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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【资源】PyRx-基于autodock的虚拟筛选软件
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shistory

金虫 (小有名气)

[交流] 【资源】PyRx-基于autodock的虚拟筛选软件 已有7人参与

PyRx是Scripps研究所开发的基于Autodocking的虚拟筛选软件，免费的，可以在各种平台下运行，包括Windows， linux ， Mac OS x等，下面是官方介绍：
下载地址：http://pyrx.scripps.edu/downloads

PyRx is a Virtual Screening software for Computational Drug Discovery that can be used to screen libraries of compounds against potential drug targets. PyRx enables Medicinal Chemists to run Virtual Screening form any platform and helps users in every step of this process - from data preparation to job submission and analysis of the results. While it is true that there is no magic button in the drug discovery process, PyRx includes docking wizard with easy-to-use user interface which makes it a valuable tool for Computer-Aided Drug Design. PyRx also includes chemical spreadsheet-like functionality and powerful visualization engine that are essential for Rational Drug Design.
http://pyrx.scripps.edu/downloads

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:54 ]
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1楼 2009-10-21 11:10:27
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

syfnet

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
在winxp上安装了，不过不能启动，看这个软件的论坛里，有这个情况的还很多。不过，还没有找到解决的方法，linux版在ubuntu、centos上试了一下，好像都有问题，无法安装。
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11楼2009-10-25 16:31:45
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普通回帖

yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
Interesting
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2楼2009-10-21 11:31:16
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liuyihua

铁杆木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-29 12:46
windows版安装有问题，不知其他人的安装情况如何
毕竟是刚出的，很多代码还需要调试，先观望一下

[ Last edited by liuyihua on 2009-10-21 at 12:27 ]
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3楼2009-10-21 12:24:42
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syfnet

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
好东西，多谢楼主提供了。只是下载的时候那些＋号，我怎么都点不开，如何是好？是不是电脑缺东西了？
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4楼2009-10-21 17:13:53
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by liuyihua at 2009-10-21 12:24:
windows版安装有问题，不知其他人的安装情况如何
毕竟是刚出的，很多代码还需要调试，先观望一下

[ Last edited by liuyihua on 2009-10-21 at 12:27 ]

我还是等等再用吧。
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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
5楼2009-10-22 07:00:32
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shistory

金虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-23 10:20
+号是其他系统的安装程序的展开吧，如linux。安装一切顺利，注意，要在本地运行autogrid 和autodock的话，还是要如同正常安装autodock一样，装cygwin，python的
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6楼2009-10-22 18:40:55
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xufund

至尊木虫 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请问和autodock,vina有什么区别
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7楼2009-10-22 21:12:45
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shistory

金虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-23 10:20
PyRx调用的就是Autogrid 和autodock的程序，相当于一个框架，不用写脚本就可以对多个任务进行处理
与Autodock vina是不同的。
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8楼2009-10-23 08:46:37
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shistory

金虫 (小有名气)
★
lei0736(金币+1):谢谢 1-25 20:37
引用回帖:
Originally posted by syfnet at 2009-10-21 17:13:
好东西，多谢楼主提供了。只是下载的时候那些＋号，我怎么都点不开，如何是好？是不是电脑缺东西了？

不同的操作系统，下载对应版本的PyRx
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9楼2009-10-23 11:38:42
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liuyihua

铁杆木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 1-26 20:41
引用回帖:
Originally posted by syfnet at 2009-10-21 17:13:
好东西，多谢楼主提供了。只是下载的时候那些＋号，我怎么都点不开，如何是好？是不是电脑缺东西了？

我用IE点不开，但用Opera点开了
赞一下(11人) 回复此楼
10楼2009-10-23 11:58:08
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