| ²é¿´: 2505 | »Ø¸´: 9 | |||
| ±¾Ìû²úÉú 1 ¸ö Ä£ÄâEPI £¬µã»÷ÕâÀï½øÐв鿴 | |||
µË·¼Ä¾³æ (СÓÐÃûÆø)
ľ³æ
|
[ÇóÖú]
autodockʲôʱºò´æÔÚpi-pi interations£¿
|
||
ÇëÎʸßÊÖ£ºautodockʲôʱºò´æÔÚpi-pi interations£¿×öÁ˺ܶà×é¶Ô½Óû·¢ÏÖÓÐÕâÖÖÏ໥×÷Óõģ¬ÕâÖÖÏ໥×÷ÓÃÓÐʲô×÷Óã¿ÄÜ˵Ã÷ÄÄЩÎÊÌ⣿лл![]() ![]() |
» ÊÕ¼±¾ÌûµÄÌÔÌûר¼ÍƼö
Autodock |
» ²ÂÄãϲ»¶
»úе¹¤³Ì264ѧ˶Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ3È˻ظ´
264Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ9È˻ظ´
Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ6È˻ظ´
22408 266Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ7È˻ظ´
Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ14È˻ظ´
273Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ43È˻ظ´
307Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ13È˻ظ´
327Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ7È˻ظ´
338Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ6È˻ظ´
326·Ö£¬Ò»Ö¾Ô¸»¦9£¬ÇóÉúÎïѧµ÷¼Á
ÒѾÓÐ3È˻ظ´
» ±¾Ö÷ÌâÏà¹Ø¼ÛÖµÌùÍÆ¼ö£¬¶ÔÄúͬÑùÓаïÖú:
autodockµÄ°²×°
ÒѾÓÐ10È˻ظ´
AutodockµÄ²Ù×÷Á÷³Ì---winÏÂ
ÒѾÓÐ565È˻ظ´
Autodockʱ gridboxµÄ²ÎÊýÔõôÉèÖÃ??
ÒѾÓÐ18È˻ظ´
autodock°²×°ºÃºóµ¼Èë·Ö×ÓΪʲô²»¶Ô£¨¸½Í¼£©
ÒѾÓÐ18È˻ظ´
autodockÔËÐÐʱCan't create log file
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
AutoDockµÄ°²×°£¿
ÒѾÓÐ7È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿Çë½ÌAutodock½á¹û·ÖÎö
ÒѾÓÐ8È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿Autodock·ÖÎöÇë½Ì
ÒѾÓÐ17È˻ظ´
¡¾ÌÖÂÛ¡¿ÈõÈõµÄÎÊÒ»¾ä£¬ÎªÊ²Ã´ubuntu²»ÊʺÏ×öautodockµÄ²Ù×÷ϵͳ
ÒѾÓÐ13È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿autodock4 °²×°ÎÊÌâ
ÒѾÓÐ9È˻ظ´
¡¾ÌÖÂÛ¡¿autodockÔËÐÐʱ¼ä¹ý³¤
