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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子动力学模拟完毕之后要怎么分析结果阿
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wangbl2012

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子动力学模拟完毕之后要怎么分析结果阿

本人现在做完分子模拟，就知道计算吸附能，其它的不懂要怎么分析，如何分析，希望有懂的大侠帮忙解决下问题吧，最好有分析步骤，谢谢！
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1楼 2012-05-09 15:57:30
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visualization

金虫 (小有名气)
能分析的东西很多，关键你要分析什么东西啊
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2楼2012-05-09 16:24:34
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dq20081935

铜虫 (小有名气)
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-05-10 14:19:51
你做的是哪方面的动力学模拟?做金属的和做高分子、陶瓷的分析内容肯定不同，版主最好说一下自己的研究方向，别人才好定向分析！
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3楼2012-05-09 18:40:13
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wangbl2012

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by dq20081935 at 2012-05-09 18:40:13:
你做的是哪方面的动力学模拟?做金属的和做高分子、陶瓷的分析内容肯定不同，版主最好说一下自己的研究方向，别人才好定向分析！

我做的是吗啡啉衍生物在Fe（001）表面的缓蚀性能评价，看到一篇文章分析了四个方面，第一是体系平衡分析、二是吸附能计算、三是径向分布函数计算、四是表面深度分布状况。可我只知道第二个，其它的不懂做
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4楼2012-05-10 11:05:42
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liuwei4410

金虫 (正式写手)
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-05-10 14:20:22
帮你顶一个！体系平衡分析是不是就是教程中对系统进行平衡后对系统的分析啊。
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一切都是浮云，开心最重要！
5楼2012-05-10 12:43:50
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dq20081935

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wangbl2012 at 2012-05-10 11:05:42:
我做的是吗啡啉衍生物在Fe（001）表面的缓蚀性能评价，看到一篇文章分析了四个方面，第一是体系平衡分析、二是吸附能计算、三是径向分布函数计算、四是表面深度分布状况。可我只知道第二个，其它的不懂做

径向分布函数可以在dynamic模块的analysiz /structure中得到。体系平衡分析是不是应该分析其在某一过程完后是否收敛呢？我不敢确定！至于第四个我从没接触过，无能为力了。
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6楼2012-05-10 15:13:30
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angeltong

木虫 (正式写手)
同求啊。。。
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7楼2015-11-14 15:10:21
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10133202

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
大神，您好！您模拟的体系做完分子动力学用了多长时间？您是如何判断模拟完成（系统达到平衡态）的呢？在没有算完NSW步骤的时候，系统如果达到平衡态，会提前停止吗？ 非常期待您的回复。
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8楼2017-09-11 15:45:25
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