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木虫 (小有名气)

[求助] AMBER14 cpu并行速度的困惑

大家好！我用一台64核128线程的服务器做AMBER14的并行计算，发现只有并行线程在-np 64的时候，速度最快，而用-np 96的时候，速度只有64线程的80%，-np 120的时候，速度只有64的一半多一点，请问大家，如何设置amber才能让其调用全部线程并运行出最快速度呢？

走自己的路，让别人说去吧~不以物喜，不以己悲

1楼 2020-05-25 14:34:17

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新虫 (著名写手)

amber的cpu速度就是这样，namd的cpu利用率是最高的，amber的gpu利用率是最高的

发自小木虫Android客户端

2楼2020-05-25 19:34:28

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木虫 (小有名气)

引用回帖:

2楼: Originally posted by hdx1991 at 2020-05-25 19:34:28
amber的cpu速度就是这样，namd的cpu利用率是最高的，amber的gpu利用率是最高的

明白啦，谢谢！

走自己的路，让别人说去吧~不以物喜，不以己悲

3楼2020-05-26 08:36:09

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