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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】autodock对接后小分子被打断的情况
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czx12czx

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】autodock对接后小分子被打断的情况已有5人参与

我刚刚接触autodock3.05，对接一个分子量1000左右的大分子，有32个可旋转键，发现对接后分子都被打断裂开了，而把所有键固定不可转，对接的话就可以得到正常的结果，有人碰到过这种情况吗？
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1楼2010-05-10 19:30:04
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wjlouc

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-11 08:09:40
我也碰见过这种情况，一般是因为画分子结构时处理不当导致的。建议重新画一下分子结构或者换个画分子结构的软件试试。
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君子生非异也，善假于物也！
2楼2010-05-10 20:23:40
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by wjlouc at 2010-05-10 20:23:40:
我也碰见过这种情况，一般是因为画分子结构时处理不当导致的。建议重新画一下分子结构或者换个画分子结构的软件试试。

有意思，这是不是bug?
赞一下(1人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
3楼2010-05-10 21:24:47
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wjlouc

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
应该不是BUG吧
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君子生非异也，善假于物也！
4楼2010-05-10 22:41:24
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gaoqunqunl

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
群主解决问题了吗
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5楼2010-05-14 16:29:34
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wangmiao8674

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by gaoqunqunl at 2010-05-14 16:29:34
群主解决问题了吗

我现在也遇到了这种情况，请问怎么解决呢？这种现象是合理的还是错误呢？
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小木虫
6楼2015-06-06 12:47:46
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
优化一下配体结构！用高斯等软件优化
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7楼2015-06-06 14:04:24
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