应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请问：Autodock计算导出的小分子结构有问题，请问如何解决!
51/1返回列表
查看: 1709  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

supengchen

银虫 (正式写手)

[求助] 请问：Autodock计算导出的小分子结构有问题，请问如何解决! 已有3人参与

请问：Autodock计算导出的小分子结构/构象有问题，如下图（第一个是导出的结果，第二张计算之前的结构显示图，第三张是结构式），请问如何解决！
请问：Autodock计算导出的小分子结构有问题，请问如何解决!
分子计算问题求助.JPG


请问：Autodock计算导出的小分子结构有问题，请问如何解决!-1
计算前分子模型.JPG


请问：Autodock计算导出的小分子结构有问题，请问如何解决!-2
原结构1.JPG
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
新阶段，新起点！
1楼 2014-03-12 13:40:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

supengchen

银虫 (正式写手)
我的其他的分子中有这样的结构的（，但是都好的，就是这个不好，应该不是chem3D的原因吧！
赞一下 回复此楼
新阶段，新起点！
5楼2014-03-14 11:13:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-14 08:15:38
重新优化小分子的结构，小分子结构优化不好会出现此问题
赞一下 回复此楼
2楼2014-03-12 17:58:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

姜志文

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-14 08:15:46
你分子的pdb文件是用什么做的，是chem3d吗，如果是，看看是不是本身有问题。。。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
3楼2014-03-13 00:02:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-14 08:15:51
结构没什么问题吧，那个键应该是显示的问题
赞一下 回复此楼
理论与计算化学，化学物理，生物物理
4楼2014-03-13 05:15:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 10:46 by 1Nb0IVlmV6v0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 10:35 by 1Nb0IVlmV6v0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 6/300 2026-11-11 10:26 by 1Nb0IVlmV6v0
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 7/350 2026-11-11 10:24 by 1Nb0IVlmV6v0
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 10:13 by 1Nb0IVlmV6v0
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 5/250 2026-11-11 10:10 by 1Nb0IVlmV6v0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 13/650 2026-11-11 09:22 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 4/200 2026-11-11 08:34 by 1Nb0IVlmV6v0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 07:06 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:40 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:07 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 03:56 by Z7qfCsdIiD1T
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:54 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:10 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 5/250 2026-11-11 00:59 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 申请环境，微生物方向博士 +3 浅笑09 2026-11-08 3/150 2026-11-10 12:44 by 可淡不可忘
[考博] 27博士申请 +3 白白白ly 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:39 by szq0819
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