24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2343  |  回复: 11

c03185

新虫 (小有名气)

[求助] VASP并行计算时,提示“超过CPU时限”而退出计算。请问如何解决?

running on    8 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    8 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found :  2 types and    6 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected
FFT: planning ...(           1 )
reading WAVECAR
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
RMM:   1     0.112962560756E+03    0.11296E+03   -0.69848E+03  1512   0.693E+02
RMM:   2    -0.305217733500E+01   -0.11601E+03   -0.12362E+03  1512   0.173E+02
RMM:   3    -0.220863257631E+02   -0.19034E+02   -0.16605E+02  1512   0.684E+01
RMM:   4    -0.266524934524E+02   -0.45662E+01   -0.26797E+01  1512   0.403E+01
RMM:   5    -0.274449693522E+02   -0.79248E+00   -0.70905E+00  1512   0.164E+01
RMM:   6    -0.276538353951E+02   -0.20887E+00   -0.18463E+00  1512   0.103E+01
RMM:   7    -0.277119302964E+02   -0.58095E-01   -0.54192E-01  1512   0.446E+00
RMM:   8    -0.277288405566E+02   -0.16910E-01   -0.15880E-01  1512   0.291E+00
RMM:   9    -0.277355360489E+02   -0.66955E-02   -0.65108E-02  3234   0.128E+00
RMM:  10    -0.277360809052E+02   -0.54486E-03   -0.54143E-03  3277   0.298E-01
RMM:  11    -0.277361101359E+02   -0.29231E-04   -0.27153E-04  2774   0.783E-02
RMM:  12    -0.277361131135E+02   -0.29776E-05   -0.30028E-05  2469   0.192E-02    0.196E+01
RMM:  13    -0.341632543219E+02   -0.64271E+01   -0.12383E+02  3090   0.946E+01    0.154E+01
RMM:  14    -0.236566564684E+02    0.10507E+02   -0.25548E+01  3024   0.434E+01    0.372E+00
RMM:  15    -0.238848699589E+02   -0.22821E+00   -0.90307E+00  3024   0.222E+01    0.667E+00
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 4 with PID 29130 on node login1 exited on signal 24 (CPU time limit exceeded).
--------------------------------------------------------------------------
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2012-04-19 08:58:37
个人觉得可能是编译时优化级别设高了,或者是mpi编译有问题。
2楼2012-04-19 08:57:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

c03185

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by guohuazhong at 2012-04-19 08:57:39:
个人觉得可能是编译时优化级别设高了,或者是mpi编译有问题。

不是阿。
集群管理员的回复是:
could it be that you launched your job on the login node? You're not supposed to launch jobs on the login node.
You should launch a job using the resource manager torque with the qsub command. You will also need to create a jobscript.
么意思阿?
3楼2012-04-19 17:42:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)


fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖交流! 2012-04-21 11:55:35
管理员的意思是在你登录的节点上计算,建议你qsub提交任务。
4楼2012-04-19 22:28:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

c03185

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by guohuazhong at 2012-04-19 22:28:57:
管理员的意思是在你登录的节点上计算,建议你qsub提交任务。

qsub怎么提交VASP运行阿?
请指导
5楼2012-04-20 03:49:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ahu1221

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖交流! 2012-04-20 09:26:19
c03185: 金币+15, ★★★很有帮助 2012-04-22 08:25:17
应该是类似于bsub的吧,你登入系统的时候会有提示的,你注意看下,我们这用的是bsub作业管理系统,提交作业的命令式bsub -q long(作业对列,有normal long等) -n 8(作业使用的核数,是你节点上单棵cpu上核的个数的倍数最好) ./<你的vasp的路径>vasp,我习惯将在我的用户目录下建一个bin文件夹,然后将vasp拷到这个文件夹里,然后设置环境变量vi ./bashrc,加入export PATH=$PATH:~/bin/。然后./vasp就可以直接用~/bin/vasp代替。这样比较简单,还不会对你编译的vasp文件夹造成啥影响
交流学习,求进步
6楼2012-04-20 09:21:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

c03185

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ahu1221 at 2012-04-20 09:21:13:
应该是类似于bsub的吧,你登入系统的时候会有提示的,你注意看下,我们这用的是bsub作业管理系统,提交作业的命令式bsub -q long(作业对列,有normal long等) -n 8(作业使用的核数,是你节点上单棵cpu上核的个 ...

