| 查看: 3085 | 回复: 12 | ||
haiyanqian木虫 (小有名气)
|
[求助]
对接的分子用于分子动力学模拟的问题已有2人参与
|
|
| 我想请问一下大家，就是在用Amber进行分子动力学模拟的时候，对于没有晶体结构的分子，通过分子对接的方法将配体对接进去。然后用于动力学的模拟，比如说我进行了10ns 的分子动力学模拟，我后面取出最后的小分子构象，与最初的小分子对接的构象进行叠合，发现结构变化还是挺大的。我不知道这个结果是不是属于正常现象，跑完动力学的构象与之前得对接结果是会有差异的，还是说我最初的分子对接的构象就不合理呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
每次骚扰女学生的都是院系领导，而不是普通教师，小编们要注意措辞正确
已经有11人回复
-
希望今年自己国自然面上项目和老婆青年项目能中！
已经有7人回复
-
请问事业编制和年薪制冲突吗？
已经有7人回复
-
初始合伙人来啦！（生物试剂耗材标准品）
已经有12人回复
-
杭电、天津科技、青农和宁波工程学院如何选？
已经有21人回复
-
博后基金，博管会会提前知道消息吗？
已经有4人回复
-
编辑是什么意思
已经有3人回复
-
二审返修送审10天了，原来一审的3个审稿人只有2个接受了审稿，会邀请新审稿人么？
已经有5人回复
-
山东大学(青岛)“天然药物生物智造”课题组 招聘“博士后”(年薪20.4-55.6万元)
已经有8人回复
-
成都产品质量检测研究院
已经有9人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 分子动力学投稿咨询
已经有4人回复
- 初学者求助-分子对接 问题
已经有15人回复
- 请问，分子动力学模拟和分子力学模拟的区别是什么呢？
已经有7人回复
- 水分子的分子动力学模拟中水分子跑出盒子
已经有10人回复
- 膜蛋白的分子动力学
已经有8人回复
- 分子对接前，大分子的前处理
已经有10人回复
- 求助：分子动力学模拟和结合能计算
已经有9人回复
- 分子动力学模拟中的系综问题
已经有5人回复
- 分子动力学模拟完毕之后要怎么分析结果阿
已经有7人回复
- 如何用分子力学方法模拟
已经有8人回复
- [讨论交流] 分子动力学+分子对接=什么配置?
已经有3人回复
- 求助：蛋白质对接 分子动力学
已经有10人回复
- 如何做动力学模拟pdb文件
已经有4人回复
- 分子对接的免费软件？
已经有10人回复
- 请教分子力学与分子动力学的区别
已经有14人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- 【求助】MS如何实现水分子与SiO2反应的分子动力学模拟过程（想得到Si-OH键）？
已经有21人回复
- 【求助】分子动力学模拟尺度问题？
已经有11人回复
- 【讨论】分子对接的基本问题
已经有8人回复
- 【求助】关于用分子动力学来做光谱的问题
已经有14人回复
- 【求助】请教分子动力学模拟
已经有8人回复
- 【讨论】各种分子对接软件的速度和精度比较
已经有15人回复
haiyanqian
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2263
- 红花: 1
- 帖子: 93
- 在线: 39.9小时
- 虫号: 1347498
- 注册: 2011-07-16
- 专业: 合成药物化学
3楼2014-01-22 10:01:27
2楼2014-01-21 14:39:25
haiyanqian4楼2014-01-22 21:41:39
haiyanqian
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2263
- 红花: 1
- 帖子: 93
- 在线: 39.9小时
- 虫号: 1347498
- 注册: 2011-07-16
- 专业: 合成药物化学
5楼2014-01-22 22:00:01
|
本帖内容被屏蔽 |
6楼2014-01-22 22:10:55
|
本帖内容被屏蔽 |
7楼2014-01-22 22:11:23
haiyanqian
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2263
- 红花: 1
- 帖子: 93
- 在线: 39.9小时
- 虫号: 1347498
- 注册: 2011-07-16
- 专业: 合成药物化学
8楼2014-01-23 09:17:46
|
本帖内容被屏蔽 |
9楼2014-01-23 11:38:19
10楼2014-01-23 14:09:44
50