24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2880  |  回复: 12

petto19

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Autodock运行时无法生成log文件? 已有3人参与

刚装了Autodock,按照tutorial的介绍,配体和受体pdbqt文件都已生成并保存至默认文件夹

下,Autogrid4运行正常,但是按照tutorial的方法设置好参数运行Autodock4时,却出现了下

面的情况:

Running: autodock4 -p C:\Documents and Settings\Administrator\lt64.dpf

autodock4: can't create log file C:\Documents and Settings\Administrator\lt64ޱン.dlg

autodock4: Unsuccessful Completion.

文件名中没有汉字,但是lt64后面总是出现乱码,是不是这个有影响啊,是否是因为在Windows下运行的问题。如果直接用Python脚本运行,如何操作啊?

我是刚刚接触这个软件,希望高手不吝赐教!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子对接问题锦集

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

petto19

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by caixin5120 at 2010-12-10 01:33:44:
唉,把linux下的软件用到win下真是问题多多!

其次,最好使用命令进行Autdock的计算!

是的,用命令进行计算确实能够解决问题,在win下就是有问题
4楼2010-12-14 11:09:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lovedi

银虫 (小有名气)


petto19(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
3楼: Originally posted by pjiang at 2010-12-11 00:51:29:
顶起来

如何让使用命令进行autodock计算啊?
6楼2012-02-15 20:36:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lrf1980

新虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
petto19(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+4, 谢谢~ 2012-12-27 09:39:47
用mgltools运行autodock的时候有几个问题一定要注意:
1. 目录路径里面不能有含空格的目录名,楼主的目录(Documents and Settings)里含有了,所以很容易出错
2. 尽量把mgltools目录里面的adt.bat文件,autodock, autogrid文件放在自己的工作目录,然后运行这个adt去打开mgltools
3. 这个其实是大家比较会忽略的问题,就是当你运行autodock时候,其实跳出来的窗口会询问你的工作目录,autodock目录,autogrid目录。一般autodock和autogrid目录我们都会选,但是很容易忘记选工作目录。
如果这三点都弄对了,一般计算不会出错,最多就是windows有的时候算算就死掉了。哈哈。
9楼2012-12-26 21:16:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
petto19(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-10 10:41:53
唉,把linux下的软件用到win下真是问题多多!

其次,最好使用命令进行Autdock的计算!
2楼2010-12-10 01:33:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pjiang

金虫 (正式写手)


petto19(金币+1):谢谢参与
顶起来
自在飞花轻似梦;无边丝雨细如愁
3楼2010-12-11 00:51:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemozhang

木虫 (正式写手)

帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集
故地如重游月圆更寂寞
5楼2011-09-05 19:59:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

505263584

木虫 (小有名气)


petto19(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by petto19 at 2010-12-14 11:09:33:
是的,用命令进行计算确实能够解决问题,在win下就是有问题

请教,怎么使用命令啊!出现和lz同样的问题啦
7楼2012-02-20 20:03:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hebe605

银虫 (小有名气)


petto19(金币+1): 谢谢参与
你们的问题解决了吗      跪求解决方法
8楼2012-12-26 17:56:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

29050801

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
有时候是现在一个文件夹建立一个 *.dlg的文件
再把文件的路径粘贴到那里
好像还可以啊

有时候默认设置不显示他的路径
我就经常这么做

话说我也不太熟悉这东西
个人主页http://cnrdn.com/pXg5
10楼2013-08-16 09:59:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 petto19 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 286求调剂 +25 Faune 2026-04-06 25/1250 2026-04-11 23:23 by labixiaoqiao
[考研] 0860004 求调剂 309分 +9 Yin DY 2026-04-08 9/450 2026-04-11 22:55 by dongdian1
[考研] 085500求调剂材料 +10 易11122 2026-04-09 10/500 2026-04-11 10:39 by maddjdld
[考研] 农业管理302分求调剂 +3 xuening1 2026-04-10 3/150 2026-04-11 10:18 by zhq0425
[考研] 一志愿985机械学硕380求调剂 +5 关关雎鸠10 2026-04-11 5/250 2026-04-11 10:10 by 知念。A
[考研] 337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 08:57 by zhq0425
[考研] 085506-求调剂-285分 +3 雷欧飞踢 2026-04-08 3/150 2026-04-11 08:37 by zhq0425
[考研] 314求调剂 +23 wakeluofu 2026-04-09 24/1200 2026-04-10 15:31 by MOF_Catal
[考研] 青岛科技大学材料学院,环境学院调剂补录4月10日以前都可以 +3 1青科大。 2026-04-09 5/250 2026-04-10 09:58 by 翩翩一书生
[考研] 本科郑州大学,一志愿华东师范大学282求调剂 +23 熊哥xtk 2026-04-07 26/1300 2026-04-09 17:17 by 18446523
[考研] 085600材料与化工,求调剂 +11 won_qii 2026-04-07 11/550 2026-04-09 17:03 by luoyongfeng
[考研] 土木水利专硕276分求调剂 +6 我想上学!!6 2026-04-05 9/450 2026-04-08 17:45 by 宋小宝HQ
[考研] 一志愿南昌大学,085600,344分求调剂 +11 调剂上岸玘 2026-04-05 12/600 2026-04-08 16:17 by luoyongfeng
[考研] 一志愿吉大化学327求调剂 +12 王王白石 2026-04-06 13/650 2026-04-08 16:05 by luoyongfeng
[考研] 电子信息346 +4 zuoshaodian 2026-04-08 4/200 2026-04-08 11:54 by zzucheup
[考研] 调剂求助(生物与医药) +6 @6952 2026-04-06 6/300 2026-04-07 23:52 by lys0704
[考研] 071000生物学,一志愿深圳大学296分,求调剂 +12 TIckLw 2026-04-06 13/650 2026-04-07 20:34 by lijunpoly
[考研] 一志愿武汉理工大学080200机械工程308分,求调剂 +4 终不似从前 2026-04-05 4/200 2026-04-06 11:46 by 考研学校招点人
[考研] 08专硕275调剂 +5 AaAa7420 2026-04-05 5/250 2026-04-05 18:01 by jkddd
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358求调剂 +6 cs0106 2026-04-05 6/300 2026-04-05 16:34 by imissbao
信息提示
请填处理意见