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lulu19vega

新虫 (初入文坛)

[交流] gromacs 并行计算 已有7人参与

求助各位大侠!我是菜鸟水平,在学校的工作站上安装了grmacs4.5.5,但是不知道可不可以并行计算啊,在网上看还需要安装并行版,这么麻烦么?有没有不用重新安装的方法呢?比如安装个软件包啥的?gromacs已经出了4.6.1了,也没看到并行版啊
我的安装过程如下:
./configure --prefix=HOME/lib/lam-7.1.4 --without-fc --with-rsh="ssh-x"
Make
Make install
Export PATH=&PATH:HOME/lib/lam-7.1.4/bin

./configure --enable-float --enable-mpi --prefix=/home/hzl/lib/ fftw-3.3.2
Make install
Make distclean
./configure --disable-float --enable-mpi --prefix=/home/hzl/lib/ fftw-3.3.2

export CPPFLAGS=-I/HOME/lib/fftw-3.3.2/include
export LDFLAGS=-L/HOME/lib/fftw-3.3.2/lib

./configure --prefix=/home/ gromacs-4.5.5 --enable-mpi --disable-shared
Make
Make install
make distclean
./configure --prefix=/HOME /lib/gromacs-4.5.5 --program-suffix=_d --enable-mpi --disable-float
谢谢了!
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lao7

金虫 (正式写手)

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默认就是并行的。所以无需刻意安装并行版。
2楼2019-11-27 11:49:16
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3楼2020-01-02 09:38:16
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4楼2020-01-03 11:05:47
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5楼2020-01-04 14:52:04
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6楼2020-01-07 11:09:37
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7楼2020-01-09 11:02:05
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8楼2020-03-06 00:47:59
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