| 查看: 1573 | 回复: 0 | ||
wangxn06金虫 (正式写手)
|
[求助]
mpi并行计算，错误提示“p1_xxxxx: p4_error: interrupt SIGSEGV: 11”是什么意思？
|
|
MPI并行计算的程序，之前在另一台集群上跑是可以的，当时用的是intel 编译器，MPICH2，LINUX系统的版本不太清楚。现在换了一个集群也是linux系统，编译器为GNU,编译命令为mpif77，但是作业提交后总是出现这样的错误 p1_xxxxx: p4_error: interrupt SIGSEGV: 11 在网上搜了一下，这种叫 段错误，与内存有关。找到的3种解决办法（具体情况不同）： 1. http://old.blog.edu.cn/user1/11542/archives/2007/1652099.shtml 在并行作业中可能会遇到"p1_xxxxx: p4_error: interrupt SIGSEGV: 11"的错误，而且作业会停止。 这个错误可能是因为某个进程中出现了段错误引起的,出现了 illegally read/write not-owned memory location的情况。解决的一种办法是：如果内存容量比较大，通过设置环境变量P4_GLOBMEMSIZE 增加其值，比如： export P4_GLOBMEMSIZE=536870912增加到使用512M的内存。 2. http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1542953 最后发现是数据长度的问题，这是由于编译MPI自动识别的整数型长度是4位的，而我在编译VASP.5.LIB时没有删掉PGF后面的-i8选项，结果两边冲突，导致内存故障报错。重新编译VASP.5.LIB，然后编译VASP，测试成功 3. http://blog.sina.com.cn/s/blog_40bf31b5010003cu.html p1_xxxxx: p4_error: interrupt SIGSEGV: 11 这个错误可能是因为某个进程中出现了段错误引起的, 自己出现过的错误: 1.只在一个进程中给指针申请空间,而在其他进程没有申请,所以在广播的时候出错 2.在一个进程中联接mysql数据库,而在所有的进程中断开数据库的联接 网上有个人说的很好: "There are 2 things to check. * Run one of the test programs like pi3.f or cpi.c to see whether your cluster's OK. * if it is, the fault is in your code. See if you're exceeding array bounds or accessing memory which you haven't allocated, There's a SIGSEGV error - that's a segmentation violation. That might explain stuff like bm_list_21829: p4_error: interrupt SIGINT: 2 Once you have a seg. violation, all the 4 processors are sent a signal to interrupt the process (SIGINT). Signals are defined in /usr/include/sys/signal.h (at least on the SGIs; might be different on other systems). " 2. p1_10401: p4_error: : 14 1 - MPI_BCAST : Message truncated [1] Aborting program ! [1] Aborting program! 这个也是由于mpi_bcast的接收空间不够引起的,要在mpi_bcast之前分配足够大的空间,这样就不会truncated了 请问各位怎么对程序做改动，才能避免问题的出现？什么是段错误？ [ Last edited by wangxn06 on 2012-3-19 at 21:55 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
26申博推荐：南京航空航天大学国际前沿院光学方向招收博士生！
已经有1人回复
-
如何从铁电相到顺电相。
已经有1人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有227人回复
-
各位大佬，求一份最新Wien2k版本作为学习用途
已经有0人回复
-
南科大活性流体和软物质课题组诚招2027级博士、硕士研究生和博后
已经有40人回复
-
瑞典林雪平大学博士后招聘｜PEC Water Splitting 方向
已经有24人回复
-
PRB投稿，Acknowledgment sent to author状态十天了
已经有3人回复
-
PVA溶解
已经有1人回复
-
基金申请
已经有44人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
语言证明内容出现两个单词用法小错误这个问题严重吗？
已经有10人回复
- checkcif的错误不知道怎么解决
已经有4人回复
- 初级入门错误 求助
已经有5人回复
- MPI的安装(管理员和普通用户均可)
已经有34人回复
- lev00安装出现错误……
已经有4人回复
- 晶体解析，checkcife的错误不会处理，请高手指点
已经有5人回复
- 求教导师CV, 老师的简历中出现好几个错误，估计是粘着过程中导致的。我该怎么办
已经有4人回复
- 求助！win7下运行vc6.0时出现msdev错误怎么办？？？
已经有1人回复
- 【心得】word提示出现错误，提供三种完全版正解
已经有6人回复
- 【求助】用siesta计算出现的问题
已经有3人回复
- 【求助】请求帮助：测得一个晶体数据有这么多错误！怎么办？
已经有4人回复
- 倾情奉献：［投稿英文期刊］中国人常犯的错误
已经有50人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
15