应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】关于Autodock的问题
121/2返回列表12下一页
查看: 2400  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

rainbow001

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于Autodock的问题 已有9人参与

我在用Autodock做hsg1这个例子的时候ARG8做成了这个样子

请问那位大侠能给看看，这明显是ARG8氨基酸不全，这会影响到对接吗？还有就是这是什么原因造成的？
当做到Autogrid的时候结果是这样的

请问那位好心人给指点指点？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
加油加油
1楼 2010-03-31 09:59:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rainbow001

木虫 (小有名气)
2楼2010-04-02 10:03:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yitianle

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
rainbow001(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-06 19:35
Autodock 就是爱出问题,不是这个问题就是那个问题,我的也是出现过这样的问题,解决不了,再也不用了.现在在用MVD,建议用MVD,要好用多了.可以申请试用版的

[ Last edited by yitianle on 2010-4-6 at 19:36 ]
赞一下(2人) 回复此楼
上海相辉医药科技有限公司 www.sunwaypharm.com 021-51613915
3楼2010-04-06 19:34:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaodongying

金虫 (著名写手)
★
rainbow001(金币+1):谢谢参与
autodock，真是不懂啊
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-04-13 22:06:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoqunqunl

金虫 (小有名气)
★
rainbow001(金币+1):谢谢参与
群主，解决问题了吗
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-05-14 17:18:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

piscesee

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-05-15 14:59:29
这个不是不全吧，只是没有显示而已
出错提示是说没有找到大分子的pdbqt文件，目标文件夹下没有那个文件
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-05-15 12:01:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sqfn

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-18 07:40:17
autodock默认路径问题，路径不能有中文，而且要将这些对接文件放在默认路径下
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2010-05-18 00:03:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tlixia

金虫 (初入文坛)

一点体会

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我感觉楼主是高手，我也遇到过相识的问题，现在解决了。可是还有个问题想请教一下，点docking下的 macromolecule 中的set rigid filename，我为什么打不开这个大分子呢？而我用flexible Residues中的input中的Open macromolecule能够打开大分子。不知道什么原因？请各位大侠指正 非常感谢
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2010-07-14 16:40:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rainbow001

木虫 (小有名气)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-07-15 10:28:45
rigid是刚性文件，flexible 是柔性文件，不一样，打开之前要确定好了格式
赞一下(2人) 回复此楼
加油加油
9楼2010-07-15 08:41:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tlixia

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
谢谢楼主提醒
回复此楼
10楼2010-07-19 09:10:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 rainbow001 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 PbwVEMK5haaE 2026-08-25 5/250 2026-08-26 05:09 by cNXvBfCpiZOM
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Qj98d49dHFb9 2026-08-25 5/250 2026-08-26 04:57 by cNXvBfCpiZOM
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 4/200 2026-08-26 02:04 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 19/950 2026-08-25 17:57 by chick875
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +20 羊腰板 2026-08-21 23/1150 2026-08-25 16:34 by zsna
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +17 kkkl_v 2026-08-19 18/900 2026-08-25 09:41 by windflowerwy
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤？
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