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junjun0711

新虫 (小有名气)

[求助] 小分子很少怎么做虚拟筛选啊!!已有2人参与

我有一味中药,早已应用于临床,治疗某病效果很好,只有十五个成分,老板希望试一试看这些小分子和某病靶点如何作用的,因为分子数太少,分子对接后没有一个小分子的打分能高于靶点蛋白原配体的打分,根本筛不出,实验室不是做计算这块,我也很菜鸟,希望有前辈能指点指点。
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smutao

禁虫 (著名写手)


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 感谢指导。 2014-01-03 09:16:24
本帖内容被屏蔽

2楼2014-01-02 17:11:41
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junjun0711

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-01-02 17:11:41
搞多点分子 用smiles格式扩展

那个药就只有那么多成分,是明确的~~没法找了
3楼2014-01-02 20:46:49
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monsoncupid

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 感谢指导。 2014-01-03 09:16:30
junjun0711: 金币+4, 有帮助 2014-01-03 10:21:16
做荧光呗,看相互作用强烈不,锁定关键组分之后再各种对接,总有一款适合你
宅若久时天然呆,呆到深处自然萌
4楼2014-01-02 21:35:09
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junjun0711

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by monsoncupid at 2014-01-02 21:35:09
做荧光呗,看相互作用强烈不,锁定关键组分之后再各种对接,总有一款适合你

能说详细点吗,不太懂啊
5楼2014-01-03 10:21:37
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monsoncupid

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


月只蓝: 金币+1, 感谢指导。 2014-01-03 17:07:43
意思就是一共才十几个关键成分,逐个提取出来,然后与你的靶标蛋白相互作用,测定荧光紫外光谱,然后再根据什么stern-volmer方程之类的算什么猝灭常数之类之类的,分析一番哪个组分的相互作用比较强烈,然后存在相互作用的几个组分再做分子对接,Cdocker 不行就 flexible docking 、libdock 之类的对接程序挨个试,看哪个打分高就搞定了
宅若久时天然呆,呆到深处自然萌
6楼2014-01-03 16:26:12
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ferlich

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

7楼2014-01-03 16:53:07
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合研生物

新虫 (小有名气)


可以 把资料信息发给我们技术看看,我们计算机辅助药物设计这块还是不错的,有不少客户在后续生物验证后表示很有效果。
8楼2018-10-09 08:57:57
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