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Gromacs/Amber/NAMD
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兔斯基xcl
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Gromacs
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[已完结]
求助做分子对接之后的分析软件
(8/2502)
斯芬克斯喵
2018-03-20
2022-01-04 14:21:45
by
孤独的皮特祁
[
Gromacs
]
[已完结]
对接的分子用于分子动力学模拟的问题
(
1
2
)
(评阅+1)
(12/3743)
haiyanqian
2014-01-20
2022-01-04 14:20:10
by
孤独的皮特祁
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Gromacs
]
yasara软件教程
(1/1232)
boychuan
2021-11-23
2022-01-04 11:37:58
by
Phama man
[
Gromacs
]
LAMMPS中 fix box/relax 的用法
(1/6904)
cxlxx10000
2017-12-01
2022-01-04 06:04:46
by
future_wl
[
Gromacs
]
gromacs 求助
10
(0/525)
吧吧啦啦
2021-12-11
2021-12-11 10:19:38
by
吧吧啦啦
[
Gromacs
]
[已完结]
如何使用AMBER对一个6肽YHCVEC进行分子动力学优化然后找到能量最低的构象
(1/879)
dahua9918
2015-12-04
2021-12-11 07:02:13
by
pq_zhang
[
Gromacs
]
【分子动力学模拟】gromacs进行六个不同多肽自组装
5
(0/1070)
图图tutu20
2021-12-10
2021-12-10 14:20:52
by
图图tutu20
[
Gromacs
]
[已完结]
VMD计算成氢建分子的坐标
(5/1025)
百斤四
2017-07-20
2021-12-07 17:56:35
by
1040720479
[
Gromacs
]
gromacs的运行
(2/1165)
yhj
2021-11-17
2021-12-04 21:10:46
by
vyry2136
[
Gromacs
]
[已完结]
蛋白对接结果怎么能够快速的仿真看其是否稳定
(1/679)
recome
2019-06-11
2021-12-03 08:33:47
by
一代米哟
[
Gromacs
]
Amber动力学模拟,含有配体-蛋白复合物作为受体的动力学载入及识别问题。
100
(1/1234)
好好学习HQ
2020-07-07
2021-11-26 15:27:52
by
cngdkpmg
[
Gromacs
]
求助GAFF力场参数文件
(26/2081)
小小雨a
2019-10-07
2021-11-18 12:14:06
by
cngdkpmg
[
Gromacs
]
[已完结]
关于mmpbsa 错误,求指导:PrmtopError
(2/1905)
luckycao
2016-03-14
2021-11-05 12:40:23
by
lihong9639
[
Gromacs
]
请教GPU型号的选择
50
(3/1439)
syd89522
2021-06-11
2021-11-03 06:21:21
by
北海的星
[
Gromacs
]
[已完结]
怎样从盒子中取出一个分子和离该分子最近的几个溶剂分子
(1/392)
wbn
2015-10-17
2021-11-02 07:41:20
by
3518050
[
Gromacs
]
[已完结]
用Charmm-GUI搭了一个体系,并进行了扩充,在能量最小化时出现了以下问题
(4/1925)
戍角悲丶丶
2018-08-14
2021-10-09 14:41:48
by
yanqinglin
[
Gromacs
]
amber mmpbsa 长度与能量不匹配问题
10
(1/1150)
lily49
2021-03-30
2021-10-04 15:55:20
by
枫樰微飓
[
Gromacs
]
[已完结]
关于martini蛋白质粗粒化的问题
(2/1141)
jiangshengbo
2011-10-21
2021-09-29 13:28:41
by
1694568205
[
Gromacs
]
[已完结]
做完MD后,计算结合能,计算出的静电势能是正的是什么原因呢?
