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姜志文

新虫 (小有名气)

[求助] autodock何时完成计算 已有2人参与

前面autogrid已经算完了,命令符显示successful completion ,然后继续打开autodock,却一直没有反应,是结束了么?打开analyze中的conformation中的load提示current clusterer has no clusterings,是因为没算完的缘故么?求教大神……
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tbw258

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-27 16:59:45
月只蓝: 金币+5, 鼓励新手参与讨论。 2014-02-27 16:59:52
你在grid 的时候格子体积尽量小, docking是比较耗时耐心等着吧 等个48小时也很正常
我来了~~
2楼2014-02-27 16:37:56
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姜志文

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tbw258 at 2014-02-27 16:37:56
你在grid 的时候格子体积尽量小, docking是比较耗时耐心等着吧 等个48小时也很正常

谢谢,等了三个点,终于完成了。它给了我十个可能的结合位点和结合能,可是结合位点双击出错啊,您知道原因吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-02-27 17:14:48
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-28 18:17:32
结合位点出错?
选择的gridbox位置不对吧,保证选择的box位置在活性中心即可。。。。。
4楼2014-02-28 08:23:48
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