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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

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[求助] autodock什么时候存在pi-pi interations？

请问高手：autodock什么时候存在pi-pi interations？做了很多组对接没发现有这种相互作用的，这种相互作用有什么作用？能说明哪些问题？谢谢

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坚持就是胜利

1楼 2013-01-08 15:30:12

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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921

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引用回帖:

2楼: Originally posted by lrf1980 at 2013-01-08 15:58:10
首先看看你的口袋周围是否有苯环残基，如果没有，是不可能出现pi-pi的。另外就是你的配体是不是有苯环或者更大的共轭体系。当两者都有的情况下，空间构象匹配就会出现pi-pi相互作用。pi-pi相互作用的能量还是蛮大的 ...

“如果体系有pi-pi相互作用，应该你的affinity energy相对会比较低”请问这怎么解释？这种相互作用到底能说明什么问题，能举个例吗？或是文章，谢谢

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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能

6楼2013-01-08 22:49:53

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