| 查看: 2356 | 回复: 2 | ||
haiyanqian木虫 (小有名气)
|
[求助]
膜蛋白分子动力学模拟体系的构建
|
| 本人想做跨膜蛋白的分子动力学模拟，蛋白同源模建后嵌入磷脂双分子层模型中，然后用Amber跑分子动力学。我的跨膜蛋白属于GPCR家族的，起初我是找了个rhodopsin加好膜和水的体系，我的蛋白跟rhodopsin的叠合后，将我的蛋白merge进去，然后保留了原来的膜和水。现在有个问题就是水层，因为loop区不一样，所以水层保留rhodopsin的水层会不会有问题？还有如果这种方法不行的话，怎样对已经加好的膜只加水层呢？急急急！！！在线等，麻烦哪位大侠给指导一下，不甚感激~~~ |
回复此楼» 猜你喜欢
参与限项
已经有3人回复
-
假如你的研究生提出不合理要求
已经有7人回复
-
实验室接单子
已经有4人回复
-
全日制（定向）博士
已经有4人回复
-
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
-
求助:我三月中下旬出站，青基依托单位怎么办？
已经有12人回复
-
不自信的我
已经有12人回复
-
所感
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有7人回复
-
北核录用
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请问我这个体系是否需要进行自由能的计算？？？
已经有4人回复
- 分子动力学模拟的时间、体系大小和温度的争议问题！！
已经有23人回复
- 加膜系统的蛋白动力学模拟
已经有5人回复
- 如何用pdb的格式的文件生成psf的格式的文件（无机非体系）
已经有6人回复
- 体系静电势能可以用什么软件计算
已经有16人回复
- 分子动力学模拟与VMD怎么结合
已经有3人回复
- MS模拟体系中水分子数目应该怎样设置？
已经有9人回复
- 有没有人用Amber做过膜蛋白动力学模拟
已经有14人回复
- 磷脂双分子层模型怎么建立？
已经有4人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- 分子动力学模拟投什么杂志好
已经有6人回复
- 【求助】分子动力学中体系温度不断增加?
已经有16人回复
- 【求助】amber功能探讨
已经有9人回复
- 【共享】推荐一篇关于膜蛋白动力学的综述
已经有7人回复
|
本帖内容被屏蔽 |
2楼2018-08-07 01:07:11
|
本帖内容被屏蔽 |
3楼2021-08-07 20:05:16