ÒѾÓÐ12È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿autodock¼ÆËãµÄ½á¹ûÖØ¸´ÐÔ²»ºÃ
ÒѾÓÐ9È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿AUTODOCKµÄÒ»¸öÎÊÌâ
ÒѾÓÐ6È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿¹ØÓÚAutodockµÄÎÊÌâ
ÒѾÓÐ11È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿¹ØÓÚAutodockÖÐGridÖеÄÎÊÌâ
ÒѾÓÐ9È˻ظ´
¡¾Ô´´¡¿AutoDockʹÓñʼÇ×ܽá£Ô´´Ê¼·¢
ÒѾÓÐ32È˻ظ´

lrf1980
гæ (СÓÐÃûÆø)
- Ä£ÄâEPI: 1
- Ó¦Öú: 41 (СѧÉú)
- ½ð±Ò: 1254.2
- ºì»¨: 3
- Ìû×Ó: 136
- ÔÚÏß: 52.5Сʱ
- ³æºÅ: 2060967
- ×¢²á: 2012-10-14
- רҵ: Ò©Îﻯѧ
¡¾´ð°¸¡¿Ó¦Öú»ØÌû
¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï
zh1987hs: ½ð±Ò+5, Ä£ÄâEPI+1, »Ø´ðÇå³þ~ÊÚÓèEPIһö~¹ÄÀø¶à¶à·¢ÑÔ£¡ 2013-01-09 14:26:49
zh1987hs: ½ð±Ò+5, Ä£ÄâEPI+1, »Ø´ðÇå³þ~ÊÚÓèEPIһö~¹ÄÀø¶à¶à·¢ÑÔ£¡ 2013-01-09 14:26:49
|
Õâ¸öaffinity energyÊDZȽÏÈÝÒ×Îó½â£¬ÑϸñÒâÒåÉÏÀ´½²£¬Ó¦¸Ã¼ÆËãÒ»¸öÌåϵµÄ×ÔÓÉÄܱ仯£¬Èç¹ûdockingǰºóµÄ×ÔÓÉÄܱ仯СÓÚÁ㣬˵Ã÷dockingµÄ¹¹ÏóÊÇÎȶ¨µÄ¡£µ«ÊÇautodockÕâ¸öÈí¼þĿǰ»¹²»ÄÜÑϸñ¼ÆËãdockingǰºóµÄ×ÔÓÉÄܱ仯¡£ËùÒÔËûÃÇÈ¡Á˸öaffinity energyµÄ¸ÅÄî¡£»ù±¾ÉÏÒ²ÊǸö²Î¿¼Öµ¡£ÒòΪËüÒ²ÊǸºÖµ¡£ËùÒÔÎÒ˵Èç¹ûÓÐpi-piÏ໥×÷Ó㬾ÍÒâζ×ÅdockingºóµÄÌåϵ¸ü¼ÓµÄÎȶ¨£¬affinity energy¸üµÍ¡£´ÓijÖÖÒâÒåÉϽ²Õâ¸öÅäÌåºÜÓпÉÄܶÔÕâ¸öµ°°×ÓÐ×÷Óá£Ä¿Ç°Äܹ»ÕæÕý¼ÆËã×ÔÓÉÄܱ仯µÄ»¹ÊÇcharmm³ÌÐò¡£µ«ÊÇÕâ¸ö³ÌÐòºÜÄÑѧ£¬¹¦Äܶ࣬×ã¹»µÄ»ù´¡ºÃÏñºÜÄÑȥʹÓá£ÆäËüµÄdocking ³ÌÐò»ù±¾É϶¼ÊDzÉÓø÷ÖÖÄ£ÐͺÍËã·¨½«×ÔÓÉÄܼÆËã¼ò»¯£¬È»ºó³öÒ»¸öÖ¸±ê¡£Ïñaffinity energy, score, rsmdµÈµÈ¡£ ¼òµ¥Ò»¾ä»°£¬¶ÔÓÚdocking£¬Ò»µ©¿Õ¼ä¹¹ÏóÆ¥Å䣬ÅäÌåÓëµ°°×ÖÊÖÜΧ»·¾³µÄ²Ð»ùÏ໥×÷ÓÃÔ½´ó£¬ÄÇô½áºÏµÄ¿ÉÄÜÐÔ¾ÍÔ½¸ß¡£ÖÁÓÚÕâÖÖ½áºÏµ½µ×Òâζ×Åʲô£¬Íêȫȡ¾öÓÚÄãµÄÌåϵµ°°×¿Ú´üµÄÌØÐÔ¡£Èç¹ûÕâ¸ö¿Ú´üÒѾÓкܶàÎÄÏ×±¨µÀÁËËüµÄÉúÎï»îÐÔ£¬ÄÇô½áºÏµÄÔ½ºÃ£¬ËµÃ÷ÄãµÄÅäÌå»îÐÔÔ½¸ß£¬Èç¹ûÕâ¸ö¿Ú´üÖ»ÊÇÄã×Ô¼ºÕÒÀ´Ñ§Ï°dockingµÄ¡£ÒªÃ´Äãײ´óÔËÕÒµ½Á˵°°×µÄлîÐÔλµã£¬ÒªÃ´¾Íʲô¶¼²»ÊÇ¡£´¿´â¸øÄãÀÖÒ»ÀÖ¶øÒÑ¡£ |
