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Yolanda9288新虫 (小有名气)
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[交流]
VMD怎样建立两个磷脂双分子层
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就是怎样创建两层脂质膜，叠在一起，membrane插件只能建一层，望大神指导 发自小木虫Android客户端 |
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2楼2019-11-28 12:30:00
Yolanda9288
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 60.3
- 散金: 20
- 红花: 1
- 帖子: 56
- 在线: 11.6小时
- 虫号: 6669809
- 注册: 2017-06-02
- 专业: 生物医学系统建模及仿真
送红花一朵 |
谢谢，根据你的提示，我建了两层膜，移动到指定位置后，需要合并两个pdb，根据小木虫上的帖子修改segname： mol new popc.pdb mol addfile popc.psf set allsel [atomselect top all] $allsel set segname NEW $allsel writepdb popc-2.pdb $allsel writepsf popc-2.psf 然后再合并 package require psfgen resetpsf readpsf popc.psf coordpdb popc.pdb readpsf popc-2.psf coordpdb popc-2.pdb writepsf popc_dw.psf writepdb popc_dw.pdb 老是报错： Unable to add (duplicate?) residue NEW:1 是不是修改segname出错了？？查了半天，也没找到方法，望大神再耐心指导一下，本人刚接触NAMD，毫无头绪 |
3楼2019-12-03 10:31:11
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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4楼2019-12-31 16:19:34
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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5楼2020-01-02 17:23:22
6楼2020-01-02 19:35:22
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7楼2020-01-04 11:18:25
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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8楼2020-01-06 16:57:55
40