者整个培训内容都比较偏重于生物分子模拟，那么我就向导师申请参加这个培训班。
综上，培训内容可以介绍得更详细一些吗？MODAR是免费软件吗？
自带笔记本电脑，配制一般都挺低。用来跑蛋白质和DNA之类的体系，时间上来不及吧？
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我很喜欢计算机辅助药物设计
37楼2014-09-10 17:05:46
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fanc232

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我今天又看了一下，貌似学员可以通过自带的笔记本远程提交给北计的服务器进行计算吧。MODAR我也看见了，对学术用户免费。
今天又有一个新问题，那就是MODAR作为国产软件，发文章的时候使用，结果是否会被认可？
由这个问题我想到，你们是否可以调整一下课程内容，带着学员们可以把每个实例，在gromacs和Modar上各跑一遍，大家可以看看比对结果？
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我很喜欢计算机辅助药物设计
38楼2014-09-11 09:58:34
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i小糊涂仙
支持
39楼2015-04-03 15:19:19
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
40楼2015-05-25 08:33:20
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