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haiyanqian

木虫 (小有名气)

[求助] 膜蛋白分子动力学模拟体系的构建

本人想做跨膜蛋白的分子动力学模拟,蛋白同源模建后嵌入磷脂双分子层模型中,然后用Amber跑分子动力学。我的跨膜蛋白属于GPCR家族的,起初我是找了个rhodopsin加好膜和水的体系,我的蛋白跟rhodopsin的叠合后,将我的蛋白merge进去,然后保留了原来的膜和水。现在有个问题就是水层,因为loop区不一样,所以水层保留rhodopsin的水层会不会有问题?还有如果这种方法不行的话,怎样对已经加好的膜只加水层呢?急急急!!!在线等,麻烦哪位大侠给指导一下,不甚感激~~~
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桃子小姐啊

禁虫 (初入文坛)

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2楼2018-08-07 01:07:11
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3楼2021-08-07 20:05:16
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