| 查看: 2840 | 回复: 12 | ||||
[交流]
【求助】Autodock运行时无法生成log文件？ 已有3人参与
|
||||
|
刚装了Autodock，按照tutorial的介绍，配体和受体pdbqt文件都已生成并保存至默认文件夹 下，Autogrid4运行正常，但是按照tutorial的方法设置好参数运行Autodock4时，却出现了下 面的情况： Running: autodock4 -p C:\Documents and Settings\Administrator\lt64.dpf autodock4: can't create log file C:\Documents and Settings\Administrator\lt64ޱﾝ.dlg autodock4: Unsuccessful Completion. 文件名中没有汉字，但是lt64后面总是出现乱码，是不是这个有影响啊，是否是因为在Windows下运行的问题。如果直接用Python脚本运行，如何操作啊？ 我是刚刚接触这个软件，希望高手不吝赐教！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子对接问题锦集 |
» 猜你喜欢
280分求调剂 一志愿085802
已经有6人回复
-
0854电子信息求调剂
已经有3人回复
-
263求调剂
已经有4人回复
-
石河子大学（211、双一流）硕博研究生长期招生公告
已经有3人回复
-
一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂
已经有13人回复
-
北科281学硕材料求调剂
已经有6人回复
-
328求调剂，英语六级551，有科研经历
已经有10人回复
-
298求调剂
已经有6人回复
-
310求调剂
已经有4人回复
-
311求调剂
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 有关autodock发文章的问题
已经有10人回复
- Autodock时 gridbox的参数怎么设置??
已经有18人回复
- AutoDock产生的结果dlg文件转化成pdb文件
已经有13人回复
- autodock运行时Can't create log file
已经有4人回复
- 【讨论】autodock时出现autodock4: can't create log file！
已经有4人回复
- 【讨论】autodock运行时间过长
已经有12人回复
- 【原创】AutoDock使用笔记总结－原创始发
已经有32人回复
4楼2010-12-14 11:09:33
6楼2012-02-15 20:36:57
lrf1980
新虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 41 (小学生)
- 金币: 1254.2
- 红花: 3
- 帖子: 136
- 在线: 52.5小时
- 虫号: 2060967
- 注册: 2012-10-14
- 专业: 药物化学
★ ★ ★ ★ ★
petto19(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+4, 谢谢~ 2012-12-27 09:39:47
petto19(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+4, 谢谢~ 2012-12-27 09:39:47
|
用mgltools运行autodock的时候有几个问题一定要注意： 1. 目录路径里面不能有含空格的目录名，楼主的目录（Documents and Settings）里含有了，所以很容易出错 2. 尽量把mgltools目录里面的adt.bat文件，autodock, autogrid文件放在自己的工作目录，然后运行这个adt去打开mgltools 3. 这个其实是大家比较会忽略的问题，就是当你运行autodock时候，其实跳出来的窗口会询问你的工作目录，autodock目录，autogrid目录。一般autodock和autogrid目录我们都会选，但是很容易忘记选工作目录。 如果这三点都弄对了，一般计算不会出错，最多就是windows有的时候算算就死掉了。哈哈。 |
9楼2012-12-26 21:16:04
caixin5120 
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 46 (小学生)
- 金币: 5.9
- 散金: 100
- 红花: 3
- 帖子: 483
- 在线: 158.3小时
- 虫号: 576460
- 注册: 2008-06-20
- 专业: 药物化学
2楼2010-12-10 01:33:44
pjiang
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1942.2
- 散金: 126
- 红花: 3
- 沙发: 6
- 帖子: 765
- 在线: 120.7小时
- 虫号: 1084113
- 注册: 2010-08-29
- 专业: 呼吸系统肿瘤
3楼2010-12-11 00:51:29
chemozhang
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3431.1
- 散金: 462
- 红花: 12
- 帖子: 615
- 在线: 356小时
- 虫号: 282954
- 注册: 2006-10-08
- 性别: GG
- 专业: 药物学
5楼2011-09-05 19:59:21
505263584
木虫 (小有名气)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 2433.6
- 散金: 19
- 红花: 2
- 帖子: 147
- 在线: 157.4小时
- 虫号: 1070887
- 注册: 2010-08-07
- 专业: 色谱分析
7楼2012-02-20 20:03:21
hebe605
银虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1208.5
- 散金: 100
- 红花: 1
- 帖子: 229
- 在线: 158.2小时
- 虫号: 1391305
- 注册: 2011-09-05
- 专业: 金属有机化学
8楼2012-12-26 17:56:11
29050801
新虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1065.5
- 散金: 6
- 红花: 1
- 帖子: 163
- 在线: 78.4小时
- 虫号: 1765116
- 注册: 2012-04-19
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
10楼2013-08-16 09:59:16
