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souledge专家顾问 (著名写手)
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用MPIF90编译后的Siesta并行出错,串行没事……
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近来做CEM计算,发现VASP和PWscf的效率在大团簇时很纠结,所以考虑用速度更快的Siesta来跑~没想到…… 下载的是3.1版的Siesta,系统为CentOS 6.2 x86_64,Fortran和C的编译器分别是: 并且使用MPICH2的最新稳定版mpich2 1.4.1p1,使用ifort和icc编译的。 编译的arch.make文件如下: 编译顺利通过。但是计算自带的例子MgO时,会在初始化计算时出错,出错内容是: 看起来是MPI的几个进程之间通信有问题。 由于电脑有8GB内存,并且只测试了双核并行,而且同时并行测试PWscf,VASP,Abinit都运行良好,说明MPICH2本身使用没有问题。 那么只能是编译Siesta时,并行并没有处理好。 看到2年前在Siesta的Mail list里有人有相同的问题,但是最后也没人给出个很明确的答复来…… 测试了一下用自带的BLAS和LAPACK库,还是同样错误。说明问题很可能出现在Blacs和ScaLapack这两个库上……而Siesta比较郁闷人的是必须要用这俩库…… 当不使用mpirun,直接用siesta < input的方式串行运行时,就不会有任何问题…… 这个问题有什么好的解决方法么…… |
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souledge
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