| 查看: 4023 | 回复: 16 | ||
thunderay铁杆木虫 (小有名气)
|
[求助]
Sybyl 3D-QSAR Q^2为负
|
|
|
在用Sybyl进行3D-QSAR拟合时 IC50与Comfa值做PLS分析 Q^2总是小于零 之前已进行过分子优化和叠合 应该如何调整？ |
回复此楼» 猜你喜欢
一志愿华东师范生物学326分，求调剂
已经有4人回复
-
071000生物学调剂求助
已经有11人回复
-
化学工程与技术324调剂
已经有16人回复
-
298求调剂
已经有4人回复
-
282，求调剂
已经有9人回复
-
考研调剂
已经有19人回复
-
308求调剂
已经有20人回复
-
中科院总分315求调剂
已经有3人回复
-
求调剂 材料与工程 324分 专硕
已经有3人回复
-
一志愿矿大，材料工程专硕314分，0856可调都可以
已经有12人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 扣式电池，正极锂钴氧，负极用锂片，充放电曲线应该是什么样的啊？
已经有7人回复
- 求w版的3D-QSAR软件下载
已经有4人回复
- 【讨论】阅读两篇文献的思考——磁性介孔二氧化硅负载金纳米粒子催化硝基苯酚还原为氨
已经有12人回复
- 【求助】请问3D-QSAR中的最佳组分数
已经有14人回复
- 【求助】请教用DS做3D-QSAR问题
已经有11人回复
- 【求助】三维定量构效关系(3D-QSAR) 软件多少钱？
已经有10人回复
- 【求助】怎样做好药物设计及合成
已经有17人回复
bbslover
金虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 5402.3
- 散金: 191
- 红花: 3
- 帖子: 540
- 在线: 142.4小时
- 虫号: 508292
- 注册: 2008-02-20
- 性别: GG
- 专业: 化学信息学
8楼2012-01-08 20:32:37
景宿
铜虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 31.6
- 散金: 40
- 帖子: 147
- 在线: 54.2小时
- 虫号: 855358
- 注册: 2009-09-24
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
2楼2011-11-30 20:35:01
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
御剑江湖(金币+5): 谢谢，欢迎常来分子模拟板块。 2011-12-21 18:42:58
thunderay(金币+2): ★★★很有帮助 谢谢，我做的是基于骨架的叠合，可能是叠合时都已经用了之前优化好的构象，但是在叠合的时候不能用多构象进行叠合；数据都是自己实验室近期做出来的，也可能本身就不是很好。 2011-12-22 08:54:41
感谢参与，应助指数 +1
御剑江湖(金币+5): 谢谢，欢迎常来分子模拟板块。 2011-12-21 18:42:58
thunderay(金币+2): ★★★很有帮助 谢谢，我做的是基于骨架的叠合，可能是叠合时都已经用了之前优化好的构象，但是在叠合的时候不能用多构象进行叠合；数据都是自己实验室近期做出来的，也可能本身就不是很好。 2011-12-22 08:54:41
|
1、造成这种结果主要是分子叠合的问题，不知道楼主是基于骨架的叠合还是基于分子对接的叠合，分子叠合不仅基本骨架要叠合好，每一个分子的基团构象都非常重要，主要药效元素基团要尽量和配体分子相近。 2、活性数据关系也很大，首先检验数据转换有没有问题，其次要考虑原始活性数据有没有出错（这个不太容易，如果文献较多时可以多方面参考来分析原始活性数据的可靠性）；另外，你找的活性数据是不是同一实验室的同一实验方法同一实验条件下做出来的，也就是说活性数据必须具有可比性。 根据经验，主要还是叠合的问题，建议多换构象，多做叠合，多做几次 |
3楼2011-12-21 16:16:34
4楼2012-01-04 15:47:57
bbslover
金虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 5402.3
- 散金: 191
- 红花: 3
- 帖子: 540
- 在线: 142.4小时
- 虫号: 508292
- 注册: 2008-02-20
- 性别: GG
- 专业: 化学信息学
5楼2012-01-07 20:48:13
thunderay
铁杆木虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 14885.3
- 红花: 1
- 帖子: 182
- 在线: 129.8小时
- 虫号: 425995
- 注册: 2007-07-28
- 性别: GG
- 专业: 生物制药
6楼2012-01-08 12:41:42
7楼2012-01-08 20:08:55
9楼2012-01-08 20:45:59
bbslover
金虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 5402.3
- 散金: 191
- 红花: 3
- 帖子: 540
- 在线: 142.4小时
- 虫号: 508292
- 注册: 2008-02-20
- 性别: GG
- 专业: 化学信息学
10楼2012-01-08 23:41:38
