24小时热门版块排行榜     石溪大学接受考研调剂申请>

申请当版主 | 存档区 |应助排行|模拟EPI排行 小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock 订阅
【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂

管理团队 (金币库 69145.3 充值 )

主管区长：
月只蓝小红豆
主管版主：
abinitio沙漠猎人
11%最高出勤率

杰出贡献者

专家顾问：
pigrassoxox6085lsloneilbrucefanjerkwin
荣誉版主：
wuli8lei0736nono2009fegg7502ghcacjzzy870720zuuv2010御剑江湖yjcmwgkjiaoyixiongcenwanglaiben_ladengljw4010
荣誉成员：
余泽成

模拟EPI 牛人榜 总排行 7日排行 30日排行 90日排行

版块说明

  • 欢迎访问计算模拟版新子版计算机集群配置、组建、管理和维护
    计算模拟区：   |--------第一性原理
                          |--------量 子 化 学
                          |--------计 算 模 拟
                          |--------分 子 模 拟
                          |--------仿 真 模 拟
                          |--------程 序 语 言
                          |--------RCS编辑部                    欢迎访问计算模拟区各个板块，讨论学术问题
    • 4511/512345下一页
    全部 专家会诊 MS LAMMPS/DL_POLY Gromacs/Amber/NAMD DS/Sybyl/Autodock Monte Carlo ME/Gulp Hyperchem CPMD/CP2K 资源 其他 版务
    回帖排序 发表排序 刷新页面  |  交流  |  求助  |  资源精华区 作者 最后发表
    [热点] 学硕专硕 小蜗牛* 2024-04-27 刚刚
    [DS/Syby ] DS一直实在running状态 50 (3/431) huantao12 2021-06-21 2024-03-27 07:31:56 by 芝士啵啵酥
    [DS/Syby ] autodock蛋白和盒子参数如何确定 (10/235) hxj78 2024-03-15 2024-03-15 17:33:45 by 坩埚供应商
    [DS/Syby ] autodock问题求助 (17/690) 天不负者 2022-06-03 2024-03-15 12:22:44 by hxj78
    [DS/Syby ] 请教autodock分子对接结果合理性和相互作用 (11/291) hxj78 2024-02-29 2024-03-08 06:05:58 by therotyonth
    [DS/Syby ] autodock保存配体为pdbqt失败 500 (0/185) 阿飞4869 2024-02-26 2024-02-26 20:28:56 by 阿飞4869
    [DS/Syby ] 分子对接游离分子或者基团怎么处理 (0/317) hxj78 2024-01-23 2024-01-23 10:45:14 by hxj78
    [DS/Syby ] autodock和pymol的氢键显示 5 (0/384) 风华cp 2024-01-05 2024-01-05 09:50:42 by 风华cp
    [DS/Syby ] alphafold 数据库的蛋白可以直接用作分子对接吗？ 5 (2/640) peaqueen 2023-10-21 2023-12-11 22:03:36 by longdlut
    [DS/Syby ] vasp计算分子动力学，使用VMD做非晶的径向分布函数（rdf），但是最不归一    ( 1 2 ) 15 (11/4897) suncoffee 2020-06-07 2023-12-09 16:24:21 by wxrui
    [DS/Syby ] Sail_Vina_2.0_beta0.2发布（Vina虚拟筛选/反向对接图形界面） (15/3990) beikwx 2018-11-20 2023-11-24 08:02:02 by neohjh
    [DS/Syby ] 初始建模和运行后相变问题 10 (5/591) 自信胜黄金 2023-11-03 2023-11-20 11:08:35 by qiyangtt
    [DS/Syby ] 500 RMB 求 Discovery studio 4.5 或 2017r2，或2018完整版的    ( 1 2 3 4 5 6 ) 5 (55/9915) bffgbgff 2018-06-08 2023-11-13 07:48:57 by qiyangtt
