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haiyanqian木虫 (小有名气)
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对接的分子用于分子动力学模拟的问题 已有2人参与
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| 我想请问一下大家，就是在用Amber进行分子动力学模拟的时候，对于没有晶体结构的分子，通过分子对接的方法将配体对接进去。然后用于动力学的模拟，比如说我进行了10ns 的分子动力学模拟，我后面取出最后的小分子构象，与最初的小分子对接的构象进行叠合，发现结构变化还是挺大的。我不知道这个结果是不是属于正常现象，跑完动力学的构象与之前得对接结果是会有差异的，还是说我最初的分子对接的构象就不合理呢？ |
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haiyanqian
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