| 查看: 8971 | 回复: 18 | ||||
[交流]
【求助】请问VMD中氢键如何统计 已有8人参与
|
|
VMD虽然自带了氢键的分析，但是具体不知道如何操作 一些参数设置尤其是selection部分 另外我是导入的LAMMPS的DUMP文件，不是由VMD建模，不知道这个有没有影响 请教各位，谢谢。 --------- 补充，上传了dump文件，导入VMD后的图片如下  这是冰的结构，selection1部分填的name 2 1,按理说应该有的，但是氢键分析里找不到……  [ Last edited by Luv_XiaoMian on 2014-11-28 at 11:20 ] |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 298K.0.26Bar.dump
2014-11-28 11:17:09, 28.17 M
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子模拟 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
花儿微笑» 猜你喜欢
实验室接单子
已经有4人回复
-
全日制（定向）博士
已经有4人回复
-
假如你的研究生提出不合理要求
已经有6人回复
-
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
-
求助:我三月中下旬出站，青基依托单位怎么办？
已经有12人回复
-
不自信的我
已经有12人回复
-
所感
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有7人回复
-
北核录用
已经有3人回复
-
26申博（荧光探针方向，有机合成）
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- gromacs蛋白计算结束后老是跑出盒子
已经有19人回复
- 使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
已经有14人回复
- 水分子的分子动力学模拟中水分子跑出盒子
已经有10人回复
- 怎么观察一个蛋白质表面的疏水性
已经有7人回复
- 如何统计氢键的个数
已经有6人回复
- VMD 统计某个分子周围水分子数目随时间的变化
已经有9人回复
- 紧急求助，谁能帮我优化一个分子，关于氢键的
已经有12人回复
- 【求助】什么软件可以显示和统计蛋白质中氢键
已经有10人回复
- 【转帖】一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具
已经有109人回复
- 【请教】如何用diamond 计算一个点到一个平面的距离？
已经有4人回复
2楼2014-11-12 09:31:01
3楼2014-11-13 22:38:44
chuntao118
新虫 (著名写手)
- 应助: 93 (初中生)
- 金币: 2590.9
- 散金: 1402
- 红花: 25
- 帖子: 1611
- 在线: 241.2小时
- 虫号: 1791567
- 注册: 2012-05-02
- 专业: 计算数学与科学工程计算
4楼2014-11-14 16:30:14
gn02530640
银虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 314.5
- 红花: 1
- 帖子: 139
- 在线: 86.6小时
- 虫号: 2796302
- 注册: 2013-11-12
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2014-11-15 14:42:02
gn02530640
银虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 314.5
- 红花: 1
- 帖子: 139
- 在线: 86.6小时
- 虫号: 2796302
- 注册: 2013-11-12
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
6楼2014-11-15 14:49:33
7楼2014-11-19 22:09:27
8楼2014-11-26 10:24:00
gn02530640
银虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 314.5
- 红花: 1
- 帖子: 139
- 在线: 86.6小时
- 虫号: 2796302
- 注册: 2013-11-12
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
。 9楼2014-11-27 10:20:23
gn02530640
银虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 314.5
- 红花: 1
- 帖子: 139
- 在线: 86.6小时
- 虫号: 2796302
- 注册: 2013-11-12
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
10楼2014-11-27 10:23:46