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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 有关autodock发文章的问题
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wuhaigang

木虫 (著名写手)

[交流] 有关autodock发文章的问题

我最近很头疼论文的问题，我现在精通的软件就是autodock而已，但是，毕竟身边没有什么牛人能给我点思路。我想问一下大家，用autodock怎么发文章的啊，当然就只是CADD方面的，其他的，像只是在论文中修饰的就算了。
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1楼2012-02-28 16:23:14
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gouyi

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
同问，期待高手指点一下
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2楼2012-02-28 23:03:40
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huang0106

木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
将对接最好的结果（一般是打分）用pymol处理
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3楼2012-02-29 00:04:08
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wuhaigang

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by huang0106 at 2012-02-29 00:04:08:
将对接最好的结果（一般是打分）用pymol处理

我现在基本上不用pymol作为处理软件了，我看很多的文献上已经开始用UCSF的chimera作为结果处理了，而且比pymol方便点吧。
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4楼2012-02-29 08:23:17
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chuannong

铁杆木虫 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
LZ既然是精通，应该看了不少相关文献，应该也有想法吧
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5楼2012-02-29 20:36:41
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wuhaigang

木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by chuannong at 2012-02-29 20:36:41:
LZ既然是精通，应该看了不少相关文献，应该也有想法吧

我又一点想法，但是都是很简单的，也不知道做出来之后是什么水平的文章。
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6楼2012-02-29 21:20:10
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tinasheen

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
有了想法就先做做看呀，一般都是一边做一边思考，最后会越做越深入，自然也能发表好的文章了。楼主加油呀
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7楼2012-03-06 09:22:19
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luckydong1

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
楼主，我现正在学习autodock，非常头疼。按照tutorial准备所需要的文件后，运行autodock竟然说“autodock4: can't create log file LMGWHÿÿÿ.dlg
autodock4: Unsuccessful Completion.”  这怎么回事啊？我原本设置的log文件名是LMGWH.dlg的。教教我吧
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8楼2012-03-06 16:27:25
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wuhaigang

木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by luckydong1 at 2012-03-06 16:27:25:
楼主，我现正在学习autodock，非常头疼。按照tutorial准备所需要的文件后，运行autodock竟然说“autodock4: can't create log file LMGWHÿÿÿ.dlg
autodock4: Unsuccessful Completi ...

It is the problem of your files.Maybe you create the files in window operation system,but load in linux system . So I give some opinions : though the chimera in linux or chemoffice in windows ,remember that there must not be some chinese or other words in your files.
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9楼2012-03-07 08:34:01
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longytu10楼
2012-04-02 17:20   回复  
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chaizhm: 编辑内容 2012-04-02 18:45
1 [ Last edited by chaizhm on 2012-4-2 at 18:45 ]
longytu11楼
2012-04-02 17:22   回复  
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
好 [ Last edited by longytu on 2012-4-3 at 08:25 ]
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