| 查看: 1842 | 回复: 3 | |||
[交流]
【求助】分子动力学的溶剂化分析 已有2人参与
|
|
大家好！ 我在做蛋白质溶剂化的分子动力学，最初目的是考察不同溶剂对蛋白质结构的影响及它们之间的相互作用。只是不知道在Amber中，要转化成什么样的输出参数去考察，现在我只是分析了温度、动能、势能、RMSD等简单的参数，然后再分析氢键是将整个体系进行分析，出错，报错内存不够，请教大侠，由于计算机硬件暂时无法改变，只能靠减小体系来计算，有哪位大侠知道如何改动吗？有做过蛋白质溶剂化的研究的吗？一般都应分析哪些参数呢？或者大家谁看到过比较类似的文献呢？请大家不吝赐教！感激不尽！（因快毕业，问大家了一些比较笼统、依赖性的问题，还望包涵，不吝赐教） |
回复此楼» 猜你喜欢
2026国自然函评费到账
已经有17人回复
-
让我中一个面上吧！
已经有15人回复
-
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战
已经有5人回复
-
跳槽后在研项目怎么办？
已经有10人回复
-
什么时候开奖？
已经有10人回复
-
今天放榜吗？
已经有16人回复
-
93BebMhtakh前后11位开头都是大写
已经有8人回复
-
范进中举一文的中心思想
已经有4人回复
-
只有每年这种时候来逛逛小木虫
已经有26人回复
-
filecode，4个jtjc了
已经有16人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 【整理】今天整理硬盘上的资料，偶然发现的好玩的小东西就直接发上来吧
已经有106人回复
- 【求助】动力学模拟中溶剂的选择
已经有6人回复
- 【原创】从头建模和从头计算
已经有11人回复
- 【求助】discover模拟复合材料表面相互作用需要分析哪些
已经有6人回复
- 【在线答疑】关于NAMD/VMD
已经有210人回复
superdirac
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 4269.5
- 散金: 33
- 红花: 2
- 帖子: 536
- 在线: 287.5小时
- 虫号: 522969
- 注册: 2008-03-12
- 专业: 理论和计算化学
2楼2010-04-19 16:12:04
3楼2010-04-20 17:37:34
superdirac
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 4269.5
- 散金: 33
- 红花: 2
- 帖子: 536
- 在线: 287.5小时
- 虫号: 522969
- 注册: 2008-03-12
- 专业: 理论和计算化学
4楼2010-04-26 21:12:26
