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czx12czx

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】autodock对接后小分子被打断的情况 已有5人参与

我刚刚接触autodock3.05,对接一个分子量1000左右的大分子,有32个可旋转键,发现对接后分子都被打断裂开了,而把所有键固定不可转,对接的话就可以得到正常的结果,有人碰到过这种情况吗?
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
优化一下配体结构!用高斯等软件优化
7楼2015-06-06 14:04:24
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wjlouc

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-11 08:09:40
我也碰见过这种情况,一般是因为画分子结构时处理不当导致的。建议重新画一下分子结构或者换个画分子结构的软件试试。
君子生非异也,善假于物也!
2楼2010-05-10 20:23:40
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by wjlouc at 2010-05-10 20:23:40:
我也碰见过这种情况,一般是因为画分子结构时处理不当导致的。建议重新画一下分子结构或者换个画分子结构的软件试试。

有意思,这是不是bug?
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
3楼2010-05-10 21:24:47
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gaoqunqunl

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
群主解决问题了吗
5楼2010-05-14 16:29:34
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