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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】Autodock运行时无法生成log文件？
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petto19

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Autodock运行时无法生成log文件？ 已有3人参与

刚装了Autodock，按照tutorial的介绍，配体和受体pdbqt文件都已生成并保存至默认文件夹

下，Autogrid4运行正常，但是按照tutorial的方法设置好参数运行Autodock4时，却出现了下

面的情况：

Running: autodock4 -p C:\Documents and Settings\Administrator\lt64.dpf

autodock4: can't create log file C:\Documents and Settings\Administrator\lt64ޱﾝ.dlg

autodock4: Unsuccessful Completion.

文件名中没有汉字，但是lt64后面总是出现乱码，是不是这个有影响啊，是否是因为在Windows下运行的问题。如果直接用Python脚本运行，如何操作啊？

我是刚刚接触这个软件，希望高手不吝赐教！
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1楼 2010-09-27 11:21:33
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lrf1980

新虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
petto19(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+4, 谢谢~ 2012-12-27 09:39:47
用mgltools运行autodock的时候有几个问题一定要注意：
1. 目录路径里面不能有含空格的目录名，楼主的目录（Documents and Settings）里含有了，所以很容易出错
2. 尽量把mgltools目录里面的adt.bat文件，autodock, autogrid文件放在自己的工作目录，然后运行这个adt去打开mgltools
3. 这个其实是大家比较会忽略的问题，就是当你运行autodock时候，其实跳出来的窗口会询问你的工作目录，autodock目录，autogrid目录。一般autodock和autogrid目录我们都会选，但是很容易忘记选工作目录。
如果这三点都弄对了，一般计算不会出错，最多就是windows有的时候算算就死掉了。哈哈。
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9楼2012-12-26 21:16:04
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caixin5120

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
petto19(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-10 10:41:53
唉，把linux下的软件用到win下真是问题多多！

其次，最好使用命令进行Autdock的计算！
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2楼2010-12-10 01:33:44
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petto19

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by caixin5120 at 2010-12-10 01:33:44:
唉，把linux下的软件用到win下真是问题多多！

其次，最好使用命令进行Autdock的计算！

是的，用命令进行计算确实能够解决问题，在win下就是有问题
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4楼2010-12-14 11:09:33
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
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故地如重游月圆更寂寞
5楼2011-09-05 19:59:21
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