24小时热门版块排行榜

返回列表

本帖产生 1 个模拟EPI ，点击这里进行查看

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1867.1
红花: 2
帖子: 108
在线: 41.8小时
虫号: 1499397
注册: 2011-11-19
性别: MM
专业: 化学计量学与化学信息学

[求助] autodock什么时候存在pi-pi interations？

请问高手：autodock什么时候存在pi-pi interations？做了很多组对接没发现有这种相互作用的，这种相互作用有什么作用？能说明哪些问题？谢谢

回复此楼

坚持就是胜利

1楼2013-01-08 15:30:12

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921

应助: 12 (小学生)
金币: 8915.2
散金: 132
红花: 5
帖子: 6402
在线: 750.9小时
虫号: 685694
注册: 2009-01-01
性别: GG
专业: 理论和计算化学

引用回帖:

2楼: Originally posted by lrf1980 at 2013-01-08 15:58:10
首先看看你的口袋周围是否有苯环残基，如果没有，是不可能出现pi-pi的。另外就是你的配体是不是有苯环或者更大的共轭体系。当两者都有的情况下，空间构象匹配就会出现pi-pi相互作用。pi-pi相互作用的能量还是蛮大的 ...

“如果体系有pi-pi相互作用，应该你的affinity energy相对会比较低”请问这怎么解释？这种相互作用到底能说明什么问题，能举个例吗？或是文章，谢谢

赞一下

回复此楼

为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能

6楼2013-01-08 22:49:53

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 10 个回答

lrf1980

新虫 (小有名气)

模拟EPI: 1
应助: 41 (小学生)
金币: 1254.2
红花: 3
帖子: 136
在线: 52.5小时
虫号: 2060967
注册: 2012-10-14
专业: 药物化学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
邓芳: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-01-08 17:35:56
zh1987hs: 金币+4, 谢谢 2013-01-08 22:14:57

首先看看你的口袋周围是否有苯环残基，如果没有，是不可能出现pi-pi的。另外就是你的配体是不是有苯环或者更大的共轭体系。当两者都有的情况下，空间构象匹配就会出现pi-pi相互作用。pi-pi相互作用的能量还是蛮大的。所以如果体系有pi-pi相互作用，应该你的affinity energy相对会比较低。至于这种相互作用到底能说明什么问题，这个就仁者见仁，智者见智了。

赞一下(1人)

回复此楼

2楼2013-01-08 15:58:10

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