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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 仿真模拟 » FLUENT & CFX » 请教并行计算linux的问题
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5超7

至尊木虫 (著名写手)

菜鸟

[求助] 请教并行计算linux的问题

我在连接局域网进行并行计算的时候，一直会中断，中断挺有规律，自动保存一次后，没过多久就中断了，出现的字样如图中所示：terminated，还有其下面那行字，请问大家这是什么原因造成的？我用的是fluent6.3版本，排出cas的问题，因为我使用后台计算就是可以继续算下去的，只有交互式存在这个问题！

1.png
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我要奋斗到底
1楼 2012-12-26 20:27:41
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

峰fight

木虫 (正式写手)
★
xiegangmai: 金币+1, 谢谢参与 2013-01-06 14:09:35
引用回帖:
15楼: Originally posted by 5超7 at 2012-12-28 20:57:57
不满你说，这方面我不懂。只是机械性地按照给的指令打的，用MPI就可以调出fluent6.3...

我仔细看了下，应该是
-mpi=hp
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搞航空宇航的小角色
16楼2012-12-28 21:23:47
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普通回帖

onesupeng

金虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
xiegangmai: 金币+1, 谢谢参与 2012-12-27 21:56:20
这个你应该问机器管理员的吧？感觉是因为机器不允许这样提交作业的。另外，$PBS_NODEFILE只有在用pbs作业管理系统的时候才能生成的吧，你直接这样可以吗？
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长期招收博士生，参见http://fsl-unsw.com
2楼2012-12-27 02:50:24
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5超7

至尊木虫 (著名写手)

菜鸟
引用回帖:
2楼: Originally posted by onesupeng at 2012-12-27 02:50:24
这个你应该问机器管理员的吧？感觉是因为机器不允许这样提交作业的。另外，$PBS_NODEFILE只有在用pbs作业管理系统的时候才能生成的吧，你直接这样可以吗？

哦！谢谢你的回复！首先这样的指令是可以提交作业的，我们研究所都通过这样的指令进行交互式计算，其次我们上传作用是通过Xftp这个软件上传的，同样需要联网才能上传！
我问过管理HPC的老师，他告诉我可能是网络的问题，可是我觉得网络的问题应该不大，因为我XFTP也是一直开着的，上面显示的是连接着的状态，而交互计算就会在自动保存一次后，中断！
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我要奋斗到底
3楼2012-12-27 08:00:34
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onesupeng

金虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
xiegangmai: 金币+2, 专家考核, 谢谢参与 2012-12-27 21:56:37
5超7: 金币+2, ★★★很有帮助, 非常感谢你热情的回复！目前可以通宵并行了，我把指令中的long改成了verylong 2012-12-29 08:05:18
好吧，那只能是我孤陋寡闻了。我做了至少6年的居于linux的并行系统和作业管理系统的安装测试和管理，我知道的PBS_NODEFILE是表示由pbs自动分配给作业的节点列表，其节点数为命令行中指定的进程数。因此你不调用PBS，如何能使用PBS_NODEFILE 变量呢

我认为你这种情况应该是单独手动写一个机器列表文件hosts_file ，然后让 -cns=hosts_file
其中hosts_file 里面的内容为
node1：n1
node2：n2
的形式。你研究看看是不是这么回事。当然，如果是fluent自己能生成PBS_NODEFILE 变量列表，就当我没说过
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4楼2012-12-27 11:53:19
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onesupeng

金虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
xiegangmai: 金币+1, 谢谢参与 2012-12-27 21:56:50
但是fluent并行命令设计应该是独立于pbs等管理系统存在的，不必要依赖、兼容pbs，而且pbs也是比较落后的系统
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5楼2012-12-27 11:55:18
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5超7

至尊木虫 (著名写手)

菜鸟
引用回帖:
5楼: Originally posted by onesupeng at 2012-12-27 11:55:18
但是fluent并行命令设计应该是独立于pbs等管理系统存在的，不必要依赖、兼容pbs，而且pbs也是比较落后的系统

这方面我没有您那么懂，我只是按照要求输入相应的指令而已，只是现在自动保存一次后就退出，这让我百思不得其解
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我要奋斗到底
6楼2012-12-27 12:02:00
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峰fight

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
5超7: 金币+2, ★有帮助 2012-12-28 14:39:28
5超7: 金币+1, ★有帮助, 剩下一个BB，给你！谢谢你！ 2012-12-29 08:07:30
xiegangmai: 金币+2, 谢谢参与 2013-01-06 14:09:55
对于linux下的并行问题我不熟，帮不上什么忙
但是有个建议是使用ANSYS FLUENT，而不是6.3，6.3的版本的并行法案还停留在2006年的水平上
现在的版本是ANSYS 14.5了，13.0以后的版本，对linux这块做了很多的改动和优化
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搞航空宇航的小角色
7楼2012-12-28 13:33:30
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峰fight

木虫 (正式写手)
★
xiegangmai: 金币+1, 谢谢参与 2013-01-06 14:10:07
我实验室同学一直用的13.0，在linux并行，交互式，局域网，没有过报错，你可以试试
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搞航空宇航的小角色
8楼2012-12-28 13:37:47
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5超7

至尊木虫 (著名写手)

菜鸟
引用回帖:
8楼: Originally posted by 峰fight at 2012-12-28 13:37:47
我实验室同学一直用的13.0，在linux并行，交互式，局域网，没有过报错，你可以试试

恩！你不是用局域网进行交互式计算的吗？
我的问题很诡异，自动保存一下后，就出现terminated，然后就无法并行计算了
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我要奋斗到底
9楼2012-12-28 14:40:14
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5超7

至尊木虫 (著名写手)

菜鸟
引用回帖:
4楼: Originally posted by onesupeng at 2012-12-27 11:53:19
好吧，那只能是我孤陋寡闻了。我做了至少6年的居于linux的并行系统和作业管理系统的安装测试和管理，我知道的PBS_NODEFILE是表示由pbs自动分配给作业的节点列表，其节点数为命令行中指定的进程数。因此你不调用PBS， ...

我不是很明白你的意思，这方面我真是外行！我就贴出打完申请指令后fluent里面显示的内容给你看看把！如下图所示：

2.png



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我要奋斗到底
10楼2012-12-28 14:44:24
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