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铁虫 (小有名气)

[求助] Gromacs模拟构象分析求助

问各位一个问题，刚入门，做了一个小分子与蛋白对接构象的Gromacs模拟，得到了结果。我的问题是：如何分析Gromacs模拟，从轨迹文件中找到那个最稳定，或者说最可能与真实世界一致的那个蛋白构象？有没有合适的教程或文献？谢谢各位！

1楼 2020-08-28 09:45:54

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新虫 (著名写手)

真实世界里面蛋白的构象也在不停发生变化，是一个动态的过程。有研究取的一段稳定轨迹里的固定帧数。然后算出所谓的平均结构。可能和你想表达的有些类似

发自小木虫Android客户端

2楼2020-08-28 16:25:03

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