    [DS/Syby ] sybyl对接结果不显示CScore结果是为什么呢？ 5 (0/361) athenadai219 2023-11-10 2023-11-10 08:47:58 by athenadai219
    [DS/Syby ] Discovery Studio 2019中力场为什么只有CHARMM系列,打不开其他力场呢？ 10 (0/407) 一页书cht 2023-11-09 2023-11-09 21:18:33 by 一页书cht
    [DS/Syby ] 多糖分子对接问题 10 (1/858) 开元天宝 2022-04-23 2023-11-09 19:36:22 by 一页书cht
    [DS/Syby ] autodock保存对接参数文件dpf时总是出现Indexerror: list index out of range 290 (5/1084) chentg 2022-01-17 2023-11-06 13:33:13 by 找自己123
    [DS/Syby ] autodock报错 20 (1/950) o螃蟹小姐 2023-09-26 2023-11-01 15:46:20 by 熟人，陌生人
    [DS/Syby ] 求助Autodock的MGL-tools报错问题 10 (3/795) cw鑫哥 2023-05-17 2023-11-01 12:48:10 by 熟人，陌生人
    [DS/Syby ] Ds分子对接 (9/583) 玄呀呀呀 2023-03-05 2023-10-26 16:26:12 by 李小白不白
    [DS/Syby ] DS (1/657) 浩离桑 2023-04-03 2023-10-17 06:04:59 by blue_cat
    [DS/Syby ] 小分子和DNA对接 10 (0/392) 书生之意 2023-07-22 2023-07-22 10:20:11 by 书生之意
    [DS/Syby ] 名词解释 (1/492) 浩离桑 2023-04-03 2023-04-04 09:43:52 by 浩离桑
    [DS/Syby ] 蛋白质同源建模，模板序列比目的序列短，构建出的模型缺失三十个氨基酸，应该怎么办？ 5 (0/258) _草莓圣代_ 2023-03-06 2023-03-06 13:57:42 by _草莓圣代_
    [DS/Syby ] 多模板同源建模 (1/518) 红豆，大红豆 2019-11-01 2023-03-06 10:41:14 by _草莓圣代_
    [DS/Syby ] 求指教DS软件的对接 50 (0/296) wqqxz 2023-03-05 2023-03-05 15:57:01 by wqqxz
    [DS/Syby ] 请教各位前辈，autodock分析dlg文件打不开的问题 15 (0/342) 化学小朋友1 2023-02-28 2023-02-28 10:26:31 by 化学小朋友1
    [DS/Syby ] discovery studio分子对接的蛋白质准备失败，系统报错，求助各位大佬 6 (评阅+6) (0/431) 蒋布斯 2023-02-23 2023-02-23 09:34:01 by 蒋布斯
    [DS/Syby ] 用药效团进行虚拟筛选发现没有对应的小分子这正常吗 5 (2/283) 玄呀呀呀 2022-10-27 2022-11-07 08:14:39 by 哲里卓气
    [DS/Syby ] 分子对接 DS 30 (0/311) 玄呀呀呀 2022-11-03 2022-11-03 19:06:14 by 玄呀呀呀
    [DS/Syby ] discovery studio    ( 1 2 ) 20 (12/2733) gy19890111 2020-03-05 2022-10-24 14:02:19 by gao1zheng
    [DS/Syby ] autodock打分第一的结合构象数据怎么分析？ 75 (1/862) 兴昌孙 2021-02-14 2022-10-17 17:24:38 by 什么么什呀
    [DS/Syby ] linux系统下vina批量分子对接 5 (0/286) Hygeia云 2022-09-24 2022-09-24 22:41:54 by Hygeia云
    [DS/Syby ] Autodocktools--grid准备蛋白pdbqt文件报错，求各位大佬指点 50 (0/308) 格桑梅朵lwy 2022-09-08 2022-09-08 09:23:31 by 格桑梅朵lwy
    [DS/Syby ] DS分子动力学 第五步production的time step设置问题 (5/1436) 77qa 2018-04-18 2022-08-13 13:20:26 by 851086861
    [DS/Syby ] DS分子动力优化时间特别长 5 (3/413) 小甜瓜11 2022-04-28 2022-08-13 13:07:50 by 851086861
    [DS/Syby ] Discovery studio版权 (4/1645) 15152350611 2021-08-12 2022-08-11 19:08:59 by 他好冷
