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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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fangmi814

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Autodock 分子对接

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caixin5120

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【答案】应助回帖

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fangmi814: 金币+5 2012-12-17 15:26:33
你没有给分子赋予AD原子类型,http://www.bioms.org/thread-195-1-1.html   这里有Bioms小组翻译的官方autodock4.2 说明书下载,里面有如何赋予AD原子类型及其他高级使用,希望对你有帮助。
2楼2012-12-17 14:58:30
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fangmi814

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3楼2012-12-17 15:28:29
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caixin5120

木虫 (正式写手)


AD原子类型就是 Autodock定义的原子类型。
4楼2012-12-17 15:41:22
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fangmi814

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5楼2012-12-17 16:09:19
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caixin5120

木虫 (正式写手)



chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-12-18 08:39:09
仔细阅读说明书:)因为你没有做这一步!把你的分子的原子类型转换为AD原子类型。
6楼2012-12-17 16:39:13
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)



chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-12-18 08:39:29
大分子保存成PDBQT的时候,不是直接在FILE里面保存的,应该先保存成PDB格式,接着再grid里面保存成pdbqt格式。。。。

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7楼2012-12-17 18:19:27
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8楼2012-12-17 19:27:03
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9楼2012-12-17 21:15:23
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