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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】什么软件可以显示和统计蛋白质中氢键
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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chinayhb

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】什么软件可以显示和统计蛋白质中氢键 已有7人参与

各位高手：
       本人想显示和统计蛋白质分子（pdb文件格式）内的氢键，但不知道用哪个显示软件比较好，VMD好像不行，希望大侠给予指导。
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事非宜　勿轻诺　苟轻诺　进退错
1楼 2010-10-12 09:29:28
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ferlich

禁虫 (小有名气)
★
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-10-12 18:54:31
chinayhb(金币+5): 2010-10-13 08:49:32
本帖内容被屏蔽
2楼2010-10-12 17:57:35
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chinayhb

金虫 (正式写手)
这个是免费的吗？我没下到，你那有吗？给我传一个好吗？我的邮箱china0527yhb@163.com，谢谢
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事非宜　勿轻诺　苟轻诺　进退错
3楼2010-10-13 08:52:48
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chinayhb

金虫 (正式写手)

怎么用pymol显示和统计氢键

引用回帖:
Originally posted by ferlich at 2010-10-12 17:57:35:
pymol啊

我下载了pymol，可不知道怎么让显示氢键，最好是输出氢键文件
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事非宜　勿轻诺　苟轻诺　进退错
4楼2010-10-13 10:13:57
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chinayhb

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by ferlich at 2010-10-12 17:57:35:
pymol啊

能不能给我说说怎么用法
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事非宜　勿轻诺　苟轻诺　进退错
5楼2010-10-13 10:15:02
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bernies

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-10-29 13:52:05
VMD是可以的 有这个插件  可以选择哪两个部分之间的氢键  输出个数以及氢键类型及出现频率
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6楼2010-10-29 13:33:59
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nh13

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-10-29 16:38:49
用免费的accelrys ds visualizer就可以。一般的cadd软件都可以的。vida，ligandscout，sybyl，DS等等了。不过都是收费的。
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7楼2010-10-29 15:55:03
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xppcomeon

捐助贵宾 (正式写手)
下个pymol吧
还有教程，命令什么的写的听明白的
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8楼2010-10-29 17:23:02
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windness

金虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-11-01 09:38:00
sybyl可以，我用过
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9楼2010-10-29 20:38:25
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chenleihefei

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
内容已删除
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我就是我！
10楼2015-10-23 19:34:20
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