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supengchen

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[求助] 请问：Autodock计算导出的小分子结构有问题，请问如何解决! 已有3人参与

请问：Autodock计算导出的小分子结构/构象有问题，如下图（第一个是导出的结果，第二张计算之前的结构显示图，第三张是结构式），请问如何解决！

请问：Autodock计算导出的小分子结构有问题，请问如何解决!

分子计算问题求助.JPG

请问：Autodock计算导出的小分子结构有问题，请问如何解决!-1

计算前分子模型.JPG

请问：Autodock计算导出的小分子结构有问题，请问如何解决!-2

原结构1.JPG

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1楼 2014-03-12 13:40:02

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pymol

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重新优化小分子的结构，小分子结构优化不好会出现此问题

2楼2014-03-12 17:58:38

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姜志文

新虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

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月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-14 08:15:46

你分子的pdb文件是用什么做的，是chem3d吗，如果是，看看是不是本身有问题。。。

[ 发自小木虫客户端 ]

3楼2014-03-13 00:02:56

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agent99

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【答案】应助回帖

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月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-14 08:15:51

结构没什么问题吧，那个键应该是显示的问题

理论与计算化学，化学物理，生物物理

4楼2014-03-13 05:15:43

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supengchen

银虫 (正式写手)

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我的其他的分子中有这样的结构的（，但是都好的，就是这个不好，应该不是chem3D的原因吧！

新阶段，新起点！

5楼2014-03-14 11:13:40

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墨玉丶溪卿

本帖内容被屏蔽

6楼2022-03-21 14:01:22

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