    [DS/Syby ] [已完结]DS 2016 一直处于running状态，不显示结果 (1/293) zsqnds 2022-08-08 2022-08-08 22:46:43 by ytliuming
    [DS/Syby ] Discovery Studio中LibDock Score的计算原理是什么？ 10 (1/376) 黎明之前01 2022-07-12 2022-08-03 08:07:36 by blue_cat
    [DS/Syby ] Discovery Studio提示change server (24/1410) 化工悠悠 2022-04-13 2022-08-01 19:43:57 by 肖肖。。
    [DS/Syby ] discovery studio2021 linux运行速度比windows慢 20 (1/423) CLao 2022-06-21 2022-07-07 21:46:07 by Maxis
    [DS/Syby ] autodock运行autogrid出现warning，这是咋回事呢？ (0/397) 天不负者 2022-06-18 2022-06-18 20:21:37 by 天不负者
    [DS/Syby ] [已完结]小白求助 (0/325) 天不负者 2022-06-07 2022-06-07 19:51:41 by 天不负者
    [DS/Syby ] sybyl安装求助 10 (1/1010) 没尾巴的猴子 2018-06-30 2022-05-31 11:46:54 by wdzvictor
    [DS/Syby ] 20金币求Autodock及mgltool的windows安装包 20 (8/1245) hlc11111 2018-10-11 2022-05-30 20:24:35 by yhk1008
    [DS/Syby ] 求Discovery Studio 4.0安装包及教程，感激不尽 100 (7/2090) yangjiepanda 2021-09-01 2022-05-29 07:46:15 by dengbindarcy
    [DS/Syby ] 电脑刚安装薛定谔软件，但是在准备配体或者受体的时候就错误，不知道什么原因？ 1 (12/1465) feg007 2020-02-11 2022-05-25 06:56:19 by 54wangwei
    [DS/Syby ] 关于DS的De Novo Receprto模块 5 (1/407) 吐个泡泡22 2022-05-15 2022-05-21 21:48:59 by 是欠欠啊
    [DS/Syby ] Discovery Studio各版本培训资料    ( 1 2 ) (52/6940) 谷歌帝 2018-01-25 2022-05-14 22:23:08 by 吐个泡泡22
    [DS/Syby ] 小分子结构改变 5 (3/661) 墨玉丶溪卿 2022-03-21 2022-04-28 16:50:00 by 南念chi
    [DS/Syby ] 计算机辅助药物设计 (2/467) 楠楠子 2022-04-24 2022-04-27 09:44:45 by shabeir
    [DS/Syby ] 如何用DS构建某个氨基酸缺失的蛋白质突变体结构 5 (1/429) ryyyyyyyyyy 2022-02-28 2022-04-25 22:54:05 by ymj002
    [DS/Syby ] 请问最近PDB网站如何打开 5 (7/994) darcys 2022-04-15 2022-04-25 22:49:01 by ymj002
    [DS/Syby ] discovery studio 10 (3/931) Tiancccccc 2021-12-17 2022-04-25 19:52:49 by ymj002
    [DS/Syby ] 有几篇关于生信分析的数据库设计外文文献看不懂，恳请大佬辅导文献!（偏算法） 300 (2/384) 865794910 2022-04-01 2022-04-12 15:22:09 by 865794910
    [DS/Syby ] 求a，b，r环糊精，羟丙基b环糊精，羟丙基r环糊精的PDB文件 10 (3/606) ggk1218 2021-06-02 2022-03-29 07:50:38 by ggk1218
    [DS/Syby ] autodock vina对接，氢键和疏水基团比较多的结合物打分却比那些少的结合物打分要低？ (5/3132) kieael 2018-03-22 2022-03-28 19:18:45 by 拼命幸福寂静
    [DS/Syby ] 蛋白尺寸，以这种格式*nm×*nm×*nm 10 (1/601) 绿茶QJM 2022-03-17 2022-03-18 15:45:08 by 绿茶QJM
    [DS/Syby ] 分子对接技术 (0/322) 紫流苏樱雪 2022-02-26 2022-02-26 21:14:11 by 紫流苏樱雪
    [DS/Syby ] 分子动力学学术救急 5 (0/274) xuanhongyun 2022-01-26 2022-01-26 14:20:24 by xuanhongyun