(2/1833)
zx66769185
2018-06-19
2021-09-29 13:25:21
by
1694568205
[
Gromacs
]
gromacs/lammps模拟
30
(1/849)
hyfishere
2021-09-25
2021-09-26 01:06:15
by
13972033882
[
Gromacs
]
【分享】Amber 在Windows操作系统的安装应用(已搜无重复)
(评阅+3)
(3/2140)
nnxqwei
2010-12-11
2021-09-24 06:40:55
by
阿拉很强大
[
Gromacs
]
请问Amber中cluster的用法
5
(0/757)
欧宝宝的鱼
2021-09-06
2021-09-06 10:40:57
by
欧宝宝的鱼
[
Gromacs
]
[已完结]
求助:Gromacs的g_energy另外一种用法 的具体步骤
(评阅+1)
(7/2690)
liyang1533
2011-05-16
2021-08-18 14:08:09
by
向海725
[
Gromacs
]
求问Gromacs如何计算RASA
(0/611)
Diurnals
2021-08-09
2021-08-09 20:13:30
by
Diurnals
[
Gromacs
]
[已完结]
有没有人用Amber做过膜蛋白动力学模拟
(
1
2
)
(14/3196)
200618530201
2012-02-06
2021-08-07 17:30:08
by
虫虫妃9527
[
Gromacs
]
求助AMBER膜蛋白动力学模拟
15
(1/713)
sun_5678
2020-12-29
2021-08-07 17:11:53
by
虫虫妃9527
[
Gromacs
]
[已完结]
膜蛋白分子动力学模拟体系的构建
(评阅+1)
(2/2369)
haiyanqian
2014-06-20
2021-08-07 17:05:16
by
虫虫妃9527
[
Gromacs
]
分子动力学模拟gro格式转换为 car
(0/941)
一品书屋
2021-08-07
2021-08-07 10:07:28
by
一品书屋
[
Gromacs
]
求教,gromacs分子模拟分析得到的拉氏图应该用什么绘制
5
(2/840)
看看调剂
2021-04-20
2021-08-06 19:38:06
by
MD-禾黍
[
Gromacs
]
基于Gromacs的蛋白分子识别研究
(0/586)
hazheng
2021-07-17
2021-07-17 12:36:46
by
hazheng
[
Gromacs
]
[已完结]
求助:Gromacs平衡时蛋白跑出盒子了,怎么办?
(评阅+1)
(7/3596)
xueer小雯
2014-02-26
2021-07-08 15:13:01
by
图图tutu20
[
Gromacs
]
ovito 配位数分析 显示。 配位数不是整数
5
(1/1588)
jackwangee
2021-07-04
2021-07-05 09:22:28
by
G、sir
[
Gromacs
]
直链淀粉在amber升温阶段出现问题?
(0/576)
木头平平
2021-06-21
2021-06-21 16:23:17
by
木头平平
[
Gromacs
]
[已完结]
请教用amber做md时出错,保存拓扑文件和坐标文件时
(3/981)
量化新手
2011-06-28
2021-06-18 11:32:48
by
木头平平
[
Gromacs
]
gromacs模拟小分子构象变化
(35/885)
珂卡芙
2021-06-08
2021-06-09 19:48:06
by
云在青天
[
Gromacs
]
[已完结]
Gromacs模拟药物溶液如何用磷酸缓冲液控制pH
(3/1340)
Youngchsh
2011-08-24
2021-06-08 16:42:15
by
小许高年级
[
Gromacs
]
[已完结]
不同PH值,gromacs 模拟
(2/1674)
abigrabbit
2012-10-20
2021-06-08 16:38:52
by
小许高年级
[
Gromacs
]
Gromacs求助
5
(1/740)
zhouling_0
2020-12-11
2021-06-08 16:26:37
by
小许高年级
[
Gromacs
]
Gromacs在能量最小化的时候可以改变盒子大小吗?
