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petto19

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Autodock运行时无法生成log文件? 已有3人参与

刚装了Autodock,按照tutorial的介绍,配体和受体pdbqt文件都已生成并保存至默认文件夹

下,Autogrid4运行正常,但是按照tutorial的方法设置好参数运行Autodock4时,却出现了下

面的情况:

Running: autodock4 -p C:\Documents and Settings\Administrator\lt64.dpf

autodock4: can't create log file C:\Documents and Settings\Administrator\lt64ޱン.dlg

autodock4: Unsuccessful Completion.

文件名中没有汉字,但是lt64后面总是出现乱码,是不是这个有影响啊,是否是因为在Windows下运行的问题。如果直接用Python脚本运行,如何操作啊?

我是刚刚接触这个软件,希望高手不吝赐教!
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petto19

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by caixin5120 at 2010-12-10 01:33:44:
唉,把linux下的软件用到win下真是问题多多!

其次,最好使用命令进行Autdock的计算!

是的,用命令进行计算确实能够解决问题,在win下就是有问题
4楼2010-12-14 11:09:33
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lovedi

银虫 (小有名气)

★
petto19(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
3楼: Originally posted by pjiang at 2010-12-11 00:51:29:
顶起来

如何让使用命令进行autodock计算啊?
6楼2012-02-15 20:36:57
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lrf1980

新虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
petto19(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+4, 谢谢~ 2012-12-27 09:39:47
用mgltools运行autodock的时候有几个问题一定要注意:
1. 目录路径里面不能有含空格的目录名,楼主的目录(Documents and Settings)里含有了,所以很容易出错
2. 尽量把mgltools目录里面的adt.bat文件,autodock, autogrid文件放在自己的工作目录,然后运行这个adt去打开mgltools
3. 这个其实是大家比较会忽略的问题,就是当你运行autodock时候,其实跳出来的窗口会询问你的工作目录,autodock目录,autogrid目录。一般autodock和autogrid目录我们都会选,但是很容易忘记选工作目录。
如果这三点都弄对了,一般计算不会出错,最多就是windows有的时候算算就死掉了。哈哈。
9楼2012-12-26 21:16:04
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普通回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
petto19(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-10 10:41:53
唉,把linux下的软件用到win下真是问题多多!

其次,最好使用命令进行Autdock的计算!
2楼2010-12-10 01:33:44
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pjiang

金虫 (正式写手)

★
petto19(金币+1):谢谢参与
顶起来
自在飞花轻似梦;无边丝雨细如愁
3楼2010-12-11 00:51:29
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chemozhang

木虫 (正式写手)

帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
故地如重游月圆更寂寞
5楼2011-09-05 19:59:21
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505263584

木虫 (小有名气)

★
petto19(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by petto19 at 2010-12-14 11:09:33:
是的,用命令进行计算确实能够解决问题,在win下就是有问题

请教,怎么使用命令啊!出现和lz同样的问题啦
7楼2012-02-20 20:03:21
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hebe605

银虫 (小有名气)

★
petto19(金币+1): 谢谢参与
你们的问题解决了吗      跪求解决方法
8楼2012-12-26 17:56:11
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29050801

新虫 (小有名气)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
有时候是现在一个文件夹建立一个 *.dlg的文件
再把文件的路径粘贴到那里
好像还可以啊

有时候默认设置不显示他的路径
我就经常这么做

话说我也不太熟悉这东西
个人主页http://cnrdn.com/pXg5
10楼2013-08-16 09:59:16
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