还需要写个PBS的脚本吗?
7楼2012-04-21 04:12:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

c03185

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ahu1221 at 2012-04-20 09:21:13:
应该是类似于bsub的吧,你登入系统的时候会有提示的,你注意看下,我们这用的是bsub作业管理系统,提交作业的命令式bsub -q long(作业对列,有normal long等) -n 8(作业使用的核数,是你节点上单棵cpu上核的个 ...

能不能传我一个PBS脚本阿?
8楼2012-04-21 05:18:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ahu1221

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by c03185 at 2012-04-21 05:18:38:
能不能传我一个PBS脚本阿?

不需要脚本,可以直接运行的
交流学习,求进步
9楼2012-04-21 09:25:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

c03185

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by ahu1221 at 2012-04-21 09:25:29:
不需要脚本,可以直接运行的

管理员说用脚本,而且采用squb提交任务
10楼2012-04-21 16:27:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 c03185 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 385分 生物学(071000)求调剂 +11 qf626 2026-04-01 11/550 2026-04-05 17:35 by Ecowxq666!
[考研] 266分,一志愿电气工程,本科材料,求材料专业调剂 +8 哇呼哼呼哼 2026-04-02 9/450 2026-04-05 17:14 by lbsjt
[考研] 328分调剂 +6 门men 2026-04-04 6/300 2026-04-05 13:40 by imissbao
[考研] +5 化工专硕323分 2026-04-04 5/250 2026-04-05 08:02 by 544594351
[考研] 材料工程085601数二英一335求调剂 +6 双马尾痞老板2 2026-03-31 6/300 2026-04-04 22:29 by hemengdong
[考研] 0854求调剂 +4 assdll 2026-04-03 4/200 2026-04-04 22:17 by hemengdong
[考研] 296材料专硕求调剂 +21 202451007219 2026-04-02 22/1100 2026-04-04 21:48 by hemengdong
[考研] 材料专业383求调剂 +8 郭阳阳阳成 2026-04-03 8/400 2026-04-04 10:29 by Rednal.
[考研] 求生物学专业调剂-332分 +5 云朵遛弯指南 2026-04-04 5/250 2026-04-04 10:05 by rzh123456
[考研] 317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂 +6 YinTai 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:30 by 无际的草原
[考研] 334求调剂 +9 Trying] 2026-03-31 9/450 2026-04-03 15:18 by 琢珥丶
[考研] 085600专硕材料与化工348分求调剂 +10 上学啦! 2026-04-01 11/550 2026-04-03 14:13 by 百灵童888
[考研] 312求调剂 +6 小小墨123 2026-04-02 7/350 2026-04-03 07:32 by jsw79
[考研] 346求调剂 +5 郑诚乐 2026-04-02 5/250 2026-04-02 16:38 by SZW_UJN
[考研] 材料工程322分 +8 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 8/400 2026-04-02 11:53 by 3041
[考研] 296求调剂 +4 汪!?! 2026-03-31 7/350 2026-04-01 22:04 by 客尔美德
[考研] 江苏科技大学招材料研究生 +4 Su032713. 2026-04-01 5/250 2026-04-01 22:03 by cccchenso
[考研] 考研材料工程351分调剂 +5 整个好的 2026-03-31 5/250 2026-04-01 09:36 by topgun2009
[考研] 江苏苏北高校诚邀调剂同学 +3 zzll406 2026-03-31 3/150 2026-03-31 16:54 by 及时行乐fan
[考研] 一志愿大连理工大学材料求调剂 +6 Gymno 2026-03-30 6/300 2026-03-31 07:26 by 无际的草原
信息提示
请填处理意见