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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 紧急求助，谁能帮我优化一个分子，关于氢键的
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)

[求助] 紧急求助，谁能帮我优化一个分子，关于氢键的

因为要考虑氢键的作用，需要用MP2/aug-cc-pvdz or aug-cc-pvtz,分子比较大，60多个原子，因为涉及到毕业需要的一篇文章，请大家帮忙，不胜感激

如果因为分子太大实现不了MP2，能用其他基组代替吗，用啥基组来算审稿人能够接受呢？请大家指点

[ Last edited by bingdieduwu on 2011-6-28 at 09:56 ]
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bingdieduwu bingdieduwu

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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
1楼2011-06-27 16:01:45
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bingdieduwu at 2011-06-27 16:01:45:
因为要考虑氢键的作用，需要用MP2/aug-cc-pvdz or aug-cc-pvtz,分子比较大，60多个原子，因为涉及到毕业需要的一篇文章，请大家帮忙，不胜感激
...

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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
2楼2011-06-28 09:57:43
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奔鲨

铁虫 (著名写手)
★
zhou2009(金币+1): 2011-06-28 11:28:30
有些高校比如贵州大学有个什么超级计算中心，也许不收费，你可以联系一下
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bingdieduwu
to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
3楼2011-06-28 10:31:43
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by 奔鲨 at 2011-06-28 10:31:43:
有些高校比如贵州大学有个什么超级计算中心，也许不收费，你可以联系一下

好，非常感谢您，O(∩_∩)O谢谢
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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
4楼2011-06-28 10:40:44
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dukelr

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

bingdieduwu(金币+4): 谢谢回帖 2011-06-28 18:42:14
贵州大学 不提供MP2的方法
MP2/AVDZ只优化的话可以试试 尽量把构型整的合理点
频率就算了 算不动
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5楼2011-06-28 18:15:17
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dukelr

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

bingdieduwu(金币+4): 谢谢回帖 2011-06-28 18:43:34
B3的话可以考虑用TZ做 也只是优化吧
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6楼2011-06-28 18:16:18
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by dukelr at 2011-06-28 18:15:17:
贵州大学 不提供MP2的方法
MP2/AVDZ只优化的话可以试试 尽量把构型整的合理点
频率就算了 算不动

非常感谢您，但是我需要算一下频率检验一下结构，那该怎么做呢？
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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
7楼2011-06-28 18:43:07
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by dukelr at 2011-06-28 18:16:18:
B3的话可以考虑用TZ做 也只是优化吧

非常感谢您，如果我还想做频率该怎么做呢
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8楼2011-06-28 18:44:26
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)

风雪

优秀版主优秀版主优秀版主文献杰出贡献优秀版主优秀版主优秀版主文献杰出贡献优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主文献杰出贡献优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

大家帮帮忙吧，比较急啊，顶起。如真的能算成功，重谢！
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9楼2011-06-28 20:07:15
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wzwanglab

至尊木虫 (职业作家)

皇帝

【答案】应助回帖

★ ★
bingdieduwu(金币+2): 非常感谢您，谢谢回帖 2011-06-28 21:03:34
gmy1990(金币+2): 2011-06-28 21:53:57
研究氢键以及其他类型的分子间弱相互作用，试试新发展的密度泛函方法，建议你试试M052X/6-311++G(d,p)方法。主要有两个原因：
1：MP2方法很多弱相互作用结果不可靠。你如果要计算频率就更不能用MP2方法了。而新发展的密度泛函方法已经远远超过MP2的精度。
2：重要的是这些新发展的密度泛函方法计算量远远低于MP2方法，个人电脑算一两百个原子都不成问题，你那个体系很容易解决。
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10楼2011-06-28 20:50:10
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