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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » autodock何时完成计算
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姜志文

新虫 (小有名气)

[求助] autodock何时完成计算 已有2人参与

前面autogrid已经算完了，命令符显示successful completion ，然后继续打开autodock，却一直没有反应，是结束了么？打开analyze中的conformation中的load提示current clusterer has no clusterings，是因为没算完的缘故么？求教大神……
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1楼 2014-02-26 23:37:30
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tbw258

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-27 16:59:45
月只蓝: 金币+5, 鼓励新手参与讨论。 2014-02-27 16:59:52
你在grid 的时候格子体积尽量小， docking是比较耗时耐心等着吧 等个48小时也很正常
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我来了~~
2楼2014-02-27 16:37:56
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姜志文

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tbw258 at 2014-02-27 16:37:56
你在grid 的时候格子体积尽量小， docking是比较耗时耐心等着吧 等个48小时也很正常

谢谢，等了三个点，终于完成了。它给了我十个可能的结合位点和结合能，可是结合位点双击出错啊，您知道原因吗？

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2014-02-27 17:14:48
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-28 18:17:32
结合位点出错？
选择的gridbox位置不对吧，保证选择的box位置在活性中心即可。。。。。
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4楼2014-02-28 08:23:48
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