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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

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专业: 化学计量学与化学信息学

[求助] autodock什么时候存在pi-pi interations？

请问高手：autodock什么时候存在pi-pi interations？做了很多组对接没发现有这种相互作用的，这种相互作用有什么作用？能说明哪些问题？谢谢

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坚持就是胜利

1楼 2013-01-08 15:30:12

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邓芳

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引用回帖:

2楼: Originally posted by lrf1980 at 2013-01-08 15:58:10
首先看看你的口袋周围是否有苯环残基，如果没有，是不可能出现pi-pi的。另外就是你的配体是不是有苯环或者更大的共轭体系。当两者都有的情况下，空间构象匹配就会出现pi-pi相互作用。pi-pi相互作用的能量还是蛮大的 ...

谢谢，学习了

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坚持就是胜利

4楼2013-01-08 17:36:16

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