7Â¥2013-01-09 13:59:09
lrf1980
гæ (СÓÐÃûÆø)
- Ä£ÄâEPI: 1
- Ó¦Öú: 41 (СѧÉú)
- ½ð±Ò: 1254.2
- ºì»¨: 3
- Ìû×Ó: 136
- ÔÚÏß: 52.5Сʱ
- ³æºÅ: 2060967
- ×¢²á: 2012-10-14
- רҵ: Ò©Îﻯѧ
¡¾´ð°¸¡¿Ó¦Öú»ØÌû
¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï
¸Ðл²ÎÓ룬ӦÖúÖ¸Êý +1
µË·¼: ½ð±Ò+10, ¡ï¡ï¡ïºÜÓаïÖú 2013-01-08 17:35:56
zh1987hs: ½ð±Ò+4, лл 2013-01-08 22:14:57
¸Ðл²ÎÓ룬ӦÖúÖ¸Êý +1
µË·¼: ½ð±Ò+10, ¡ï¡ï¡ïºÜÓаïÖú 2013-01-08 17:35:56
zh1987hs: ½ð±Ò+4, лл 2013-01-08 22:14:57
| Ê×ÏÈ¿´¿´ÄãµÄ¿Ú´üÖÜΧÊÇ·ñÓб½»·²Ð»ù£¬Èç¹ûûÓУ¬ÊDz»¿ÉÄܳöÏÖpi-piµÄ¡£ÁíÍâ¾ÍÊÇÄãµÄÅäÌåÊDz»ÊÇÓб½»·»òÕ߸ü´óµÄ¹²éîÌåϵ¡£µ±Á½Õß¶¼ÓеÄÇé¿öÏ£¬¿Õ¼ä¹¹ÏóÆ¥Åä¾Í»á³öÏÖpi-piÏ໥×÷Óá£pi-piÏ໥×÷ÓõÄÄÜÁ¿»¹ÊÇÂù´óµÄ¡£ËùÒÔÈç¹ûÌåϵÓÐpi-piÏ໥×÷Óã¬Ó¦¸ÃÄãµÄaffinity energyÏà¶Ô»á±È½ÏµÍ¡£ÖÁÓÚÕâÖÖÏ໥×÷Óõ½µ×ÄÜ˵Ã÷ʲôÎÊÌ⣬Õâ¸ö¾ÍÈÊÕß¼ûÈÊ£¬ÖÇÕß¼ûÖÇÁË¡£ |
2Â¥2013-01-08 15:58:10
hellenwu74
гæ (³õÈëÎÄ̳)
- Ó¦Öú: 0 (Ó×¶ùÔ°)
- ½ð±Ò: 21.5
- Ìû×Ó: 5
- ÔÚÏß: 1.7Сʱ
- ³æºÅ: 2229265
- ×¢²á: 2013-01-08
- רҵ: ÉúÎﻯѧ
3Â¥2013-01-08 16:21:33
µË·¼
ľ³æ (СÓÐÃûÆø)
ľ³æ
- Ó¦Öú: 0 (Ó×¶ùÔ°)
- ½ð±Ò: 1867.1
- ºì»¨: 2
- Ìû×Ó: 108
- ÔÚÏß: 41.8Сʱ
- ³æºÅ: 1499397
- ×¢²á: 2011-11-19
- ÐÔ±ð: MM
- רҵ: »¯Ñ§¼ÆÁ¿Ñ§Ó뻯ѧÐÅϢѧ

4Â¥2013-01-08 17:36:16
lrf1980
гæ (СÓÐÃûÆø)
- Ä£ÄâEPI: 1
- Ó¦Öú: 41 (СѧÉú)
- ½ð±Ò: 1254.2
- ºì»¨: 3
- Ìû×Ó: 136
- ÔÚÏß: 52.5Сʱ
- ³æºÅ: 2060967
- ×¢²á: 2012-10-14
- רҵ: Ò©Îﻯѧ
¡ï ¡ï ¡ï
zh1987hs: ½ð±Ò+3, лл 2013-01-08 22:15:13
zh1987hs: ½ð±Ò+3, лл 2013-01-08 22:15:13
