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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » linux下的autodock在run autodock时不出现dlg文件
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

[求助] linux下的autodock在run autodock时不出现dlg文件

有没有人遇到linux下的autodock在run autodock时不出现dlg文件，窗口一闪而过的情况？
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坚持就是胜利
1楼 2013-06-03 09:16:28
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
邓芳: 金币+10, ★有帮助 2013-06-03 23:02:13
1：首先确保生成了glg文件，这一步没有成功的话，autodock这一步就不会成功
2：其次看看autodock的小文件是否放在了主文件夹中
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2楼2013-06-03 09:19:42
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2013-06-03 09:19:42
1：首先确保生成了glg文件，这一步没有成功的话，autodock这一步就不会成功
2：其次看看autodock的小文件是否放在了主文件夹中

glg文件生成，run autogrid 这一步成功，autodock的小文件也放在了主文件夹了
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坚持就是胜利
3楼2013-06-03 10:11:17
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keke_1210

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
邓芳: 金币+10, ★有帮助 2013-06-03 23:02:03
看一下对接的dpf文件是否生成，再者查看命令是否输错，输出时是否保存在dlg文件中
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你好吗
4楼2013-06-03 10:27:52
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
4楼: Originally posted by keke_1210 at 2013-06-03 10:27:52
看一下对接的dpf文件是否生成，再者查看命令是否输错，输出时是否保存在dlg文件中

dpf生成了，我用的是图形界面，输出时是保存在dlg文件中，但
run autodock 直接一闪而过，没有出现dlg文件
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坚持就是胜利
5楼2013-06-03 10:33:49
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
问题解决了，谢谢大家的帮助
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坚持就是胜利
6楼2013-06-03 23:01:43
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qxluan88

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 邓芳 at 2013-06-03 23:01:43
问题解决了，谢谢大家的帮助

你好，请问你的问题怎么解决的啊？我现在在运行dock过程中能产生dlg文件，也能看到运行进程，但是运行结束，虽然显示successful，但是生成的dlg文件却是空的
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7楼2013-08-22 17:21:18
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
7楼: Originally posted by qxluan88 at 2013-08-22 17:21:18
你好，请问你的问题怎么解决的啊？我现在在运行dock过程中能产生dlg文件，也能看到运行进程，但是运行结束，虽然显示successful，但是生成的dlg文件却是空的...

下载源码 地址：http://autodock.scripps.edu/down ... -4.2.5.1-src.tar.gz
解压缩  然后 ./configure  再make
就可以了。
实际上就是进行一下编译
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坚持就是胜利
8楼2013-08-23 08:50:57
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幻亦真

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 邓芳 at 2013-08-23 08:50:57
下载源码 地址：http://autodock.scripps.edu/down ... -4.2.5.1-src.tar.gz
解压缩  然后 ./configure  再make
就可以了。
实际上就是进行一下编译...

现在这个地址打不开呀。  autodock的官网上有4.2.5.1-src.tar.gz吗？在哪个版块儿？
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9楼2014-06-30 11:00:18
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