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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 关于SYBYL分子对接的一些常见问题解答
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没尾巴的猴子

铁虫 (小有名气)
★
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请教下楼主，蛋白里没有配体，根据活性位点对接，应该怎么对接啊?试了很久都不行

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11楼2018-07-08 20:52:34
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 没尾巴的猴子 at 2018-07-08 20:52:34
请教下楼主，蛋白里没有配体，根据活性位点对接，应该怎么对接啊?试了很久都不行

2.0的版本bug，其他版本的话看下教程
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12楼2018-07-09 11:44:00
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钟冬晓

禁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
13楼2019-07-26 14:53:05
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张雨欣

新虫 (初入文坛)
★
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你好，想问一下想做金属离子与蛋白对接，金属离子文件怎么准备

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14楼2019-08-24 14:45:02
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南中医赵四

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
您好我想问一下蛋白的girdbox参数怎么找

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15楼2019-08-25 11:27:20
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shentt2019

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主请问如果蛋白分子有两条以上的链都是有结合位点的链，还要删除只剩一条链吗？对每一条链进行分开研究进行分子对接

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16楼2019-11-17 22:53:12
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Yongqi琦

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问sybyl中的match具体如何处理，好疑惑啊
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17楼2020-08-20 10:45:29
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mo轩～

新虫 (初入文坛)
★
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请问构建药效团模型的时候没有用到原配体对最终筛选出来的分子的真阳性有影响吗？用SYBYL2.0做的分子对接，与在DS软件查看其2D作用图是否会一致（氢键、疏水）？经过虚拟筛选和分子对接后，靶点预测的结果不理想怎么办？是否还能继续往下做或该怎么继续做下去？谢谢解答
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18楼2020-12-11 12:21:35
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喜乐呀呀呀

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
大神，请问SYBYL对接之后怎么保存为PDB格式啊

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19楼2022-12-05 11:50:13
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