| 查看: 2774 | 回复: 6 | ||
luckydong1铜虫 (小有名气)
|
[求助]
用autodock做对接，box设置无法包括受体活性区域和配体 已有1人参与
|
|
如题，我在使用autodock的时候，配体打开后就不在受体的活性区域中，请问是不是应该要在受体活性中显示，然后设置能包括配体和受体活性区域的box？？？如何调整配体的坐标呢？？ PS： 我的配体是用chemoffice优化后，保存为MOL2文件，然后在autodock中处理后保存为PDBQT文件，这样是否有不妥？ |
回复此楼» 猜你喜欢
313求调剂
已经有4人回复
-
材料调剂
已经有13人回复
-
材料专硕283求调剂
已经有13人回复
-
295求调剂
已经有7人回复
-
266分，一志愿电气工程，本科材料，求材料专业调剂
已经有7人回复
-
307分材料专业求调剂
已经有5人回复
-
一志愿北交大材料工程总分358求调剂
已经有5人回复
-
求调剂
已经有4人回复
-
材料与化工371求调剂
已经有11人回复
-
材料求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Autodock时 gridbox的参数怎么设置??
已经有18人回复
- AUTODOCK对接步骤求助(附图）
已经有7人回复
- AutoDock参数设置问题
已经有6人回复
- 用AutoDock对接的结合能较小，可能是什么原因？
已经有7人回复
- 用AutoDock作分子对接前的小分子能量最小化问题
已经有6人回复
- Autodock对接构象有问题，请教
已经有7人回复
- 【求助】高手求助,Autodock4 最后一步无法对接,弄了几天!
已经有7人回复
- 【求助】Autodock能对接含有金属原子的配体么？
已经有14人回复
- 【求助】autodock对接后小分子被打断的情况
已经有6人回复
- 【求助】Autodock的配体处理求助？
已经有3人回复
- 【原创】AutoDock使用笔记总结－原创始发
已经有32人回复
2楼2012-03-21 10:57:55
chaizhm: 编辑内容 2012-04-02 18:44
|
1 [ Last edited by chaizhm on 2012-4-2 at 18:44 ] |
3楼2012-04-02 17:24:03
4楼2012-04-30 15:03:42
5楼2014-05-16 22:20:26
hunger1569
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 40.5
- 散金: 4
- 帖子: 24
- 在线: 20.1小时
- 虫号: 1059712
- 注册: 2010-07-18
- 性别: GG
- 专业: 系统生物学
6楼2015-11-10 16:52:30
zhouling1019
新虫 (初入文坛)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 181.5
- 红花: 2
- 帖子: 44
- 在线: 28.1小时
- 虫号: 4155648
- 注册: 2015-10-19
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
7楼2015-12-25 18:04:40
5