应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 怎么观察一个蛋白质表面的疏水性
81/1返回列表
查看: 5338  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lmzxcom1

金虫 (著名写手)

[求助] 怎么观察一个蛋白质表面的疏水性

小弟不才。。。
起因：目前有个蛋白结构，有一些实验数据表明在催化为点可能存在一个疏水区域
经过：试图用SYBYL和DS观察这个区域的疏水/亲水性，失败
结果：求助各位，我需要能观察那种有渐进过渡的疏水or亲水性表面，不要vmd那种单个氨基酸的疏水性。求助通过什么模块什么程序能达到这个目标？
ps：能够计算出疏水区域的大小或者占整个活性中心表面的比例呢？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

酶的资料

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-03-16 10:23:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lmzxcom1

金虫 (著名写手)
顶顶
回复此楼
2楼2013-03-16 18:38:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

倩430

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-03-18 15:25:53
lmzxcom1: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-03-19 10:22:48
chimera，免费的。而且做出来的既符合你的标准又恨漂亮。
赞一下 回复此楼
3楼2013-03-18 09:43:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)
亲，我也在做类似的分析，请问怎么样可以统计出蛋白表面亲疏水的残基呢？
赞一下 回复此楼
滴答
4楼2013-05-15 20:48:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyp0114

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
lmzxcom1: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢，这么久了还有好心人 2013-11-26 16:22:22
你试试http://model.nmr.ru/platinum/这个软件，希望对你有用
赞一下 回复此楼
5楼2013-11-25 16:18:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

teng_boo

铁虫 (初入文坛)
兄台，我也遇到了和你一样的问题，想要统计出蛋白质二级结构表面疏水区域。
不知道你的问题解决了没有？是怎么解决的？
跪谢。。。。。
赞一下 回复此楼
6楼2015-07-03 14:14:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

teng_boo

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wanglang1987 at 2013-05-15 20:48:42
亲，我也在做类似的分析，请问怎么样可以统计出蛋白表面亲疏水的残基呢？

兄台。。。我遇到了和你一样的问题，你找到解决方法了没？
可否告知在下，不甚感激。。。
赞一下 回复此楼
7楼2015-07-03 14:15:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

如惠而至

新虫 (小有名气)
初学者，也遇到了这样的问题，不知道怎么解决。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2018-08-30 14:51:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lmzxcom1 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿苏州大学材料工程（085601）专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +3 大火山小火山 2026-03-16 5/250 2026-03-16 16:54 by barlinike
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 321求调剂 +5 大米饭！ 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:33 by houyaoxu
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +6 ZyZy…… 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:38 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +3 miaodesi 2026-03-12 4/200 2026-03-13 20:53 by 18595523086
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 302求调剂 +6 负心者当诛 2026-03-11 6/300 2026-03-13 16:11 by JourneyLucky
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 26考研求调剂 +5 丶宏Sir 2026-03-13 5/250 2026-03-13 13:05 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
[基金申请] 提交后的基金本子，已让学校撤回了，可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