5
(1/898)
影月yingy
2021-06-06
2021-06-06 12:37:58
by
梧桐77
[
Gromacs
]
【求助】VMD中文使用手册
(
1
2
3
)
(23/6490)
licaiqin
2010-04-13
2021-05-30 17:15:09
by
gejsngsj
[
Gromacs
]
求助,哪里能找到全原子力场下石墨烯与dppc参数文件
43
(2/567)
physicsbin
2021-05-04
2021-05-05 14:34:11
by
jiaoyixiong
[
Gromacs
]
如何用MS构造硅烯的结构
10
(0/742)
myw123456
2021-04-28
2021-04-28 15:44:42
by
myw123456
[
Gromacs
]
[已完结]
界面张力计算
(评阅+1)
(5/2497)
Aimee6002
2015-05-12
2021-04-27 14:01:03
by
czsys
[
Gromacs
]
gromacs 极化参数问题
(2/815)
jessesunlu
2012-03-23
2021-04-27 13:52:51
by
s1999r
[
Gromacs
]
使用MolAICal基于NAMD模拟结果计算小分子和蛋白MM/GBSA的教程
(2/1733)
MolAICal
2020-08-18
2021-04-27 09:26:15
by
MolAICal
[
Gromacs
]
QM/MM
100
(0/518)
zy杨
2021-04-26
2021-04-26 20:16:05
by
zy杨
[
Gromacs
]
辐照模拟
5
(0/562)
Liuxy1028
2021-04-26
2021-04-26 11:00:20
by
Liuxy1028
[
Gromacs
]
[已完结]
关于gromacs添加离子的问题
(2/2725)
00811022
2016-09-06
2021-04-19 13:22:52
by
candery
[
Gromacs
]
gromacs 质子化
(1/1515)
zhuimeng08
2014-09-13
2021-04-18 18:10:32
by
李鱼儿游
[
Gromacs
]
prodrg的拓扑文件哪里有误
10
(0/729)
tomato0301
2021-04-17
2021-04-17 22:10:13
by
tomato0301
[
Gromacs
]
[已完结]
请问PRODRG网站有人能打开吗??求发链接!!!
(7/3726)
look0
2019-11-21
2021-04-17 08:10:52
by
tomato0301
[
Gromacs
]
请问怎么对PDB文件里的原子名称进行修改?
(
1
2
)
(11/2857)
mumun
2013-09-05
2021-04-14 13:09:04
by
吴臻Wvz
[
Gromacs
]
【求助】请问VMD中氢键如何统计
(
1
2
)
(评阅+1)
(18/9024)
Luv_XiaoMian
2014-11-12
2021-03-31 18:08:13
by
dbsydxdm
[
Gromacs
]
[已完结]
用amber制作小分子力场参数时突然遇到的一些问题
(
1
2
)
(评阅+6)
(12/3219)
白云鹤TJY
2014-02-21
2021-03-29 21:20:03
by
冷血孤峰
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs5.0.5,gmx distance的使用方法
(3/3590)
吉米爱多
2016-03-24
2021-03-27 10:07:12
by
兔子米迦勒
[
Gromacs
]
有偿求助 amber16 配体带金属离子
10
(1/628)
lily49
2021-02-12
2021-03-26 22:22:42
by
阿姨洗铁路哦
[
Gromacs
]
如何将一个冰块削成冰球
5
(2/735)
sweetbotsu
2021-03-25
2021-03-26 19:10:12
by
sweetbotsu
[
Gromacs
]
求助
(5/578)
七七V
2021-03-24
2021-03-24 21:22:56
by
阿杰onlive
[
Gromacs
]
catdcd合并轨迹问题
5
(1/696)
红豆,大红豆
2021-03-22
2021-03-22 16:11:27
by
wuke3210
[
Gromacs
]
求助
10
(0/381)
七七V
2021-03-19
2021-03-19 15:58:54
by
七七V
[
Gromacs
]
[已完结]
g_energy里面的一些能量项
(8/5079)
little_lion
2013-03-04
2021-03-19 15:15:38
by
七七V
[
Gromacs
]
请大家帮忙,谢谢大家!!!!!!!!