    [DS/Syby ] discovery studio 疑难问题 (1/913) boom米花 2022-01-14 2022-01-18 17:57:45 by ohnesie
    [DS/Syby ] 请问谁有discovery studio软件安装包，求大神分享一下    ( 1 2 ) (14/2677) 5009918144 2019-06-06 2022-01-07 16:48:42 by 纯白色123李
    [DS/Syby ] 配体初筛 5 (0/266) kyriewang 2022-01-05 2022-01-05 12:16:44 by kyriewang
    [DS/Syby ] 对接结果显示success，但是却是0poses，是什么原因呢，求大神指教。 (6/1490) wenhui1024 2018-05-31 2021-12-29 11:51:26 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 能做分子共价对接的软件有哪些 (4/1981) 029539zbb 2018-06-07 2021-12-29 11:45:44 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 想做一些3d-qsar建模 和分子对接 需要助服务器吗 5 (8/2483) cewinhot 2018-07-04 2021-12-29 11:43:26 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 在用sybyl X2.0做分子表单打分时碰到的问题 20 (8/2314) 彼岸花开丶 2018-08-15 2021-12-29 09:14:13 by 一代米哟
    [DS/Syby ] AutoDock vina在Windows 7中对很多的小分子抑制剂进行批量对接和分析，怎么编写命令？ 5 (3/2652) xiaoqian08 2018-08-27 2021-12-29 09:05:11 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 求助！DS2016做分子对接的时候报错 5 (2/1151) zzy329372570 2018-11-02 2021-12-29 08:51:22 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 石墨烯和蛋白质对接 100 (5/1105) 阿拉很强大 2020-03-29 2021-12-23 11:22:05 by 1142338573
    [DS/Syby ] ZINC15 下载下来的小分子怎么批量重命名 100 (2/633) rodickholm 2021-12-17 2021-12-18 08:12:30 by 海田01
    [DS/Syby ] 核酸与蛋白的对接 10 (2/595) Tiancccccc 2021-12-14 2021-12-15 20:30:42 by Tiancccccc
    [DS/Syby ] 请问disvovery studio能不能模拟两个小分子的键合过程以及它们的降解过程？ 10 (0/340) BiomartGuo 2021-12-14 2021-12-14 11:36:50 by BiomartGuo
    [DS/Syby ] 求助DS4.5分子对接，点突变的知识，另外谁有DS4.5的license password ? 30 (2/1401) 20130202 2018-12-24 2021-12-09 12:58:13 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 请问autodock做配合物的分子对接怎么做，和正常的小分子对接有什么区别吗 100 (5/1489) majunjie3612 2018-12-25 2021-12-09 12:53:59 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 有没有这样一种分子对接的软件？？？ (4/1952) 药剂小学生 2019-01-11 2021-12-09 12:49:04 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 推荐一个基于vina的分子对接软件 (12/1899) xufund 2019-01-13 2021-12-09 12:47:48 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 有没有做分子对接的虫友？最好用免费软件autodock, 可以有偿合作 (4/907) shuad 2019-01-19 2021-12-09 12:43:16 by 一代米哟
