应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » linux下的autodock在run autodock时不出现dlg文件
91/1返回列表
查看: 2739  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

[求助] linux下的autodock在run autodock时不出现dlg文件

有没有人遇到linux下的autodock在run autodock时不出现dlg文件，窗口一闪而过的情况？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

药物设计相关

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
坚持就是胜利
1楼 2013-06-03 09:16:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longytu

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
邓芳: 金币+10, ★有帮助 2013-06-03 23:02:13
1：首先确保生成了glg文件，这一步没有成功的话，autodock这一步就不会成功
2：其次看看autodock的小文件是否放在了主文件夹中
赞一下 回复此楼
2楼2013-06-03 09:19:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2013-06-03 09:19:42
1：首先确保生成了glg文件，这一步没有成功的话，autodock这一步就不会成功
2：其次看看autodock的小文件是否放在了主文件夹中

glg文件生成，run autogrid 这一步成功，autodock的小文件也放在了主文件夹了
赞一下 回复此楼
坚持就是胜利
3楼2013-06-03 10:11:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

keke_1210

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
邓芳: 金币+10, ★有帮助 2013-06-03 23:02:03
看一下对接的dpf文件是否生成，再者查看命令是否输错，输出时是否保存在dlg文件中
赞一下 回复此楼
你好吗
4楼2013-06-03 10:27:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
4楼: Originally posted by keke_1210 at 2013-06-03 10:27:52
看一下对接的dpf文件是否生成，再者查看命令是否输错，输出时是否保存在dlg文件中

dpf生成了，我用的是图形界面，输出时是保存在dlg文件中，但
run autodock 直接一闪而过，没有出现dlg文件
赞一下 回复此楼
坚持就是胜利
5楼2013-06-03 10:33:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
问题解决了，谢谢大家的帮助
赞一下 回复此楼
坚持就是胜利
6楼2013-06-03 23:01:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qxluan88

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 邓芳 at 2013-06-03 23:01:43
问题解决了，谢谢大家的帮助

你好，请问你的问题怎么解决的啊？我现在在运行dock过程中能产生dlg文件，也能看到运行进程，但是运行结束，虽然显示successful，但是生成的dlg文件却是空的
赞一下 回复此楼
7楼2013-08-22 17:21:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
7楼: Originally posted by qxluan88 at 2013-08-22 17:21:18
你好，请问你的问题怎么解决的啊？我现在在运行dock过程中能产生dlg文件，也能看到运行进程，但是运行结束，虽然显示successful，但是生成的dlg文件却是空的...

下载源码 地址：http://autodock.scripps.edu/down ... -4.2.5.1-src.tar.gz
解压缩  然后 ./configure  再make
就可以了。
实际上就是进行一下编译
赞一下 回复此楼
坚持就是胜利
8楼2013-08-23 08:50:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

幻亦真

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 邓芳 at 2013-08-23 08:50:57
下载源码 地址：http://autodock.scripps.edu/down ... -4.2.5.1-src.tar.gz
解压缩  然后 ./configure  再make
就可以了。
实际上就是进行一下编译...

现在这个地址打不开呀。  autodock的官网上有4.2.5.1-src.tar.gz吗？在哪个版块儿？
赞一下 回复此楼
9楼2014-06-30 11:00:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 邓芳 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] 同一个分子，一条来自文献，一条来自AI——不告诉你答案，你会选哪条？ +4 tianxiaoxian 2026-09-28 7/350 2026-09-30 08:34 by 88817753
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-29 19:27 by cqwQDCxMcL3I
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:54 by yCO1Ll7aHtsw
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:47 by yCO1Ll7aHtsw
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:37 by etmYJ6d2rquH
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 16:03 by etmYJ6d2rquH
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 4/200 2026-09-29 15:15 by etmYJ6d2rquH
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:58 by etmYJ6d2rquH
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:41 by etmYJ6d2rquH
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:24 by etmYJ6d2rquH
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:13 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 7/350 2026-09-29 14:07 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 3/150 2026-09-29 13:56 by etmYJ6d2rquH
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 09:59 by JzYBbHIXWSrW
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-29 09:49 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:42 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:28 by ZvyPK8n6Nfki
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:46 by b8fCuTHqckEt
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-28 19:08 by 9lS3ad5oOymn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