20
(3/986)
吧吧啦啦
2021-03-17
2021-03-18 09:12:03
by
吧吧啦啦
[
Gromacs
]
关于表面活性剂在气液界面的分子动力学模拟
(1/688)
WzyGoodluck
2021-03-04
2021-03-16 17:58:13
by
qalhkyrs
[
Gromacs
]
[已完结]
脚本文件如何自动输入参数
(4/1078)
tranquil1993
2015-10-31
2021-03-14 16:45:31
by
向海725
[
Gromacs
]
gromacs-5.1.4在Ubuntu 16.04LTS服务器GPU和CPU安装全过程
(
1
2
)
(11/3710)
jiaoyixiong
2017-11-30
2021-03-14 08:21:57
by
jiaoyixiong
[
Gromacs
]
高岭土gromacs动力学问题
5
(0/1384)
fightyin
2021-03-09
2021-03-09 15:36:29
by
fightyin
[
Gromacs
]
求电解液相关的分子动力学教学,有偿。
(20/765)
wwb1125
2021-03-06
2021-03-07 01:31:44
by
18018590138
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs tutorials 水中的甲烷自由能计算步骤?
(2/929)
搞科研的小蕾
2017-08-26
2021-03-05 16:45:28
by
gmx模拟
[
Gromacs
]
gromacs薄膜沉积
(0/427)
13三66
2021-03-04
2021-03-04 09:53:00
by
13三66
[
Gromacs
]
动力学模拟
(0/494)
zy杨
2021-03-03
2021-03-03 15:28:22
by
zy杨
[
Gromacs
]
amber
(2/1188)
zy杨
2021-03-01
2021-03-03 15:26:20
by
zy杨
[
Gromacs
]
[已完结]
求助! amber16用于跑aMD加速动力学时出现cudaMemcpy GPUBuff
(6/2943)
疯狂的鬼马
2017-04-21
2021-01-30 08:35:33
by
盐糖少许
[
Gromacs
]
[已完结]
VMD 中调用脚本出现 domain error 的问题怎么解决?
(2/2050)
zhaozhao123
2015-07-15
2021-01-14 12:05:17
by
Long_Ma
[
Gromacs
]
[已完结]
Gromacs编译错误求助
(2/1418)
ZZH927
2014-11-24
2020-12-26 18:13:53
by
yibaigui
[
Gromacs
]
招聘分子动力学模拟学生兼职
166
(0/876)
pan131726
2020-12-21
2020-12-21 18:36:22
by
pan131726
[
Gromacs
]
[已完结]
LJ参数的单位
(2/1487)
memgr
2012-01-16
2020-12-18 10:42:00
by
夜月魂
[
Gromacs
]
[已完结]
opls下L-J参数转换成amber下L-J参数的问题
(9/2981)
小白如水
2012-01-08
2020-12-18 08:38:39
by
夜月魂
[
Gromacs
]
[已完结]
genion中添加离子错误
(1/1079)
sour1993
2016-06-03
2020-12-15 13:30:50
by
landian666
[
Gromacs
]
Gromacs5.1安装教程 亲测无错全过程
(
1
2
)
(19/4225)
upc10131309
2016-11-03
2020-12-15 06:09:22
by
cqpopen
[
Gromacs
]
[已完结]
NAMD中NVT和NPT系综问题
(评阅+1)
(1/2756)
我爱问路
2014-07-27
2020-12-14 20:19:46
by
雪顶咖啡冰
[
Gromacs
]
gromacs多显卡运行
(2/1181)
Yolanda9288
2020-12-04
2020-12-04 20:13:11
by
Yolanda9288
[
Gromacs
]
GROMACS
5
(0/590)
星期天下雨
2020-11-27
2020-11-27 16:56:20
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星期天下雨
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mermaid1128
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moye1991
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七七V
2020-11-09
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2017-05-10
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王小宁8888
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2020-10-30
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2020-10-16
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NAMD/lambda-REMD segmentation fault/ Desmond ligand mutation fep
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yibaigui
2020-10-26
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