    [DS/Syby ] discovery studio 关于原配体对接前后RMSD 5 (4/2315) chenpan1989 2019-02-19 2021-12-03 13:21:16 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 急 急 急 DS (4/588) 潇潇％ 2019-03-18 2021-12-03 13:18:10 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 求助，必有重谢！ 200 (5/650) 药化小霸王 2019-04-19 2021-12-03 12:46:51 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 求助，用vina做分子对接才能同时对接多个配体小分子    ( 1 2 ) 5 (12/2781) zmcwangyang 2019-07-27 2021-12-03 12:36:55 by hnhkice
    [DS/Syby ] 请大神指点 100 (2/471) 药化小霸王 2019-04-24 2021-12-03 12:34:41 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 求助，做分子对接时配体是否都需要预先能量最小化吗？ 2 (11/1771) zmcwangyang 2019-08-07 2021-12-03 11:00:40 by chenhuanlong
    [DS/Syby ] 分子对接求助 200 (9/1308) zjj_0512 2019-08-08 2021-12-03 07:58:03 by 一代米哟
    [DS/Syby ] autodock使用问题求助    ( 1 2 ) 100 (12/1742) zjj_0512 2019-08-21 2021-12-02 15:02:02 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 请问一下分子对接酶蛋白中的血红素HEM需要去掉吗？为什么？ 5 (3/964) zmcwangyang 2019-09-06 2021-12-02 14:53:17 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 怎么确定受体和配体结合的活性口袋？ (6/2770) 萌翻啊 2019-09-26 2021-12-02 14:32:52 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 分子对接时，底物配体与蛋白受体对接时，需不需要加上金属辅因子 5 (2/1263) 酷儿ccc 2019-10-25 2021-12-02 13:31:43 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 求助sybyl x2.0教程 500 (2/987) zjxaiwxl 2019-10-27 2021-12-02 13:30:07 by 一代米哟
    [DS/Syby ] autodock里什么情况下把酰胺键设置为可旋转的 (4/979) 吃书少年 2019-11-20 2021-12-02 13:23:04 by 一代米哟
    [DS/Syby ] Autodock'中怎么加入小分子配体 50 (3/1218) 叶落北国 2020-01-07 2021-12-02 12:47:46 by 一代米哟
    [DS/Syby ] 解离常数理论计算 24 (4/910) 舞翼hy飘 2020-03-15 2021-12-02 08:28:25 by hnhkice
    [DS/Syby ] gridbox后，进行run autogrid时小窗口闪退 8 (0/1008) xxx踱 2021-11-28 2021-11-28 10:38:51 by xxx踱
    [DS/Syby ] DS分子对接失败 5 (4/1456) treating 2020-04-05 2021-11-26 16:16:28 by cngdkpmg
    [DS/Syby ] 江湖救急呀兄弟姐妹们 15 (4/612) godwmh 2020-04-05 2021-11-26 16:15:56 by cngdkpmg
    [DS/Syby ] 蛋白质没有配体可以进行分子对接嘛 5 (5/1399) 王小稳na 2020-04-14 2021-11-26 16:13:52 by cngdkpmg
    [DS/Syby ] Autodock进行docking时无法导入蛋白pdbqt文件 10 (4/2448) RiyoMiyano 2020-04-24 2021-11-26 16:07:52 by cngdkpmg
    [DS/Syby ] 分子对接蛋白建模求助 100 (1/479) shipoche 2020-06-10 2021-11-26 15:56:01 by cngdkpmg
    [DS/Syby ] 对接分子出现过渡金属 (1/408) 水禾方方土 2020-06-18 2021-11-26 15:49:19 by cngdkpmg
    [DS/Syby ] Autodock分子对接要多久时间啊 5 (8/2058) well9103 2020-06-25 2021-11-26 15:32:15 by cngdkpmg
    4511/512345下一页
    相关版块跳转
    查看