| ÎÒ½¨ÒéÄãÃÇÈ¥¿´¿´µ±³õ¿ª·¢Èí¼þʱ·¢µÄÎÄÕ¡£ËùÓеÄÏ໥×÷ÓÃʲôµÄ¶¼»áÔÚÎÄÕµÄaffinity energy¼ÆË㹫ʽÀïÃæÌåÏÖ¡£ÒòΪÎÒҲûÓÐÉîÈëµÄÁ˽âÕⲿ·Ö£¬¶ÔÓÚpi-pi×÷Óã¬Ö»ÊÇÎÒ¼¸¸öÌåϵÊÇÓеģ¬ËùÒÔÎұȽÏÇå³þ¡£¶ÔÓÚpi-sigma£¬²»Á˽⣬pi-cationÎÒµÄÀí½âÊǹ²éîÌåϵ¸úÀë×ÓÖ®¼äµÄÒ»ÖÖÏ໥×÷Óá£Õâ¸öÔÚÅäλ»¯Ñ§ÀïÃæÒ²³£ÓС£ |
5Â¥2013-01-08 21:04:43
ÓÎ×Ó8921
Ìú¸Ëľ³æ (ÖªÃû×÷¼Ò)
ÓÎ×Ó8921
- Ó¦Öú: 12 (СѧÉú)
- ½ð±Ò: 8915.2
- É¢½ð: 132
- ºì»¨: 5
- Ìû×Ó: 6402
- ÔÚÏß: 750.9Сʱ
- ³æºÅ: 685694
- ×¢²á: 2009-01-01
- ÐÔ±ð: GG
- רҵ: ÀíÂۺͼÆË㻯ѧ

6Â¥2013-01-08 22:49:53
lrf1980
гæ (СÓÐÃûÆø)
- Ä£ÄâEPI: 1
- Ó¦Öú: 41 (СѧÉú)
- ½ð±Ò: 1254.2
- ºì»¨: 3
- Ìû×Ó: 136
- ÔÚÏß: 52.5Сʱ
- ³æºÅ: 2060967
- ×¢²á: 2012-10-14
- רҵ: Ò©Îﻯѧ
8Â¥2013-01-09 14:02:12
lrf1980
гæ (СÓÐÃûÆø)
- Ä£ÄâEPI: 1
- Ó¦Öú: 41 (СѧÉú)
- ½ð±Ò: 1254.2
- ºì»¨: 3
- Ìû×Ó: 136
- ÔÚÏß: 52.5Сʱ
- ³æºÅ: 2060967
- ×¢²á: 2012-10-14
- רҵ: Ò©Îﻯѧ
¡ï ¡ï ¡ï
zh1987hs: ½ð±Ò+3, лл 2013-01-09 14:27:18
zh1987hs: ½ð±Ò+3, лл 2013-01-09 14:27:18
| Æäʵpi-piÏ໥×÷ÓÃÒ²ºÃ£¬Çâ¼üÏ໥×÷ÓÃÒ²ºÃ£¬·¶µÂ»ªÁ¦Ò²ºÃ£¬ÉõÖÁÊÇ¿âÂ×Á¦Ò²ºÃ¡£ÔÚ¼ÆË㻯ѧ¼ÒÑÛÀïÒ²¾ÍÊÇÒ»¸ö¶Ô×ÔÓÉÄܱ仯¹±Ï×ÒòËØÖеÄÒ»ÖÖ¶øÒÑ¡£Ö»Òª²ÎÊý¶¼ÉèÖöÔÁË£¬×îºó¶¼ÊÇ¿´×ÔÓÉÄܵı仯¡£Èç¹ûÌåϵ×ÔÓÉÄܽµµÍ£¬ÄÇôÅäÌådockingÉϵ°°×ÖʾÍÊÇÒ»¸ö×Ô·¢µÄ¹ý³Ì¡£Ö»ÊÇÔÚÕâЩÏ໥×÷ÓÃÖв»Í¬ÖÖÀàµÄÏ໥×÷Óù±Ï׵ĶàÉÙ²»Í¬¶øÒÑ¡£Ò»°ãÊÇ¿âÂ×Á¦¡·Çâ¼ü£¬pi-pi¡··¶µÂ»ªÁ¦¡£ËùÒÔ¶ÔÓÚÎÒÃÇ×ö·Ö×ÓÉè¼ÆµÄÈË£¬ÐèÒª¶à¶àÀûÓÃÕâЩ²îÒìÀ´Éè¼Æ·Ö×Ó¡£ÉϺ£Ò©ÎïËùËûÃÇÔø¾·¢±í¹ýһЩÎÄÕ²ûÊöÂ±ËØÔÚÒ©ÎïÉè¼ÆÖеÄÖØÒªÐÔ¡£ÎÄÕÂÌáµ½ËµÂ±ËØÌṩµÄÏ໥×÷ÓÃÀàËÆÓÚÇâ¼üµÄ´óС¡£µ«ÊDZȳ£¹æµÄÑõ»òÕßµªÊÜ»·¾³ºÍÌõ¼þÓ°ÏìС¡£¾ßÌåÎÄÕ¼Dz»µÃÁË£¬Äã¿ÉÒÔÍøÉϲéÕÒһϡ£ |
9Â¥2013-01-09 14:10:28
2009050389
Òø³æ (СÓÐÃûÆø)
- Ó¦Öú: 2 (Ó×¶ùÔ°)
- ½ð±Ò: 365.7
- É¢½ð: 49
- Ìû×Ó: 65
- ÔÚÏß: 197.1Сʱ
- ³æºÅ: 1512723
- ×¢²á: 2011-11-27
- ÐÔ±ð: GG
- רҵ: ¼ÄÉú³æ¡¢¼ÄÉú³æ¸ÐȾÓëËÞÖ÷

10Â¥2013-03-13 18:56:05















»Ø¸´´ËÂ¥