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沐索津

新虫 (初入文坛)

[求助] vasp5.2 并行编译 BLAS问题 求助

机器 ubuntu12.04 安装了ifort2013.sp1(自带了MKL),mpich2,fftw3,
vasp.lib 已通过编译
vasp5.2 编译时 mkl部分这样
(一)
124行 BLAS=-L/opt/intel/composer_xe_2013_sp1.0.080/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core –lpthread
这时编译到最后了出错说
linear_response.o setlocalpp.o  wannier.o electron_OEP.o electron_lhf.o twoelectron4o.o ratpol.o screened_2e.o wave_cacher.o chi_base.o wpot.o local_field.o ump2.o bse.o acfdt.o chi.o sydmat.o    fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d.o   /usr/local/fftw/lib/libfftw3.a -L../vasp.5.lib -ldmy ../vasp.5.lib/linpack_double.o ../vasp.5.lib/lapack_double.o  -L/opt/intel/composer_xe_2013_sp1.0.080/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core –lpthread
ifort: error #10236: File not found:  '–lpthread'
make: *** [vasp] 错误 1

(二)
124行 BLAS=-L/opt/intel/composer_xe_2013_sp1.0.080/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core
编译可以生成vasp,但(1)给定4个输入文件 输入vasp,它就算5行,后面就出错一直刷屏,但不是计算了,应该是出错了,
                                  (2)输入并行命令mpirun -np 2 vasp,它就
                                            /opt/intel/composer_xe_2013_sp1.0.080/mpirt/bin/intel64/mpirun:
                                            96: .: Can't open /opt/intel/composer_xe_2013_sp1.0.080/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh
                          是不是mpd没启动呢?
# mkl.10.0
# set -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV in the CPP lines
#BLAS=-L/opt/intel/composer_xe_2013_sp1.0.080/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core –lpthread
BLAS=-L/opt/intel/composer_xe_2013_sp1.0.080/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core

# even faster for VASP Kazushige Goto's BLAS
# http://www.cs.utexas.edu/users/kgoto/signup_first.html
# parallel goto version requires sometimes -libverbs
#BLAS=/usr/local/lib/libgoto_copperminep-r1.09.so

# LAPACK, simplest use vasp.5.lib/lapack_double
LAPACK= ../vasp.5.lib/lapack_double.o

# use the mkl Intel lapack
#LAPACK= -lmkl_lapack
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nanost

木虫 (知名作家)

Dr.

共同关注,我采用composer_xe_2013.5.192也遇到了同样问题.
合成硫化锆、硫化钛、Al2S3、Li2S及Li6PS5Cl等固体电解质,稀土硫化物:硫化钆、硫化铥、硫化钬、硫化镱、硫化铕、硫化铽、硫化镨、硫化钕、硫化钐、硫化镝等
2楼2013-11-25 20:01:01
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沐索津

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by nanost at 2013-11-25 20:01:01
共同关注,我采用composer_xe_2013.5.192也遇到了同样问题.

问题解决了,换回2011就没问题了,全部通过,也可以并行。。。
3楼2013-11-26 13:30:10
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tomcat2008

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请确认,你是使用Intel MPI来编译vasp的。一般情况下,Intel Compiler仅仅包含了impi的运行库,没有mpif90和mpicc等并行编译环境。若使用的是其它的mpi编译的或者OS自带的mpi并行编译环境,则需要在运行vasp的时候,使用绝对路径的方式运行。
另,
    新的mpi运行版本,一般使用mpiexec.hydra接口,很少再使用mpd方式了。请仔细研究mpi的运行帮助
4楼2013-11-26 13:37:54
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nanost

木虫 (知名作家)

Dr.

但我重新按装系统,换成ifort2011后,还是不能顺利编译。
合成硫化锆、硫化钛、Al2S3、Li2S及Li6PS5Cl等固体电解质,稀土硫化物:硫化钆、硫化铥、硫化钬、硫化镱、硫化铕、硫化铽、硫化镨、硫化钕、硫化钐、硫化镝等
5楼2013-11-28 13:06:06
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