24小时热门版块排行榜    

查看: 2429  |  回复: 14
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 baoer3808 的 3 个金币

baoer3808

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于用分子动力学来做光谱的问题已有2人参与

用分子动力学可以做晶体氧化物的红外和拉曼光谱吗?请大家给与指点,谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)


lei0736(金币+1):谢谢 2010-07-01 22:39:07
baoer3808(金币+1): 2010-07-02 09:04:39
可以,但较困难。相对之下大体上拉曼更难,红外稍易。
2楼2010-07-01 21:55:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-07-01 22:39:13
baoer3808(金币+1): 2010-07-02 09:04:45
如果只是简单地计算振动谱,那相对来说倒是更容易一些。
3楼2010-07-01 21:55:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baoer3808

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-07-01 21:55:58:
如果只是简单地计算振动谱,那相对来说倒是更容易一些。

老虎大王能不能再具体说一下,如果计算振动谱的方法有哪些?
4楼2010-07-02 10:24:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baoer3808

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-07-01 21:55:58:
如果只是简单地计算振动谱,那相对来说倒是更容易一些。

除了能用自相关函数来求,还有没有其他的方法?
5楼2010-07-02 10:25:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-07-02 14:54:12
MD计算振动谱,基本上就是自相关函数方法,然后傅氏变换。这是时域到频域变换的基本方法。这里面主要就是如何构造自相关函数。比如速度自相关,键长(键角)自相关等,它们都包含一定的物理意义。

另外可以考虑分子静态构型分析,构造G矩阵。参考Wilson的名著《分子振动-红外和拉曼振动光谱理论》
6楼2010-07-02 14:49:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baoer3808

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-07-02 14:49:52:
MD计算振动谱,基本上就是自相关函数方法,然后傅氏变换。这是时域到频域变换的基本方法。这里面主要就是如何构造自相关函数。比如速度自相关,键长(键角)自相关等,它们都包含一定的物理意义。

另外可以考虑 ...

谢谢,我找找看,我觉得红外是由分子的偶极矩变化引起的,拉曼是由极化率引起的,看了wilson在JCP上发表的关于双原子分子的两篇文献,对他所做的从轨迹文件中得出偶极矩和极化率一直困惑,不知道他是怎么做出来的···
7楼2010-07-02 20:10:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-07-02 22:58:17
偶极矩是容易的,因为知道点电荷。极化率相对困难不,但也不是得不出来。
8楼2010-07-02 20:18:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guohui_Hao

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-07-02 20:18:29:
偶极矩是容易的,因为知道点电荷。极化率相对困难不,但也不是得不出来。

我也计算红外光谱 利用Dmol 模块
得到分子在某状态下 各个原子沿X Y Z 轴的受力和 原子电荷,怎样计算此状态下分子的偶极矩 在X Y Z 的分量呢?

以水为例  我计算得到 H电荷0.331   O 为-0.662

某状态下  各个原子样X Y Z forces (来于.HESSWK)
                                 X                        Y                             Z
     H              0.002092607         0.000000000        -0.001295841
    O               -0.001924426         0.000000000        0.000963982
     H               -0.000168181         0.000000000        0.000331859
    偶极矩       0.000803486         0.000000000        -0.823618356

不知道第四行的偶极矩是怎么算呢
9楼2010-12-28 08:46:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)


zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-12-28 22:48:17
引用回帖:
Originally posted by guohui_Hao at 2010-12-28 08:46:22:


我也计算红外光谱 利用Dmol 模块
得到分子在某状态下 各个原子沿X Y Z 轴的受力和 原子电荷,怎样计算此状态下分子的偶极矩 在X Y Z 的分量呢?

以水为例  我计算得到 H电荷0.331   O 为-0.662

某状态 ...

Dmol我没有研究过,不知道它的具体实现方法。但是偶极矩,你查查它的定义就知道了,这个没有什么难算的。
10楼2010-12-28 09:25:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 baoer3808 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 这个博士要读吗 +14 Sea Breeze 2024-06-16 24/1200 2024-06-20 09:25 by QHJ100100
[精细化工] 切削液交流群 +4 SZ吴彦祖 2024-06-17 4/200 2024-06-20 09:22 by 洗铁路的阿姨
[催化] 镍负载氧化铝的保存问题 8+3 lwn0130 2024-06-15 6/300 2024-06-20 09:00 by lwn0130
[基金申请] 刚刚收到科研之友邮件 +14 olivermiaoer 2024-06-19 18/900 2024-06-20 08:33 by olivermiaoer
[论文投稿] 有化学投稿的期刊推荐吗 20+3 荣小撇 2024-06-13 4/200 2024-06-20 08:24 by 1975632963
[找工作] 药学硕士找不到工作,打算去做科研助理了 +9 pom戴墨镜 2024-06-14 22/1100 2024-06-20 05:47 by 投必得科研顾问
[考博] 2025年博士申请,可先做科研助理 +3 limit888 2024-06-18 6/300 2024-06-20 02:43 by limit888
[基金申请] 江南大学到瑞士招聘,称取消非升即走,改预聘+长聘 +21 babu2015 2024-06-18 22/1100 2024-06-19 23:03 by feng6531
[海外博后] 墨尔本大学博后offer要不要接 +3 kyxblmm 2024-06-18 3/150 2024-06-19 22:39 by blake1111
[考博] 34岁读博士晚吗 +39 emitdne 2024-06-13 39/1950 2024-06-19 19:03 by Dqtjs
[访问学者] 国家公派访问学者申请结果出了吗? +4 65syn 2024-06-13 4/200 2024-06-19 16:40 by 海洋之心168
[论文投稿] 求机械类四区sci推荐 5+4 迷茫小旷 2024-06-14 5/250 2024-06-19 14:08 by tangjie12345
[教师之家] 试用期辞职 +9 ZHONGWU_U 2024-06-18 14/700 2024-06-19 12:36 by ZHONGWU_U
[教师之家] 请问事业编制和年薪制冲突吗? +12 ZHONGWU_U 2024-06-14 12/600 2024-06-18 19:31 by fangyl2005
[基金申请] F口401需要啥文章水平 +3 lhjr123 2024-06-16 7/350 2024-06-18 16:05 by hon920603
[有机交流] 跑板能跑开,过柱过不纯怎么办 +4 小胡在努力 2024-06-18 6/300 2024-06-18 15:20 by long8811
[有机交流] 求教最后一步问题出在哪 20+3 苏州浩恒 2024-06-15 4/200 2024-06-18 08:33 by like_2005
[基金申请] 关于博后基金的bug问题 +6 lxr1991 2024-06-14 9/450 2024-06-15 21:17 by since—2010
[基金申请] 博士后基金需要结题吗? +8 zhouchuck 2024-06-13 8/400 2024-06-14 17:27 by liuyupu132
[考博] 申博找导师 +4 疏影横斜水清浅3 2024-06-13 6/300 2024-06-14 14:31 by zxl_1105
信息提示
请填处理意见