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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 小分子很少怎么做虚拟筛选啊！！
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junjun0711

新虫 (小有名气)

[求助] 小分子很少怎么做虚拟筛选啊！！ 已有2人参与

我有一味中药，早已应用于临床，治疗某病效果很好，只有十五个成分，老板希望试一试看这些小分子和某病靶点如何作用的，因为分子数太少，分子对接后没有一个小分子的打分能高于靶点蛋白原配体的打分，根本筛不出，实验室不是做计算这块，我也很菜鸟，希望有前辈能指点指点。
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1楼 2014-01-02 16:58:34
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smutao

禁虫 (著名写手)
★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 感谢指导。 2014-01-03 09:16:24
本帖内容被屏蔽
2楼2014-01-02 17:11:41
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junjun0711

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-01-02 17:11:41
搞多点分子 用smiles格式扩展

那个药就只有那么多成分，是明确的~~没法找了
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3楼2014-01-02 20:46:49
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monsoncupid

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 感谢指导。 2014-01-03 09:16:30
junjun0711: 金币+4, ★有帮助 2014-01-03 10:21:16
做荧光呗，看相互作用强烈不，锁定关键组分之后再各种对接，总有一款适合你
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宅若久时天然呆，呆到深处自然萌
4楼2014-01-02 21:35:09
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junjun0711

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by monsoncupid at 2014-01-02 21:35:09
做荧光呗，看相互作用强烈不，锁定关键组分之后再各种对接，总有一款适合你

能说详细点吗，不太懂啊
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5楼2014-01-03 10:21:37
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monsoncupid

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导。 2014-01-03 17:07:43
意思就是一共才十几个关键成分，逐个提取出来，然后与你的靶标蛋白相互作用，测定荧光紫外光谱，然后再根据什么stern-volmer方程之类的算什么猝灭常数之类之类的，分析一番哪个组分的相互作用比较强烈，然后存在相互作用的几个组分再做分子对接，Cdocker 不行就 flexible docking 、libdock 之类的对接程序挨个试，看哪个打分高就搞定了
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宅若久时天然呆，呆到深处自然萌
6楼2014-01-03 16:26:12
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ferlich

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
7楼2014-01-03 16:53:07
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合研生物

新虫 (小有名气)
可以 把资料信息发给我们技术看看，我们计算机辅助药物设计这块还是不错的，有不少客户在后续生物验证后表示很有效果。
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8楼2018-10-09 08:57:57
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