24小时热门版块排行榜    

查看: 3435  |  回复: 12

petto19

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Autodock运行时无法生成log文件? 已有3人参与

刚装了Autodock,按照tutorial的介绍,配体和受体pdbqt文件都已生成并保存至默认文件夹

下,Autogrid4运行正常,但是按照tutorial的方法设置好参数运行Autodock4时,却出现了下

面的情况:

Running: autodock4 -p C:\Documents and Settings\Administrator\lt64.dpf

autodock4: can't create log file C:\Documents and Settings\Administrator\lt64ޱン.dlg

autodock4: Unsuccessful Completion.

文件名中没有汉字,但是lt64后面总是出现乱码,是不是这个有影响啊,是否是因为在Windows下运行的问题。如果直接用Python脚本运行,如何操作啊?

我是刚刚接触这个软件,希望高手不吝赐教!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

petto19

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by caixin5120 at 2010-12-10 01:33:44:
唉,把linux下的软件用到win下真是问题多多!

其次,最好使用命令进行Autdock的计算!

是的,用命令进行计算确实能够解决问题,在win下就是有问题
4楼2010-12-14 11:09:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lovedi

银虫 (小有名气)


petto19(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
3楼: Originally posted by pjiang at 2010-12-11 00:51:29:
顶起来

如何让使用命令进行autodock计算啊?
6楼2012-02-15 20:36:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lrf1980

新虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
petto19(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+4, 谢谢~ 2012-12-27 09:39:47
用mgltools运行autodock的时候有几个问题一定要注意:
1. 目录路径里面不能有含空格的目录名,楼主的目录(Documents and Settings)里含有了,所以很容易出错
2. 尽量把mgltools目录里面的adt.bat文件,autodock, autogrid文件放在自己的工作目录,然后运行这个adt去打开mgltools
3. 这个其实是大家比较会忽略的问题,就是当你运行autodock时候,其实跳出来的窗口会询问你的工作目录,autodock目录,autogrid目录。一般autodock和autogrid目录我们都会选,但是很容易忘记选工作目录。
如果这三点都弄对了,一般计算不会出错,最多就是windows有的时候算算就死掉了。哈哈。
9楼2012-12-26 21:16:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
petto19(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-10 10:41:53
唉,把linux下的软件用到win下真是问题多多!

其次,最好使用命令进行Autdock的计算!
2楼2010-12-10 01:33:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pjiang

金虫 (正式写手)


petto19(金币+1):谢谢参与
顶起来
自在飞花轻似梦;无边丝雨细如愁
3楼2010-12-11 00:51:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemozhang

木虫 (正式写手)

帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集
故地如重游月圆更寂寞
5楼2011-09-05 19:59:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

505263584

木虫 (小有名气)


petto19(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by petto19 at 2010-12-14 11:09:33:
是的,用命令进行计算确实能够解决问题,在win下就是有问题

请教,怎么使用命令啊!出现和lz同样的问题啦
7楼2012-02-20 20:03:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hebe605

银虫 (小有名气)


petto19(金币+1): 谢谢参与
你们的问题解决了吗      跪求解决方法
8楼2012-12-26 17:56:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

29050801

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
有时候是现在一个文件夹建立一个 *.dlg的文件
再把文件的路径粘贴到那里
好像还可以啊

有时候默认设置不显示他的路径
我就经常这么做

话说我也不太熟悉这东西
个人主页http://cnrdn.com/pXg5
10楼2013-08-16 09:59:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 petto19 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-09-02 00:19 by xiangy672
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
请填处理意见